寧夏荷斯坦青年母牛全基因組選擇與BLUP選種效果分析
發(fā)布時間:2021-08-12 18:06
本研究以寧夏地區(qū)荷斯坦青年母牛為研究對象,利用全基因組選擇的方法,對五批次2511頭青年母牛進行育種值計算;選擇參加全基因組測定的989頭青年母牛的產(chǎn)奶的四個性狀(305d產(chǎn)奶量,乳脂率,乳蛋白以及體細胞評分)數(shù)據(jù),利用BLUP法對其進行了遺傳評估,通過秩相關對全基因組和BLUP法的計算結果進行相關性分析,及兩種方法遺傳進展的對比。結果表明:寧夏地區(qū)荷斯坦青年母牛五批基因組選擇奶牛GCPI均值從第一批的283.32上升到第五批910.46,呈逐批上升的趨勢,其中,產(chǎn)奶量的基因組育種值均值最大的是第四批為576.54;乳脂率、乳蛋白、乳房、肢蹄和體型基因組育種值均值都為第五批為最大值;體細胞評分基因組育種值均值五批次呈現(xiàn)逐漸下降的趨勢,第四、五批均值最小,為3.00。七個性狀五批次的基因組育種值估計準確性的均值在0.44到0.75之間,其中最大的為第四批泌乳系統(tǒng)的估計準確性為0.75,最小的為第三批體細胞評分的估計準確性為0.44。最終選取989頭奶牛多胎次產(chǎn)奶數(shù)據(jù)的四個性狀運用DMU軟件進行計算,得到育種值與估計準確性均低于基因組選擇數(shù)據(jù)。根據(jù)育種值與其他遺傳參數(shù)計算得到CPI2指數(shù),...
【文章來源】:寧夏大學寧夏回族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1技術路線??Figure?2-1?Technical?route??12??
高通量測序法進行測序,標記SNP的基因型,再進行統(tǒng)計分析,然后再根據(jù)測得的候選個體??芯片的標記信息,結合GS技術平臺的每個標記的效應值,最終計算出候選個體的性狀基因??組育種(GEBV),如圖2-2所示。??|?DNA高通置測序|??基因組肓種ii ̄|<?^統(tǒng)計分析卜('?|??^?.7?’??圖2-2青年母;蚪M選擇過程圖??Figure?2-2?Genome?selection?process?map?of?heifer??本研宂借助中國荷斯坦牛GS技術平臺進行估計標記效應,該技術平臺是中國農業(yè)大??學張沅教授和張勤教授課題組率先在提出,并在國內開展了基因組選擇的理論和方法研宄,??掌握了關鍵技術,建立了高密度SNP效應估計和基因組育種計算分析平臺,同時由本課題??組提出育種值估計的TABLUP方法,并組建了中國荷斯坦牛參考群體。通過該參考群體可??15??
性狀的基因組育種值和估計準確性,根據(jù)各性狀的基因組育種值計算得到GCPI指數(shù)。??分別對五批次基因組選擇的青年母牛GCPI指數(shù)和各性狀的基因組育種值結果進行對??比,通過表3-7和圖3-1可以看出,GCPI值逐漸升高,最高的是第五批為910.46;產(chǎn)奶量??基因組育種值均值最高的是第四批為576.54;乳脂率基因組育種值均值在第四、第五批次??提升為正數(shù),最高值為第五批的0.09;乳蛋白率、乳房和肢蹄評分的基因組育種值均值最高??28??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2017年奶牛產(chǎn)業(yè)技術發(fā)展報告[J]. 李勝利,姚琨,曹志軍,劉長全,張勝利,劉建新,李建喜,王加啟,張和平. 中國畜牧雜志. 2018(03)
[2]寧夏地區(qū)青年荷斯坦母;蚪M育種值分析[J]. 田佳,李委奇,劉麗元,邵懷峰,脫征軍,張偉新,王琨,溫萬. 中國奶牛. 2018(02)
[3]動物遺傳育種學科百年發(fā)展歷程與研究前沿[J]. 楊寧,姜力. 農學學報. 2018(01)
[4]關于寧夏規(guī)模奶牛養(yǎng)殖模式的探討[J]. 丑天才,楊波. 中國畜牧獸醫(yī)文摘. 2017(08)
[5]DMU、GBS和Herdsman 3個軟件育種值估計的比較[J]. 張越,楊宇澤,張金鑫,張鎖宇,邱小田,唐韶青,丁向東. 中國畜牧雜志. 2017(07)
[6]寧夏地區(qū)荷斯坦奶牛遺傳參數(shù)估計[J]. 李欣,周靖航,溫萬,邵懷峰,脫征軍,田佳,馬金香,顧亞玲. 中國畜牧獸醫(yī). 2017(06)
[7]用隨機回歸模型估計寧夏地區(qū)荷斯坦牛頭胎測定日產(chǎn)奶量遺傳參數(shù)[J]. 任小麗,劉澳星,李想,張旭,王雅春,邵懷峰,秦春華,王瑜,溫萬,張勝利. 中國農業(yè)科學. 2017(10)
[8]家畜基因組選擇研究進展[J]. 李宏偉,王瑞軍,王志英,李學武,王振宇,張燕軍,蘇蕊,劉志紅,李金泉. 遺傳. 2017(05)
[9]2016年奶牛產(chǎn)業(yè)技術發(fā)展報告[J]. 李勝利,姚琨,曹志軍,劉長全,張勝利,劉建新,李建喜,王加啟,張和平. 中國畜牧雜志. 2017(01)
[10]加速優(yōu)秀基因傳遞 開辟動物遺傳育種新時代[J]. 方美英,劉劍鋒,張勤,吳常信. 中國農村科技. 2016(06)
碩士論文
[1]應用隨機回歸測定日模型估計山東地區(qū)荷斯坦奶牛生產(chǎn)性狀遺傳參數(shù)[D]. 呂灣.河北工程大學 2019
[2]寧夏地區(qū)荷斯坦牛遺傳評估及選擇指數(shù)構建[D]. 李欣.寧夏大學 2017
[3]中國肉用西門塔爾牛育種目標的選擇及優(yōu)化育種規(guī)劃的研究[D]. 薛景龍.吉林農業(yè)大學 2016
[4]武漢地區(qū)荷斯坦奶牛產(chǎn)奶和繁殖性狀遺傳分析[D]. 趙占龍.華中農業(yè)大學 2015
[5]基于加性顯性模型的基因組選擇應用于西門塔爾牛的初步研究[D]. 王延暉.中國農業(yè)科學院 2014
[6]全球增暖背景下中國四季的劃分及與夏季降水的關系[D]. 張世軒.蘭州大學 2013
[7]西門塔爾牛部分屠宰和肉質性狀基因組選擇初步研究[D]. 朱淼.中國農業(yè)科學院 2013
[8]缺失數(shù)據(jù)對內蒙古絨山羊估計育種值準確性的影響[D]. 梁永厚.內蒙古農業(yè)大學 2007
本文編號:3338810
【文章來源】:寧夏大學寧夏回族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1技術路線??Figure?2-1?Technical?route??12??
