為探究鴨腸炎病毒（Duck enteritis virus,DEV）感染對鴨十二指腸黏膜組織不同時間段相關免疫基因的變化影響,采用DEV接種30日齡的健康櫻桃谷鴨,在感染后72 h、96 h和120 h采集十二指腸,使用BGISEQ-500平臺對3個試驗組和對照組十二指腸組織測序,并篩選差異表達基因,用GO和KEGG數(shù)據(jù)庫進行分析。結果顯示,T72、T96和T120分別篩選出798、1 389和1 329差異表達基因;GO功能注釋顯示,差異基因主要參與到細胞因子活性、受體結合、細胞外基質、免疫系統(tǒng)過程、防御反應、鈣離子結合、受體調節(jié)活性、受體配體活性、鈉∶氨基酸轉運體活性等;KEGG通路富集結果顯示,差異表達基因主要涉及在細胞因子-細胞因子受體相互作用、NOD樣受體信號通路、RIG-I樣受體信號通路,抗原加工和呈遞、Toll樣受體信號通路、ECM-受體相互作用、PI3K-Akt信號通路、細胞溶質DNA傳感途徑、RIG-I樣受體信號通路蛋白質消化吸收、細胞黏附分子（CAMs）、細胞色素P450對異生素的代謝、類固醇激素生物合成、PPAR信號通路Toll樣受體信號通路、補體和凝血級聯(lián)、IL... 

【文章來源】：動物醫(yī)學進展. 2020,41(10)北大核心

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

差異基因GO富集柱狀圖

差異基因KEGG Pathway富集柱狀圖

圖2 差異基因KEGG Pathway富集柱狀圖T72、T96和T120篩選分別篩選出798、1 389和1 329個差異基因,將差異基因對比到GO和KEGG數(shù)據(jù)庫,發(fā)現(xiàn)與病毒的復制和擴散及機體抵制病毒感染相關。表明在感染72 h和96 h,參與抵制DEV差異基因逐漸增多,這可能是因為病毒在機體內快速增殖,腸道基因調控更多基因抵制DEV,宿主與DEV的平衡還沒有打破,機體還處于對峙時期。在感染120 h,DEV在體內大量復制擴散打破了兩者之間的平衡,產(chǎn)生病理損傷和免疫抑制。

【參考文獻】：
期刊論文
[1]鴨瘟診斷方法研究進展[J]. 肖瑞琪,汪銘書.  動物醫(yī)學進展. 2019(09)
[2]基于高通量測序技術分析番鴨呼腸孤病毒感染雛番鴨腸道轉錄組學的變化[J]. 李鴻文,黃詩杭,駱鈺,吳曉平,王全溪,李健,黃一帆,吳異健.  病毒學報. 2019(02)
[3]鴨腸炎病毒感染鴨脾臟的轉錄組分析[J]. 吳良濤,鄭敏,華敏,萬潤,程振濤,周碧君,文明.  病毒學報. 2017(03)
[4]轉錄組測序及其在藥用植物上的應用[J]. 趙振宇,王仕玉,郭鳳根,尹冬梅,朱旭海,杜玉霞.  基因組學與應用生物學. 2017(02)
[5]七星瓢蟲滯育關聯(lián)基因的轉錄組學分析[J]. 齊曉陽,任小云,安濤,陳紅印,黃建,張禮生.  環(huán)境昆蟲學報. 2016(02)
[6]新一代測序技術在植物轉錄組研究中的應用[J]. 梁燁,陳雙燕,劉公社.  遺傳. 2011(12)

博士論文
[1]高通量RNA-seq測序數(shù)據(jù)的基因表達水平分析研究[D]. 張禮.南京航空航天大學 2016
[2]鞘脂與PPAR相互作用及其對癌細胞凋亡調控的影響[D]. 王靜.中國農(nóng)業(yè)大學 2004

碩士論文
[1]基于RNA-Seq的DHAV-1感染雛鴨的組織轉錄組分析[D]. 張清瑞.華中農(nóng)業(yè)大學 2013



本文編號：3345737