本研究利用RNA-Seq技術(shù),對(duì)蘇尼特羊120天胎兒和5月齡羔羊的骨骼肌組織進(jìn)行了比較分析,篩選出差異表達(dá)lncRNA及其靶基因,并對(duì)預(yù)測(cè)的靶基因進(jìn)行了GO和KEGG分析,同時(shí)對(duì)隨機(jī)篩選的差異表達(dá)lncRNA進(jìn)行了 qRT-PCR驗(yàn)證。通過對(duì)蘇尼特羊骨骼肌相關(guān)lncRNA的研究,為進(jìn)一步了解肌肉生長發(fā)育的遺傳調(diào)控機(jī)制提供重要的理論基礎(chǔ),也為綿羊分子輔助育種提供新的途徑。主要研究結(jié)果如下:（1）對(duì)比分析lncRNA與mRNA,發(fā)現(xiàn)與mRNA相比,lncRNA長度區(qū)間在200bp-3000bp的lncRNA數(shù)占lncRNA總數(shù)的80.0%。包含兩個(gè)和三個(gè)外顯子的lncRNA數(shù)占所有l(wèi)ncRNA的87.3%（971個(gè)）。mRNA的ORF長度明顯大于lncRNA,對(duì)比lncRNA和mRNA的表達(dá)量,發(fā)現(xiàn)lncRNA的整體表達(dá)量明顯低于mRNA（P<0.05）。（2）共發(fā)現(xiàn)了 1112個(gè)lncRNA,其中包括586個(gè)已知lncRNA和526個(gè)新lncRNA,其中肌肉不同發(fā)育時(shí)期差異表達(dá)的lncRNA數(shù)為626個(gè),共靶向1273個(gè)mRNA編碼基因。（3）通過對(duì)lncRNA在不同樣本中的FPK... 

【文章來源】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁數(shù)】：49 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１實(shí)驗(yàn)研究技術(shù)路線??Ｆｉｇ．?１?Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ?ｒｅｓｅａｒｃｈ?ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ?ｒｏｕｔｅ??

?０．４??Ｔｏｔａｌ?２０．０??ＰＣＲ反應(yīng)程序：９５°Ｃ反應(yīng)３ｍｉｎ?；?９５°Ｃ反應(yīng)５ｓ，；?６０°Ｃ反應(yīng)３０ｓ，共４０個(gè)循環(huán)，??９５°Ｃ反應(yīng)１５ｍｉｎ，放于４°Ｃ保存。羔羊ＩｎｃＲＮＡ的相對(duì)表達(dá)量用２３＆ｅｔ法計(jì)算，并和??轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果進(jìn)行比對(duì)驗(yàn)證。??３．?３結(jié)累與分析??３．?３．?１肌肉組織總ＲＮＡ提取檢測(cè)結(jié)果??利用ＮａｎｏＤｒｏｐ２０００紫外分光光度計(jì)檢測(cè)肌肉組織樣本的總ＲＮＡ，ＯＤ２６０／２８０??值均在１．８－２．０之間，用１％瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)，如圖２所示，２８ｓ、ＩＳｓ條帶清晰完??整性良好，證明無蛋白和有機(jī)試劑污染，可以進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。???多?２８ｓ??Ｋ￣＞?１８ｓ??ｓｓ??圖２肌肉組織總ＲＮＡ瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)結(jié)果??Ｆｉｇｕｒｅ．２?Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ?ｒｅｓｕｌｔｓ?ｏｆ?ｔｏｔａｌ?ＲＮＡ?ａｇａｒｏｓｅ?ｇｅｌ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?ｉｎ?ｍｕｓｃｌｅ?ｔｉｓｓｕｅ??３．３．２測(cè)序質(zhì)量和序列比對(duì)??過濾分析測(cè)序得到的原始數(shù)據(jù)（Ｒａｗｒｅａｄｓ）如表５所示。兩組樣本的總ｃｌｅａｎ?ｒｅａｄｓ的??

圖３候選ＩｎｃＲＮＡ篩選結(jié)果圖??Ｆｉｇｕｒｅ．３?Ｓｃｒｅｅｎｉｎｇ?ｒｅｓｕｌｔｓ?ｏｆ?ｃａｎｄｉｄａｔｅ?ＩｎｃＲＮＡ??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]F17大腸桿菌在湖羊羔羊個(gè)體脾臟中LncRNA表達(dá)譜變化[J]. 黃賽男,金澄艷,鮑建軍,王悅,陳煒昊,吳天弋,王利宏,呂曉陽,高雯,王步忠,朱國強(qiáng),戴國俊,孫偉.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(07)
[2]蘇博美利奴羊毛囊發(fā)育不同時(shí)期皮膚組織LncRNAs及其靶基因的差異表達(dá)[J]. 朱樺,黃錫霞,田可川,何軍敏,付雪峰,趙冰茹,徐新明,田月珍,阿布來提·蘇來曼,陳華峰.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2018(12)
[3]腺苷酸活化蛋白激酶與膿毒癥心功能不全的研究進(jìn)展[J]. 李亞敏,喬建峰,張?chǎng)┈u,彭振宇.  中南大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2018(12)

博士論文
[1]Lnc-SEMT促進(jìn)綿羊肌肉分化生成的功能研究[D]. 吳明明.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]利用條件性敲除小鼠模型對(duì)mTOR在肌肉和脂肪發(fā)育中的功能研究[D]. 張朋朋.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015

碩士論文
[1]綿羊骨骼肌lncRNA的表達(dá)分析及l(fā)ncRNA-MRLN蛋白編碼能力的分析[D]. 劉芝瑾.石河子大學(xué) 2019
[2]蘇尼特羊BMPR-IB、BMP15和GDF9基因與多胎性狀關(guān)聯(lián)性分析及BMP15基因突變檢測(cè)[D]. 楊艷影.內(nèi)蒙古大學(xué) 2017
[3]綿羊GV期和MⅡ期卵母細(xì)胞差異mRNA和lncRNA的篩選[D]. 牛夢(mèng)涵.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]肉用綿羊IncRNA特征分析及細(xì)胞水平功能驗(yàn)證[D]. 劉瑞鑿.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[5]鴨MyoD1和Myf5基因CDS區(qū)克隆及其在肌肉組織中發(fā)育差異性表達(dá)研究[D]. 魏園丁.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[6]骨骼肌在興奮收縮偶聯(lián)過程中超微結(jié)構(gòu)形態(tài)變化實(shí)時(shí)研究[D]. 李霆.第二軍醫(yī)大學(xué) 2004



本文編號(hào)：3330426