牛卵泡發(fā)育相關(guān)基因篩選及SIRT1、INHBA基因功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-08-03 08:23
卵泡生長(zhǎng)發(fā)育及閉鎖退化是一個(gè)復(fù)雜而又高度協(xié)調(diào)的生理過(guò)程,不僅受下丘腦-垂體-性腺軸(HPG axis)的調(diào)控,也受卵泡內(nèi)旁分泌/自分泌因子等的共同調(diào)節(jié)。為進(jìn)一步揭示牛卵泡發(fā)育的分子機(jī)制,篩查調(diào)控卵泡發(fā)育關(guān)鍵基因,本研究以牛卵巢為材料,采用高通量IlluminaHiSeq測(cè)序平臺(tái)對(duì)四組不同級(jí)別卵泡(直徑<2mm,2-5mm,5-8mm,>8mm)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,將質(zhì)控過(guò)的數(shù)據(jù)比對(duì)到參考基因組,篩選出差異表達(dá)基因并進(jìn)行趨勢(shì)分析。對(duì)趨勢(shì)基因進(jìn)行GO分類和KEGG注釋,找到趨勢(shì)基因的生物學(xué)功能富集和特異性代謝通路。分析牛卵泡基因表達(dá)過(guò)程中存在的可變剪接現(xiàn)象及出現(xiàn)的新轉(zhuǎn)錄本。對(duì)部分差異表達(dá)基因開(kāi)展實(shí)時(shí)定量PCR驗(yàn)證,在此基礎(chǔ)上進(jìn)一步選取SIRT1和INHBA基因進(jìn)行功能研究。本研究主要研究?jī)?nèi)容和結(jié)果如下:1.測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析四組樣本測(cè)序過(guò)濾后Quality scores大于20,mapping準(zhǔn)確度大于99%,可用于后續(xù)分析;四組樣本(按照卵泡直徑由小到大,分別以BF1-4表示)能夠比對(duì)到參考序列上的對(duì)比率分別為90.0%、89.0%、90.0%和92.5%。2.差異表達(dá)基因篩選將...
【文章來(lái)源】:吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)吉林省
【文章頁(yè)數(shù)】:112 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
哺乳動(dòng)物卵泡發(fā)育過(guò)程
圖 1.2 SIRT1 催化的酶促反應(yīng)[66]Fig.1.2 The enzymatic reaction catalyzed by SIRT1[66]酸化導(dǎo)致 NAD+依賴性脫乙酰酶活性降低,SIRT1 在體與clinB)和細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶 1(Cdk1)形成復(fù)合物酸(Thr)530 和絲氨酸(Ser)540 為其底物可以被磷酸化速細(xì)胞周期進(jìn)程,進(jìn)而促進(jìn)細(xì)胞增殖[82]。在氧化應(yīng)激條1)磷酸化 SIRT1,人類 SIRT1 在三個(gè)位點(diǎn)上被 JNK1 磷酸530,磷酸化后增加了 SIRT1 對(duì)其底物之一組蛋白 H3 的脫3 沒(méi)有影響[83]。雙特異性酪氨酸磷酸化調(diào)節(jié)激酶(DYRK)過(guò)磷酸化 SIRT1 Thr522 促進(jìn)細(xì)胞存活[84]。白藜蘆醇一直劑,但白藜蘆醇還作用于許多其他酶,具有很強(qiáng)的抗氧化的還是間接的仍然存在爭(zhēng)議[86,87]。sirtinol 可直接與 Sirt1煙酰胺是另一種常用的 sirtuin 抑制劑,是 NAD+的天然前產(chǎn)物[88,89]。
磷脂酰肌醇(3,4,5)-三磷酸(PIP3)域與 PIP3 結(jié)合,就會(huì)發(fā)生構(gòu)象變化,將,導(dǎo)致 T308 磷酸化和 Akt 活性增加 100T 活性的翻譯后修飾是可逆乙;T诨,肝臟,腦和骨骼肌中被乙酰化,并且酸被鑒定為 K14 和 K20,兩者都位于 A氨酸進(jìn)行去乙;瘜(duì)于AKT與PIP3的結(jié).3)。PDK1 的 PH 結(jié)構(gòu)域被乙;矔(huì)脫乙;问斤@示出相反的結(jié)果,表明乙蛋白活性的常見(jiàn)機(jī)制。胰島素受體底物S2 是 IGF-1R 信號(hào)的受體相關(guān)下游效應(yīng) SIRT1 依賴性脫乙;岣咂浠钚裕纱嘶彩歉渭(xì)胞中胰島素受體(IR)激酶 SIRT1 在多個(gè)水平上調(diào)胰島素信號(hào)傳導(dǎo)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]抑制素對(duì)綿羊顆粒細(xì)胞雌激素和孕酮分泌及相關(guān)基因表達(dá)的影響[J]. 李婷,馬愛(ài)團(tuán),劉月琴,高昆,張繼偉,張英杰. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(09)
[2]轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 洪奇陽(yáng),畢行建,王大寧,李子真,俞海,夏寧邵,李少偉. 中國(guó)生化藥物雜志. 2017(06)
[3]綿羊小卵泡與中卵泡轉(zhuǎn)錄組差異特征分析[J]. 吳陽(yáng)升,林嘉鵬,汪立芹,陳瑩,黃俊成. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2016(04)
[4]Sirt1-線粒體途徑介導(dǎo)的缺血再灌注損傷保護(hù)作用機(jī)制[J]. 胡明珠,周波,季永. 南通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2016(03)
[5]基于RNA-Seq識(shí)別山羊肉品質(zhì)候選基因[J]. 孟憲然,杜琛,王靜,付紹印,鄭竹清,張文廣,李金泉. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(08)
