豬流行性腹瀉病毒廣東分離株GD/JMEP的遺傳演化分析
發(fā)布時間:2021-08-07 02:32
為了解廣東地區(qū)豬流行性腹瀉病毒(PEDV)的流行現(xiàn)狀,對廣東地區(qū)豬場進行了PEDV流行株的分離,分離得到1株豬流行性腹瀉病毒,對分離毒株的S、N、M及ORF3基因進行遺傳演化分析。結(jié)果表明:檢測的PEDV毒株GD/JMEP與經(jīng)典的CV777毒株親緣關系較遠,與近幾年廣東地區(qū)流行的PEDV毒株處于一個群,親緣關系較近;通過ORF3序列分析發(fā)現(xiàn),未有核苷酸的缺失;N、M基因核苷酸和氨基酸同源性分析發(fā)現(xiàn),GD/JMEP與EAS1等經(jīng)典毒株的同源性相對較低,與2013—2015年中國、美國、韓國等流行毒株的同源性較高;相比于經(jīng)典傳統(tǒng)毒株CV777,GD/JMEP的N基因存在9個氨基酸的差異,M基因存在11個核苷酸位點的變異和3個氨基酸的改變S基因存在幾個位點核苷酸的缺失或者插入;與目前流行毒株比較,M、N基因存在核苷酸位點的改變,S基因在406位點存在新的突變;通過氨基酸比對分析,GD/JMEP發(fā)生了6個新的氨基酸位點突變,表明本試驗所檢測的PEDV為目前廣東流行毒株。
【文章來源】:畜牧與獸醫(yī). 2017,49(10)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【參考文獻】:
期刊論文
[1]廣東省豬流行性腹瀉病毒S1基因的克隆與序列分析[J]. 羅六龍,黃冬妮,黃良宗,馬春全,梁梓森. 中國獸醫(yī)雜志. 2016(03)
[2]2011年—2014年廣西豬流行性腹瀉病毒檢測及其M基因的序列分析[J]. 盧冰霞,秦毅斌,何穎,李瑩瑩,梁家幸,黎珂鈺,李斌,蘇乾蓮,周英寧,蔣冬福,盧敬專,閉炳芬,梁保忠,段群棚,趙武. 中國畜牧獸醫(yī). 2015(03)
[3]豬流行性腹瀉病毒S、N和ORF3基因的遺傳變異分析[J]. 王隆柏,林裕勝,車勇良,吳學敏,陳如敬,邵良平,周倫江. 畜牧獸醫(yī)學報. 2014(11)
[4]豬流行性腹瀉病毒分子生物學研究進展[J]. 孫東波,馮力,時洪艷,陳建飛. 動物醫(yī)學進展. 2006(10)
本文編號:3326901
【文章來源】:畜牧與獸醫(yī). 2017,49(10)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【參考文獻】:
期刊論文
[1]廣東省豬流行性腹瀉病毒S1基因的克隆與序列分析[J]. 羅六龍,黃冬妮,黃良宗,馬春全,梁梓森. 中國獸醫(yī)雜志. 2016(03)
[2]2011年—2014年廣西豬流行性腹瀉病毒檢測及其M基因的序列分析[J]. 盧冰霞,秦毅斌,何穎,李瑩瑩,梁家幸,黎珂鈺,李斌,蘇乾蓮,周英寧,蔣冬福,盧敬專,閉炳芬,梁保忠,段群棚,趙武. 中國畜牧獸醫(yī). 2015(03)
[3]豬流行性腹瀉病毒S、N和ORF3基因的遺傳變異分析[J]. 王隆柏,林裕勝,車勇良,吳學敏,陳如敬,邵良平,周倫江. 畜牧獸醫(yī)學報. 2014(11)
[4]豬流行性腹瀉病毒分子生物學研究進展[J]. 孫東波,馮力,時洪艷,陳建飛. 動物醫(yī)學進展. 2006(10)
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