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豬順式作用元件UCOE的篩選與功能鑒定

發(fā)布時(shí)間:2021-08-05 16:15
  源于人HNRPA2B1/CBX3基因座位的染色質(zhì)開放元件UCOE包含一個(gè)雙向啟動(dòng)子及無甲基化的CpG島,具有染色質(zhì)重塑功能。當(dāng)它作為調(diào)控元件連接在啟動(dòng)子的上游時(shí)能夠防止轉(zhuǎn)錄沉默,增強(qiáng)轉(zhuǎn)基因的表達(dá)水平。為了研究豬UCOE在臨床應(yīng)用中所發(fā)揮的功能,本試驗(yàn)篩選了豬最佳UCOE片段。首先利用人UCOE序列進(jìn)行同源比對(duì)得到豬UCOE序列。通過酶切以及RT-PCR方法得到14個(gè)不同大小位置的豬UCOE片段,將其分別與pDRIVE5-GFP-2載體連接,構(gòu)建14個(gè)不同大小的載體,轉(zhuǎn)染HEK293T細(xì)胞,使用GFP2-hUCOE作為對(duì)照,24h后收集細(xì)胞,通過RT-PCR及Western blot檢測報(bào)告基因綠色熒光蛋白GFP的表達(dá)量,篩選出能使GFP基因穩(wěn)定高效表達(dá)的最佳UCOE片段,并觀察其綠色熒光持續(xù)時(shí)間。將篩選后的最佳UCOE片段插入重組質(zhì)粒pCpG-Mini-GFP中進(jìn)一步驗(yàn)證UCOE片段功能。結(jié)果顯示,構(gòu)建豬的14個(gè)重組質(zhì)粒以及GFP2-hUCOE成功在HEK293T細(xì)胞進(jìn)行了過表達(dá)。與對(duì)照組GFP2-hUCOE相比,p6號(hào)質(zhì)粒GFP的相對(duì)表達(dá)量最高,且綠色熒光時(shí)間持續(xù)14天,表明p6號(hào)質(zhì)... 

【文章來源】:河南農(nóng)業(yè)大學(xué)河南省

【文章頁數(shù)】:53 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

豬順式作用元件UCOE的篩選與功能鑒定


圖1人HNRPA2B1/CBX3基因座位的結(jié)構(gòu)??Fi.l?The?structure?of?HNRPA2B1/CBX3ene?locus??

序列,引物,基因,產(chǎn)物


河南農(nóng)業(yè)大學(xué)2014屆碩士研究生學(xué)位論文??⑤加入等體積的酚?氯仿?異戊醇(25:24:1),輕輕顛倒混勻。4°C,?12000rpm,離心lOmin,??出現(xiàn)分層。??⑥吸取上層至新的EP管中,加3/8倍體積的10M乙酸銨、2倍體積的冷無水乙醇,顛倒混??勻,放置-80°C,?30min。??⑦4°C,12000rpm,離心?lOmin,棄上清,留沉淀。加入?75%乙醇?lmL,?4°C,12000rpm,??離心5min,棄上清,留沉淀。??⑧加入2〇nL?lxTE?buffer溶解沉淀,65°C孵育6h以上。加入適量RNase,?37°C孵育lh。??通過0.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測基因組DNA的提取質(zhì)量。-20°C保存?zhèn)溆谩??3.2.?2.2引物設(shè)計(jì)與合成??根據(jù)同源比對(duì)出的豬UCOE(sUCOE)序列以及其酶切位點(diǎn)所在位置(圖2琍用Primer5.0??軟件設(shè)計(jì)目的片段引物。設(shè)計(jì)的引物由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成(表1)。??

電泳圖,質(zhì)粒,酶切鑒定,片段


使用全血基因DNA提取試劑盒提取人基因組DNA結(jié)果見圖3。采用PCR技術(shù)從人全血??基因組DNA中擴(kuò)增hUCOE片段,PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,在1550bp左右有??一特異性條帶(圖4A),與預(yù)計(jì)片段大小一致。PCR產(chǎn)物與pMD19-T載體連接,構(gòu)建重組??質(zhì)粒pMD19-T-hUCOE,用Smal對(duì)質(zhì)粒進(jìn)行單酶切,得到3562bp和700bp兩個(gè)條帶,與預(yù)??期相符(圖4B)。??圖3人全血基因組DNA的電泳圖??Fig.3?The?agarose?gel?diagram?of?human?blood?genomic?DNA??Ml?M2??丨.??i二:;3?562bp??700bp??1550bp? ̄2??圖4?pMD19-T-hUCOE質(zhì)粒的構(gòu)建??注:A是hUCOE的PCR擴(kuò)增圖;B是pMD19-T-hUCOE質(zhì)粒經(jīng)Smal酶切鑒定圖??Ml?:DL5000;M2:MarkerV??Fig.4?The?construction?of?pMD19-T-hUCOE?plasmid??Note:A?is?the?PCR?result?of?hUCOE;B?is?restriction?analysis?of?pMD19-T-hUC0E?plasmid?by?Smal??Ml:DL5000;M2:MarkerV??4.?1.2?GFP2-hUCOE質(zhì)粒的構(gòu)建??用Nsi丨和Sdal分別對(duì)pMD19-T-hUCOE和pDR丨VE5-GFP-2進(jìn)行雙酶切,分別得到??1558bp,2701bp與3589bp特異性條帶(圖5A,圖5B),與預(yù)期一致。目的片段連接,構(gòu)建??GFP2-hUCOE質(zhì)粒

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SAR與植物轉(zhuǎn)基因沉默的消除[J]. 劉昕,傅榮昭,蔡民華,李文彬.  生物工程進(jìn)展. 1998(04)



本文編號(hào):3324064

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