[6]人卵巢顆粒細(xì)胞FoxO基因和卵泡刺激素受體基因的表達(dá)及相關(guān)性研究[J]. 梁瑩,米梅艷,李淑賢,周莉,吳曉茜,雷靈梅. 河北醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(10)
[7]基于RNA-Seq高通量測(cè)序技術(shù)的牦牛卵巢轉(zhuǎn)錄組研究:進(jìn)一步完善牦;蚪Y(jié)構(gòu)及挖掘與繁殖相關(guān)新基因[J]. 蘭道亮,熊顯榮,位艷麗,徐通,鐘金城,字向東,王永,李鍵. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2014(03)
[8]Role of sirtuins in ischemia-reperfusion injury[J]. Eirini Pantazi,Mohamed Amine Zaouali,Mohamed Bejaoui,Emma Folch-Puy,Hassen Ben Abdennebi,Joan Roselló-Catafau. World Journal of Gastroenterology. 2013(43)
[9]豬卵巢顆粒細(xì)胞中SIRT1基因表達(dá)量與雌激素分泌的相關(guān)性[J]. 李碧俠,趙芳,付言峰,王學(xué)敏,方曉敏,涂楓,任守文,王金玉. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2013(03)
[10]巴美肉羊INHA和INHBA基因多態(tài)性與產(chǎn)羔數(shù)關(guān)系研究[J]. 索峰,劉永斌,特日格勒,祁云霞,何小龍,韓有勝,張莉,李虎山,榮威恒. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2012(03)
博士論文
[1]內(nèi)蒙古絨山羊胎兒期毛囊發(fā)生發(fā)育相關(guān)基因的篩選與鑒定[D]. 王樂(lè)樂(lè).內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]LPS刺激的奶牛乳腺上皮細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和miRNA表達(dá)譜變化規(guī)律的研究[D]. 陳玲.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[3]PI3K p110delta催化亞基在小鼠卵巢卵泡生長(zhǎng)中的功能研究[D]. 李倩.南京醫(yī)科大學(xué) 2013
[4]抑制素對(duì)小鼠卵泡發(fā)育和精子發(fā)生的分子和細(xì)胞調(diào)控機(jī)制研究[D]. 蔡開(kāi)來(lái).華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]抑制素和bcl-2基因免疫對(duì)小鼠繁殖和生長(zhǎng)的影響[D]. 姜?jiǎng)灼?南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2001
碩士論文
[1]雞卵巢發(fā)育相關(guān)miRNA與基因的鑒定及特征分析[D]. 賈美婷.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]基于高通量測(cè)序的濟(jì)寧青山羊和萊蕪黑山羊卵巢轉(zhuǎn)錄組研究[D]. 朱曉攀.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[3]抑制素α和βA亞基基因?qū)Π兔廊庋蚍敝沉τ绊懙难芯縖D]. 索峰.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]抑制素被動(dòng)免疫對(duì)羊生殖激素及卵泡顆粒細(xì)胞凋亡的影響[D]. 陳守云.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號(hào):3319286
【文章來(lái)源】:吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)吉林省
【文章頁(yè)數(shù)】:112 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
哺乳動(dòng)物卵泡發(fā)育過(guò)程
圖 1.2 SIRT1 催化的酶促反應(yīng)[66]Fig.1.2 The enzymatic reaction catalyzed by SIRT1[66]酸化導(dǎo)致 NAD+依賴性脫乙酰酶活性降低,SIRT1 在體與clinB)和細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶 1(Cdk1)形成復(fù)合物酸(Thr)530 和絲氨酸(Ser)540 為其底物可以被磷酸化速細(xì)胞周期進(jìn)程,進(jìn)而促進(jìn)細(xì)胞增殖[82]。在氧化應(yīng)激條1)磷酸化 SIRT1,人類 SIRT1 在三個(gè)位點(diǎn)上被 JNK1 磷酸530,磷酸化后增加了 SIRT1 對(duì)其底物之一組蛋白 H3 的脫3 沒(méi)有影響[83]。雙特異性酪氨酸磷酸化調(diào)節(jié)激酶(DYRK)過(guò)磷酸化 SIRT1 Thr522 促進(jìn)細(xì)胞存活[84]。白藜蘆醇一直劑,但白藜蘆醇還作用于許多其他酶,具有很強(qiáng)的抗氧化的還是間接的仍然存在爭(zhēng)議[86,87]。sirtinol 可直接與 Sirt1煙酰胺是另一種常用的 sirtuin 抑制劑,是 NAD+的天然前產(chǎn)物[88,89]。
