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坦布蘇病毒NS3蛋白互作宿主蛋白的篩

發(fā)布時間:2021-08-01 21:32
  NS3蛋白是坦布蘇病毒(Duck Tembusu virus,TMUV)非結(jié)構(gòu)蛋白中的重要成員,其包含三個結(jié)構(gòu)域S7、DEXDc和HELICc,每個結(jié)構(gòu)域各自分別具有絲氨酸蛋白酶,核苷酸三磷酸酶和RNA解旋酶活性,其具有多種生物學功能,參與病毒生命周期調(diào)控和宿主內(nèi)抗病毒免疫反應(yīng);诮湍鸽p雜交系統(tǒng),在本研究中,先將構(gòu)建好的陽性重組質(zhì)粒pGBKT7-NS3轉(zhuǎn)化到酵母Y2H菌株中,證明它沒有自激活能力和毒性,表明誘餌酵母菌已經(jīng)準備完成,可以進行后續(xù)的篩選工作。將復蘇后的鴨胚成纖維細胞cDNA文庫的獵物酵母菌株與誘餌酵母菌株進行雜交混合培養(yǎng),得到誘餌與獵物質(zhì)粒共同存在的雜合二倍體酵母細胞。雜交后在營養(yǎng)缺陷型培養(yǎng)基上進行不同強度層次的篩選,先在低篩選強度的SD/-Trp/-Leu培養(yǎng)皿上進行篩選,以獲得較多無表型且生長狀態(tài)良好的酵母菌落,一對一進行轉(zhuǎn)板,用較高篩選強度的DDO/X/A培養(yǎng)皿篩選出藍色陽性克隆,再一對一轉(zhuǎn)板到QDO/X/A上進行高篩選力培養(yǎng),挑取陽性克隆接種到QDO/X/A重復篩選,以此得到更多、更為準確且重復性更高的陽性結(jié)果。與NCBI數(shù)據(jù)庫比對,提示篩選出了七種與NS3存在潛... 

【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學山東省

【文章頁數(shù)】:86 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

坦布蘇病毒NS3蛋白互作宿主蛋白的篩


TMUV基因組結(jié)構(gòu)圖

三維結(jié)構(gòu)圖


坦布蘇病毒 NS3 蛋白互作宿主蛋白的篩選、驗證反應(yīng)中的活躍程度(Gebhard et al., 2012);其中,用伴隨其錨定到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上,從而促進 NS3 解旋酶的解旋率(Shiryaev et al., 2009)。它同時又可以協(xié)NA 依賴性 RNA 聚合酶(RNA-dependent RNA p程中,它能夠協(xié)助分離瞬時形成的 dsRNA 中間體。三者的復合物,在 DENV 感染的宿主細胞內(nèi)能夠協(xié)W lk B et al., 2012);也有相關(guān)研究顯示 NS3 蛋白,被歸為類似前凋亡蛋白,以觸發(fā)宿主細胞凋亡,

酵母雙雜交系統(tǒng),基本原理


一種蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)復合物,則在空間上重構(gòu)這兩個結(jié)構(gòu)域,由此可告基因的轉(zhuǎn)錄(Wang et al., 2018)。將重構(gòu)后的對應(yīng)載體分別轉(zhuǎn)化進系統(tǒng)中,如果誘餌和獵物相互作用,DNA-BD 結(jié)合域識別后并錨定,而此時與之互作的 pGal4 激活域能轉(zhuǎn)錄激活 UAS 啟動子所控制編基因。四種常用的報告基因是 AUR1-C、ADE2、HIS3 和 MEL1,他達,可以使酵母菌具備在營養(yǎng)缺陷培養(yǎng)基上仍能正常生長的特性。為篩選到的假陽性克隆,培養(yǎng)基中加入 X-α-Gal,可使 LacZ 表達之后顯行分辨和篩選(Walhout et al., 2001)。雙雜交技術(shù)近年來已被廣泛應(yīng)用于蛋白研究領(lǐng)域,漸漸成為發(fā)現(xiàn)和研和蛋白質(zhì)之間相互作用的基礎(chǔ)平臺。酵母雙雜交系統(tǒng)建立在真核生物白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用,即使是蛋白質(zhì)之間短暫存在的微弱瞬時效應(yīng)因產(chǎn)物被敏感地檢測到,該技術(shù)原理簡單,應(yīng)用廣泛,這將為相關(guān)研面上的支持(Hamdi et al., 2012)。

【參考文獻】:
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碩士論文
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[5]利用酵母雙雜交系統(tǒng)篩選PEDV蛋白間互作及與nsp14、nsp16互作的宿主蛋白[D]. 焦永.華中農(nóng)業(yè)大學 2016
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[7]基于轉(zhuǎn)錄組分析的PUB蛋白與甘藍S-位點受體激酶的相互作用研究[D]. 畢云龍.西南大學 2016
[8]坦布蘇病毒對櫻桃谷育成鴨的致病性研究[D]. 路云建.山東農(nóng)業(yè)大學 2016
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[10]坦布蘇病毒NS5蛋白單克隆抗體的制備與鑒定及快速檢測膠體金試紙條方法的建立[D]. 楊國平.山東農(nóng)業(yè)大學 2015



本文編號:3316282

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