為了了解廣西地區(qū)鴨痘病毒的流行情況,試驗(yàn)采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR、基因克隆和序列分析的方法,對(duì)采自廣西河池市宜州某養(yǎng)鴨場(chǎng)患病鴨的痘斑組織進(jìn)行病原學(xué)檢測(cè)。結(jié)果表明:從痘斑組織中檢測(cè)出的病毒為鴨痘病毒,將其命名為Hechi株。用自行設(shè)計(jì)的引物P1/P2擴(kuò)增出大小約為577 bp的Popr基因片段,與預(yù)期大小一致。經(jīng)MEGA 6.0軟件分析,Hechi株屬于基因5.1亞群;與國(guó)內(nèi)雞痘疫苗株（282E4）、廣西大新株（daxin）、鵝源毒株（YNE）、鴨源毒株（YNY）的氨基酸位點(diǎn)比較有11個(gè)氨基酸位點(diǎn)發(fā)生改變,與國(guó)外參考株相比有5個(gè)氨基酸位點(diǎn)改變較大;與YNE、YNY、282E4、daxin株的核苷酸序列同源性分別為87.4%、87.6%、87.6%和99.8%,氨基酸序列同源性分別為91.9%、92.4%、92.4%和100%。說明目前廣西地區(qū)流行的鴨痘病毒很可能來源于YNY、282E4這2株毒株。 

【文章來源】：黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(15)北大核心

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【部分圖文】：

實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)結(jié)果

應(yīng)用PCR方法對(duì)鴨痘陽性樣品進(jìn)行Popr基因片段擴(kuò)增,瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)結(jié)果見圖2,獲得的目的片段大小為577 bp,與預(yù)期大小相符,且陰性對(duì)照和陽性對(duì)照成立。2.3 序列分析

鴨痘病毒Hechi株與YNY、YNE、282E4株核苷酸序列同源性分別為87.4%、87.6%和87.6%,與daxin株核苷酸序列同源性為99.8%。鴨痘病毒Hechi株與YNY、YNE、282E4株氨基酸序列同源性分別為91.9%、92.4%和92.4%,與daxin株氨基酸序列同源性為100%。同源性比較結(jié)果見圖4。圖4 核苷酸和氨基酸序列同源性比較結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]鵝源禽痘病毒的鑒定和基因分析[J]. 張紅云,鄭敏,羅滿林,曹慧慧,孫文超,韋顯凱,閉璟珊.  病毒學(xué)報(bào). 2017(06)
[2]鴨痘病毒TaqMan熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 曹慧慧,孫文超,鄭敏,韋顯凱,蘇姣秀,梁晟,鄭列豐,李軍,劉棋.  中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2015(10)



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