山羊胎盤中DNA甲基化與YY1共同抑制PHLDA2基因表達
發(fā)布時間:2021-08-12 20:35
山羊是最早被人類馴化的家畜之一。在茫茫的歷史長河中,山羊的養(yǎng)殖記錄可追溯到中國的夏商時代。經(jīng)過勞動人民幾千年的精心選擇和繁育,中國已經(jīng)成為世界上山羊品種和資源最為豐富的國家之一。山羊肉不僅是一種健康的食材,同時也是一種中藥材。它不僅營養(yǎng)豐富,滋補功效出色,同時還能預(yù)防和緩解多種常見疾病。2019年,全國的豬牛羊禽肉產(chǎn)量相比上年減少了10.2%,但山羊肉的產(chǎn)量卻增長了2.6%,這些數(shù)據(jù)表明山羊肉受到越來越多中國人的青睞,人們對于山羊肉的需求量也越來越大。但由于山羊繁殖率偏低導(dǎo)致其規(guī)模化養(yǎng)殖受限。因此,增強山羊繁殖率是目前畜牧業(yè)的重要課題之一。研究發(fā)現(xiàn),胎盤是母體與胚胎之間氧氣運輸與營養(yǎng)供給的重要媒介,對于胎兒的生長發(fā)育至關(guān)重要,并且能夠直接影響到出生后胎兒的存活率,是影響動物繁殖性能的重要因素之一。PHLDA2(pleckstrin homology-like domain,family A,member 2,又稱為IPL或TSSC3),是一個僅在胚胎或成體胚胎外母系等位基因表達的父源印跡基因,具有調(diào)節(jié)細胞信號、胞內(nèi)運輸?shù)裙δ�。研究結(jié)果顯示,在PHLDA2基因功能缺失的胚胎中,胎盤不僅會...
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
山羊胎盤不同妊娠時期PHLDA2基因表達量
結(jié)果與分析4.2山羊PHLDA2基因啟動子活性分析4.2.1山羊啟動子上游分析為了分析山羊PHLDA2基因啟動子5’區(qū)域?qū)ζ涞恼{(diào)控表達,通過軟件MethylPrimerExpressv1.0預(yù)測到從-631到+379bp范圍內(nèi)存在著CpG島(islandsize>100,GCPercent>50.0,Obs/Exp>0.6),說明啟動子區(qū)域甲基化與PHLDA2基因可能存在相關(guān)性,可對此進行分析。同時通過http://jaspar.genereg.net/在線分析,發(fā)現(xiàn)在PHLDA2基因在啟動子上游+20到-1842bp范圍沒有預(yù)測到CAAT和TATA框,但檢測到nuclearfactorI-C(NIFC),thetranscriptionfactorETSproto-oncogene1(ETS1),arylhydrocarbonreceptor(AHR)andYing-yang1(YY1)等多個轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點。(圖4-3)預(yù)測到轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點用紅色斜體表示Potentialtranscriptionfactorbindingsitesareindicatedinreditalicletters.圖4-3山羊PHLDA2啟動子區(qū)域CpG島以及轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點預(yù)測Fig4-3PredicationofCpGisland(a)andtranscriptionfactorbindingsites(b)in5’flankingregionofgoatPHLDA2gene.32
結(jié)果與分析420bp到-1023bp啟動子活性顯著增加;使用在線軟件jaspar分析發(fā)現(xiàn),在這個區(qū)域預(yù)測到可能存在的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點,分別是兩個YY1(分別命名為YY1-a和YY1-b),兩個ETS1(分別命名為ETS1-a和ETS1-b)還有NFIC和AHR。(圖4-5)圖4-5PHLDA2基因5’缺失載體啟動子雙熒光素酶活性載體活性分析Fig4-5TherelativeluciferaseactivityofPHLDA2genepromotor5’deletionseriesreconstructions4.3山羊不同妊娠時期胎盤PHLDA2基因啟動子甲基分析4.3.1PHLDA2基因啟動子亞硫酸氫測序為了研究不同妊娠時期胎盤啟動子區(qū)域CpG島甲基化變化,使用軟件MethylPrimerExpressv1.0設(shè)計亞硫酸氫鹽測序引物,擴增區(qū)域位于-574到-225bp,共包括22個CpG位點,共349bp。