磷脂酰肌醇(3,4,5)-三磷酸(PIP3)域與 PIP3 結(jié)合,就會(huì)發(fā)生構(gòu)象變化,將,導(dǎo)致 T308 磷酸化和 Akt 活性增加 100T 活性的翻譯后修飾是可逆乙;T诨,肝臟,腦和骨骼肌中被乙酰化,并且酸被鑒定為 K14 和 K20,兩者都位于 A氨酸進(jìn)行去乙;瘜(duì)于AKT與PIP3的結(jié).3)。PDK1 的 PH 結(jié)構(gòu)域被乙;矔(huì)脫乙;问斤@示出相反的結(jié)果,表明乙蛋白活性的常見(jiàn)機(jī)制。胰島素受體底物S2 是 IGF-1R 信號(hào)的受體相關(guān)下游效應(yīng) SIRT1 依賴性脫乙;岣咂浠钚裕纱嘶彩歉渭(xì)胞中胰島素受體(IR)激酶 SIRT1 在多個(gè)水平上調(diào)胰島素信號(hào)傳導(dǎo)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]抑制素對(duì)綿羊顆粒細(xì)胞雌激素和孕酮分泌及相關(guān)基因表達(dá)的影響[J]. 李婷,馬愛(ài)團(tuán),劉月琴,高昆,張繼偉,張英杰. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(09)
[2]轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 洪奇陽(yáng),畢行建,王大寧,李子真,俞海,夏寧邵,李少偉. 中國(guó)生化藥物雜志. 2017(06)
[3]綿羊小卵泡與中卵泡轉(zhuǎn)錄組差異特征分析[J]. 吳陽(yáng)升,林嘉鵬,汪立芹,陳瑩,黃俊成. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2016(04)
[4]Sirt1-線粒體途徑介導(dǎo)的缺血再灌注損傷保護(hù)作用機(jī)制[J]. 胡明珠,周波,季永. 南通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2016(03)
[5]基于RNA-Seq識(shí)別山羊肉品質(zhì)候選基因[J]. 孟憲然,杜琛,王靜,付紹印,鄭竹清,張文廣,李金泉. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(08)
[6]人卵巢顆粒細(xì)胞FoxO基因和卵泡刺激素受體基因的表達(dá)及相關(guān)性研究[J]. 梁瑩,米梅艷,李淑賢,周莉,吳曉茜,雷靈梅. 河北醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(10)
[7]基于RNA-Seq高通量測(cè)序技術(shù)的牦牛卵巢轉(zhuǎn)錄組研究:進(jìn)一步完善牦;蚪Y(jié)構(gòu)及挖掘與繁殖相關(guān)新基因[J]. 蘭道亮,熊顯榮,位艷麗,徐通,鐘金城,字向東,王永,李鍵. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2014(03)
[8]Role of sirtuins in ischemia-reperfusion injury[J]. Eirini Pantazi,Mohamed Amine Zaouali,Mohamed Bejaoui,Emma Folch-Puy,Hassen Ben Abdennebi,Joan Roselló-Catafau. World Journal of Gastroenterology. 2013(43)
[9]豬卵巢顆粒細(xì)胞中SIRT1基因表達(dá)量與雌激素分泌的相關(guān)性[J]. 李碧俠,趙芳,付言峰,王學(xué)敏,方曉敏,涂楓,任守文,王金玉. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2013(03)
[10]巴美肉羊INHA和INHBA基因多態(tài)性與產(chǎn)羔數(shù)關(guān)系研究[J]. 索峰,劉永斌,特日格勒,祁云霞,何小龍,韓有勝,張莉,李虎山,榮威恒. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2012(03)
博士論文
[1]內(nèi)蒙古絨山羊胎兒期毛囊發(fā)生發(fā)育相關(guān)基因的篩選與鑒定[D]. 王樂(lè)樂(lè).內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]LPS刺激的奶牛乳腺上皮細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和miRNA表達(dá)譜變化規(guī)律的研究[D]. 陳玲.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[3]PI3K p110delta催化亞基在小鼠卵巢卵泡生長(zhǎng)中的功能研究[D]. 李倩.南京醫(yī)科大學(xué) 2013
[4]抑制素對(duì)小鼠卵泡發(fā)育和精子發(fā)生的分子和細(xì)胞調(diào)控機(jī)制研究[D]. 蔡開(kāi)來(lái).華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]抑制素和bcl-2基因免疫對(duì)小鼠繁殖和生長(zhǎng)的影響[D]. 姜?jiǎng)灼?南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2001
碩士論文
[1]雞卵巢發(fā)育相關(guān)miRNA與基因的鑒定及特征分析[D]. 賈美婷.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]基于高通量測(cè)序的濟(jì)寧青山羊和萊蕪黑山羊卵巢轉(zhuǎn)錄組研究[D]. 朱曉攀.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[3]抑制素α和βA亞基基因?qū)Π兔廊庋蚍敝沉τ绊懙难芯縖D]. 索峰.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]抑制素被動(dòng)免疫對(duì)羊生殖激素及卵泡顆粒細(xì)胞凋亡的影響[D]. 陳守云.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號(hào):3319286
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