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豬流行性腹瀉病毒廣東分離株GD/JMEP的遺傳演化分析

發(fā)布時(shí)間:2021-08-07 02:32
  為了解廣東地區(qū)豬流行性腹瀉病毒(PEDV)的流行現(xiàn)狀,對(duì)廣東地區(qū)豬場(chǎng)進(jìn)行了PEDV流行株的分離,分離得到1株豬流行性腹瀉病毒,對(duì)分離毒株的S、N、M及ORF3基因進(jìn)行遺傳演化分析。結(jié)果表明:檢測(cè)的PEDV毒株GD/JMEP與經(jīng)典的CV777毒株親緣關(guān)系較遠(yuǎn),與近幾年廣東地區(qū)流行的PEDV毒株處于一個(gè)群,親緣關(guān)系較近;通過(guò)ORF3序列分析發(fā)現(xiàn),未有核苷酸的缺失;N、M基因核苷酸和氨基酸同源性分析發(fā)現(xiàn),GD/JMEP與EAS1等經(jīng)典毒株的同源性相對(duì)較低,與2013—2015年中國(guó)、美國(guó)、韓國(guó)等流行毒株的同源性較高;相比于經(jīng)典傳統(tǒng)毒株CV777,GD/JMEP的N基因存在9個(gè)氨基酸的差異,M基因存在11個(gè)核苷酸位點(diǎn)的變異和3個(gè)氨基酸的改變S基因存在幾個(gè)位點(diǎn)核苷酸的缺失或者插入;與目前流行毒株比較,M、N基因存在核苷酸位點(diǎn)的改變,S基因在406位點(diǎn)存在新的突變;通過(guò)氨基酸比對(duì)分析,GD/JMEP發(fā)生了6個(gè)新的氨基酸位點(diǎn)突變,表明本試驗(yàn)所檢測(cè)的PEDV為目前廣東流行毒株。 

【文章來(lái)源】:畜牧與獸醫(yī). 2017,49(10)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3326901

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