使用在線QUMA(http://quma.cdb.riken.jp/)軟件分析,得到不同山羊妊娠時期胎盤DNA甲基化狀態(tài)如圖4-6,統(tǒng)計得到不同妊娠時期山羊胎盤PHLDA2基因啟動子區(qū)域CpG島,不同妊娠時期甲基化如圖4-7:30天(39.3%)、45天(19.6%)、60天(18.1%%)、90天(14.7%)。在妊娠45天時,山羊胎盤組織PHLDA2啟動子區(qū)域CpG島甲基化突然降低,而后隨著妊娠時間增加緩慢下降。34
【參考文獻】:
期刊論文
[1]組蛋白去乙�;概c肝細胞癌的研究進展[J]. 朱博蘭,張裕,楊曉娟,呂寧芳,任瑞強,于曉輝. 華南國防醫(yī)學(xué)雜志. 2019(12)
[2]啟動子結(jié)構(gòu)、功能預(yù)測和驗證方法的研究進展[J]. 曾曉玲,趙昶靈,文國松,丁燦,張洪玲,徐率,古朝山. 分子植物育種. 2018(12)
[3]DNA甲基化檢測中亞硫酸氫鹽修飾方法的改進與評價[J]. 葉松山,劉先娟,侯俊然,毛秉豫,邱耕. 中國實驗血液學(xué)雜志. 2016(02)
[4]印記基因:發(fā)育中的重要調(diào)節(jié)因子[J]. 吳瑜,馮旭,高嵐,焦保衛(wèi). 遺傳. 2016(06)
[5]大足黑山羊PHLDA2基因的克隆、組織表達與印記狀況分析[J]. 蘇魯方,彭學(xué)強,蔣曹德. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(02)
[6]我國肉羊業(yè)現(xiàn)狀及發(fā)展對策[J]. 張莉,杜立新,李捷. 草食家畜. 2014(03)
[7]染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)的應(yīng)用和研究進展[J]. 李玲,楊鵬躍,朱本忠,傅達奇,田慧琴,羅云波. 中國食品學(xué)報. 2012(06)
[8]大足黑山羊種質(zhì)特性[J]. 趙中權(quán),張家驊,李周權(quán),王賢海,陳長庚,徐恢仲. 中國畜牧雜志. 2008(15)
[9]染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)在研究DNA與蛋白質(zhì)相互作用中的應(yīng)用[J]. 王春雨,石建黨,朱彥,張琚. 遺傳. 2005(05)
[10]表觀遺傳學(xué)的相關(guān)概念和研究進展[J]. 董玉瑋,侯進慧,朱必才,李培青,龐永紅. 生物學(xué)雜志. 2005(01)
碩士論文
[1]大足黑山羊PHLDA2基因克隆、定位、組織表達、印記狀況和甲基化分析[D]. 蘇魯方.西南大學(xué) 2014
本文編號:3339030
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
山羊胎盤不同妊娠時期PHLDA2基因表達量
結(jié)果與分析4.2山羊PHLDA2基因啟動子活性分析4.2.1山羊啟動子上游分析為了分析山羊PHLDA2基因啟動子5’區(qū)域?qū)ζ涞恼{(diào)控表達,通過軟件MethylPrimerExpressv1.0預(yù)測到從-631到+379bp范圍內(nèi)存在著CpG島(islandsize>100,GCPercent>50.0,Obs/Exp>0.6),說明啟動子區(qū)域甲基化與PHLDA2基因可能存在相關(guān)性,可對此進行分析。同時通過http://jaspar.genereg.net/在線分析,發(fā)現(xiàn)在PHLDA2基因在啟動子上游+20到-1842bp范圍沒有預(yù)測到CAAT和TATA框,但檢測到nuclearfactorI-C(NIFC),thetranscriptionfactorETSproto-oncogene1(ETS1),arylhydrocarbonreceptor(AHR)andYing-yang1(YY1)等多個轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點。(圖4-3)預(yù)測到轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點用紅色斜體表示Potentialtranscriptionfactorbindingsitesareindicatedinreditalicletters.圖4-3山羊PHLDA2啟動子區(qū)域CpG島以及轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點預(yù)測Fig4-3PredicationofCpGisland(a)andtranscriptionfactorbindingsites(b)in5’flankingregionofgoatPHLDA2gene.32
