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畜禽糞便中常見(jiàn)致病菌現(xiàn)場(chǎng)快速一體化檢測(cè)方法研究

發(fā)布時(shí)間:2021-08-13 23:27
  隨著集約化畜禽養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展,畜禽養(yǎng)殖糞便的產(chǎn)生量也隨之增加。畜禽糞便的不合理處理與處置對(duì)水、空氣和土壤均會(huì)造成一定程度的污染,尤其是畜禽糞便中的致病微生物可能會(huì)造成人畜共患病的傳播,不僅阻礙畜禽養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展,而且危害人們的健康,甚至引起公共衛(wèi)生事故。因此,掌握畜禽養(yǎng)殖糞便中典型微生物的污染現(xiàn)狀及規(guī)律,并建立一套可操作性強(qiáng)、結(jié)果判定方便的現(xiàn)場(chǎng)快速一體化檢測(cè)方法是非常有必要的。本研究根據(jù)畜禽養(yǎng)殖場(chǎng)現(xiàn)場(chǎng)條件的特點(diǎn),借助載正電荷材料對(duì)細(xì)菌高效富集和環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(LAMP)技術(shù)快速檢測(cè)的特性,建立起增菌-富集-LAMP檢測(cè)一體化的糞便中常見(jiàn)致病菌現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè)體系,同時(shí)利用固定酶底物法和PCR技術(shù)對(duì)天津市3個(gè)畜禽種類的9家養(yǎng)殖場(chǎng)糞便中的指示微生物(總大腸菌群、糞大腸菌群、大腸埃希氏菌)和致病微生物(沙門(mén)氏菌)進(jìn)行現(xiàn)場(chǎng)調(diào)查。主要研究結(jié)果如下:(1)畜禽糞便種類不同,其指示微生物的數(shù)量存在顯著差異,未經(jīng)無(wú)害化處理的豬糞、雞糞、牛糞中指示微生物數(shù)量范圍分別為107~109 MPN·g-1、106~10

【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁(yè)數(shù)】:69 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

畜禽糞便中常見(jiàn)致病菌現(xiàn)場(chǎng)快速一體化檢測(cè)方法研究


目的序列上6個(gè)特異區(qū)域及引物設(shè)計(jì)

區(qū)段,引物,環(huán)狀,堿基


中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第一章緒論5合酶的作用下由3’端向5’端進(jìn)行配對(duì)延伸,形成與模板互補(bǔ)的新鏈,如圖1-2(李陽(yáng),2018)。圖1-2LAMP擴(kuò)增第一步Fig.1-2ThefirststepofLAMP第二步:外引物F3與模板DNA鏈外側(cè)的F3c區(qū)域堿基互補(bǔ)結(jié)合,在BstDNA聚合酶的作用下以F3引物的3’端為起點(diǎn)繼續(xù)向下配對(duì)延伸,合成新的DNA鏈,與此同時(shí)在第一步以FIP引物合成的DNA互補(bǔ)單鏈被置換下來(lái),如圖1-3(李陽(yáng),2018)。圖1-3LAMP擴(kuò)增第二步Fig.1-3ThesecondstepofLAMP第三步:在第二步中被新合成的DNA鏈置換下來(lái)的單鏈DNA的5’端由F1c、F2、F1三段組成,在單鏈狀態(tài)下,F(xiàn)1c區(qū)段和F1區(qū)段會(huì)進(jìn)行自我堿基配對(duì)由此形成環(huán)狀結(jié)構(gòu)。與此同時(shí),內(nèi)引物BIP的B2區(qū)段與B2c區(qū)段結(jié)合,以B2的3’端為起點(diǎn)開(kāi)始合成單鏈的互補(bǔ)鏈,在合成的過(guò)程中環(huán)狀結(jié)構(gòu)被打開(kāi);隨后,外引物B3與DNA模板鏈上的B3c區(qū)域堿基互補(bǔ)并繼續(xù)向下延伸形成新的雙鏈,同時(shí)置換出BIP合成的DNA單鏈,該鏈的兩端均發(fā)生自我堿基配對(duì),形成啞鈴狀鏈結(jié)構(gòu),如圖1-4(李陽(yáng),2018)。

區(qū)段,引物,環(huán)狀,堿基


中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第一章緒論5合酶的作用下由3’端向5’端進(jìn)行配對(duì)延伸,形成與模板互補(bǔ)的新鏈,如圖1-2(李陽(yáng),2018)。圖1-2LAMP擴(kuò)增第一步Fig.1-2ThefirststepofLAMP第二步:外引物F3與模板DNA鏈外側(cè)的F3c區(qū)域堿基互補(bǔ)結(jié)合,在BstDNA聚合酶的作用下以F3引物的3’端為起點(diǎn)繼續(xù)向下配對(duì)延伸,合成新的DNA鏈,與此同時(shí)在第一步以FIP引物合成的DNA互補(bǔ)單鏈被置換下來(lái),如圖1-3(李陽(yáng),2018)。圖1-3LAMP擴(kuò)增第二步Fig.1-3ThesecondstepofLAMP第三步:在第二步中被新合成的DNA鏈置換下來(lái)的單鏈DNA的5’端由F1c、F2、F1三段組成,在單鏈狀態(tài)下,F(xiàn)1c區(qū)段和F1區(qū)段會(huì)進(jìn)行自我堿基配對(duì)由此形成環(huán)狀結(jié)構(gòu)。與此同時(shí),內(nèi)引物BIP的B2區(qū)段與B2c區(qū)段結(jié)合,以B2的3’端為起點(diǎn)開(kāi)始合成單鏈的互補(bǔ)鏈,在合成的過(guò)程中環(huán)狀結(jié)構(gòu)被打開(kāi);隨后,外引物B3與DNA模板鏈上的B3c區(qū)域堿基互補(bǔ)并繼續(xù)向下延伸形成新的雙鏈,同時(shí)置換出BIP合成的DNA單鏈,該鏈的兩端均發(fā)生自我堿基配對(duì),形成啞鈴狀鏈結(jié)構(gòu),如圖1-4(李陽(yáng),2018)。


本文編號(hào):3341325

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