高通量測序法進行測序,標記SNP的基因型,再進行統(tǒng)計分析,然后再根據(jù)測得的候選個體??芯片的標記信息,結合GS技術平臺的每個標記的效應值,最終計算出候選個體的性狀基因??組育種(GEBV),如圖2-2所示。??|?DNA高通置測序|??基因組肓種ii ̄|<?^統(tǒng)計分析卜('?|??^?.7?’??圖2-2青年母;蚪M選擇過程圖??Figure?2-2?Genome?selection?process?map?of?heifer??本研宂借助中國荷斯坦牛GS技術平臺進行估計標記效應,該技術平臺是中國農業(yè)大??學張沅教授和張勤教授課題組率先在提出,并在國內開展了基因組選擇的理論和方法研宄,??掌握了關鍵技術,建立了高密度SNP效應估計和基因組育種計算分析平臺,同時由本課題??組提出育種值估計的TABLUP方法,并組建了中國荷斯坦牛參考群體。通過該參考群體可??15??
性狀的基因組育種值和估計準確性,根據(jù)各性狀的基因組育種值計算得到GCPI指數(shù)。??分別對五批次基因組選擇的青年母牛GCPI指數(shù)和各性狀的基因組育種值結果進行對??比,通過表3-7和圖3-1可以看出,GCPI值逐漸升高,最高的是第五批為910.46;產(chǎn)奶量??基因組育種值均值最高的是第四批為576.54;乳脂率基因組育種值均值在第四、第五批次??提升為正數(shù),最高值為第五批的0.09;乳蛋白率、乳房和肢蹄評分的基因組育種值均值最高??28??
【參考文獻】:
期刊論文
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[7]用隨機回歸模型估計寧夏地區(qū)荷斯坦牛頭胎測定日產(chǎn)奶量遺傳參數(shù)[J]. 任小麗,劉澳星,李想,張旭,王雅春,邵懷峰,秦春華,王瑜,溫萬,張勝利. 中國農業(yè)科學. 2017(10)
[8]家畜基因組選擇研究進展[J]. 李宏偉,王瑞軍,王志英,李學武,王振宇,張燕軍,蘇蕊,劉志紅,李金泉. 遺傳. 2017(05)
[9]2016年奶牛產(chǎn)業(yè)技術發(fā)展報告[J]. 李勝利,姚琨,曹志軍,劉長全,張勝利,劉建新,李建喜,王加啟,張和平. 中國畜牧雜志. 2017(01)
[10]加速優(yōu)秀基因傳遞 開辟動物遺傳育種新時代[J]. 方美英,劉劍鋒,張勤,吳常信. 中國農村科技. 2016(06)
碩士論文
[1]應用隨機回歸測定日模型估計山東地區(qū)荷斯坦奶牛生產(chǎn)性狀遺傳參數(shù)[D]. 呂灣.河北工程大學 2019
[2]寧夏地區(qū)荷斯坦牛遺傳評估及選擇指數(shù)構建[D]. 李欣.寧夏大學 2017
[3]中國肉用西門塔爾牛育種目標的選擇及優(yōu)化育種規(guī)劃的研究[D]. 薛景龍.吉林農業(yè)大學 2016
[4]武漢地區(qū)荷斯坦奶牛產(chǎn)奶和繁殖性狀遺傳分析[D]. 趙占龍.華中農業(yè)大學 2015
[5]基于加性顯性模型的基因組選擇應用于西門塔爾牛的初步研究[D]. 王延暉.中國農業(yè)科學院 2014
[6]全球增暖背景下中國四季的劃分及與夏季降水的關系[D]. 張世軒.蘭州大學 2013
[7]西門塔爾牛部分屠宰和肉質性狀基因組選擇初步研究[D]. 朱淼.中國農業(yè)科學院 2013
[8]缺失數(shù)據(jù)對內蒙古絨山羊估計育種值準確性的影響[D]. 梁永厚.內蒙古農業(yè)大學 2007
本文編號:3338810
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