結(jié)果與分析420bp到-1023bp啟動子活性顯著增加;使用在線軟件jaspar分析發(fā)現(xiàn),在這個區(qū)域預(yù)測到可能存在的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點,分別是兩個YY1(分別命名為YY1-a和YY1-b),兩個ETS1(分別命名為ETS1-a和ETS1-b)還有NFIC和AHR。(圖4-5)圖4-5PHLDA2基因5’缺失載體啟動子雙熒光素酶活性載體活性分析Fig4-5TherelativeluciferaseactivityofPHLDA2genepromotor5’deletionseriesreconstructions4.3山羊不同妊娠時期胎盤PHLDA2基因啟動子甲基分析4.3.1PHLDA2基因啟動子亞硫酸氫測序為了研究不同妊娠時期胎盤啟動子區(qū)域CpG島甲基化變化,使用軟件MethylPrimerExpressv1.0設(shè)計亞硫酸氫鹽測序引物,擴增區(qū)域位于-574到-225bp,共包括22個CpG位點,共349bp。使用在線QUMA(http://quma.cdb.riken.jp/)軟件分析,得到不同山羊妊娠時期胎盤DNA甲基化狀態(tài)如圖4-6,統(tǒng)計得到不同妊娠時期山羊胎盤PHLDA2基因啟動子區(qū)域CpG島,不同妊娠時期甲基化如圖4-7:30天(39.3%)、45天(19.6%)、60天(18.1%%)、90天(14.7%)。在妊娠45天時,山羊胎盤組織PHLDA2啟動子區(qū)域CpG島甲基化突然降低,而后隨著妊娠時間增加緩慢下降。34
【參考文獻】:
期刊論文
[1]組蛋白去乙�;概c肝細胞癌的研究進展[J]. 朱博蘭,張裕,楊曉娟,呂寧芳,任瑞強,于曉輝. 華南國防醫(yī)學(xué)雜志. 2019(12)
[2]啟動子結(jié)構(gòu)、功能預(yù)測和驗證方法的研究進展[J]. 曾曉玲,趙昶靈,文國松,丁燦,張洪玲,徐率,古朝山. 分子植物育種. 2018(12)
[3]DNA甲基化檢測中亞硫酸氫鹽修飾方法的改進與評價[J]. 葉松山,劉先娟,侯俊然,毛秉豫,邱耕. 中國實驗血液學(xué)雜志. 2016(02)
[4]印記基因:發(fā)育中的重要調(diào)節(jié)因子[J]. 吳瑜,馮旭,高嵐,焦保衛(wèi). 遺傳. 2016(06)
[5]大足黑山羊PHLDA2基因的克隆、組織表達與印記狀況分析[J]. 蘇魯方,彭學(xué)強,蔣曹德. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(02)
[6]我國肉羊業(yè)現(xiàn)狀及發(fā)展對策[J]. 張莉,杜立新,李捷. 草食家畜. 2014(03)
[7]染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)的應(yīng)用和研究進展[J]. 李玲,楊鵬躍,朱本忠,傅達奇,田慧琴,羅云波. 中國食品學(xué)報. 2012(06)
[8]大足黑山羊種質(zhì)特性[J]. 趙中權(quán),張家驊,李周權(quán),王賢海,陳長庚,徐恢仲. 中國畜牧雜志. 2008(15)
[9]染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)在研究DNA與蛋白質(zhì)相互作用中的應(yīng)用[J]. 王春雨,石建黨,朱彥,張琚. 遺傳. 2005(05)
[10]表觀遺傳學(xué)的相關(guān)概念和研究進展[J]. 董玉瑋,侯進慧,朱必才,李培青,龐永紅. 生物學(xué)雜志. 2005(01)
碩士論文
[1]大足黑山羊PHLDA2基因克隆、定位、組織表達、印記狀況和甲基化分析[D]. 蘇魯方.西南大學(xué) 2014
本文編號:3339030
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