坦布蘇病毒NS3蛋白互作宿主蛋白的篩
發(fā)布時間:2021-08-01 21:32
NS3蛋白是坦布蘇病毒(Duck Tembusu virus,TMUV)非結(jié)構(gòu)蛋白中的重要成員,其包含三個結(jié)構(gòu)域S7、DEXDc和HELICc,每個結(jié)構(gòu)域各自分別具有絲氨酸蛋白酶,核苷酸三磷酸酶和RNA解旋酶活性,其具有多種生物學功能,參與病毒生命周期調(diào)控和宿主內(nèi)抗病毒免疫反應(yīng);诮湍鸽p雜交系統(tǒng),在本研究中,先將構(gòu)建好的陽性重組質(zhì)粒pGBKT7-NS3轉(zhuǎn)化到酵母Y2H菌株中,證明它沒有自激活能力和毒性,表明誘餌酵母菌已經(jīng)準備完成,可以進行后續(xù)的篩選工作。將復蘇后的鴨胚成纖維細胞cDNA文庫的獵物酵母菌株與誘餌酵母菌株進行雜交混合培養(yǎng),得到誘餌與獵物質(zhì)粒共同存在的雜合二倍體酵母細胞。雜交后在營養(yǎng)缺陷型培養(yǎng)基上進行不同強度層次的篩選,先在低篩選強度的SD/-Trp/-Leu培養(yǎng)皿上進行篩選,以獲得較多無表型且生長狀態(tài)良好的酵母菌落,一對一進行轉(zhuǎn)板,用較高篩選強度的DDO/X/A培養(yǎng)皿篩選出藍色陽性克隆,再一對一轉(zhuǎn)板到QDO/X/A上進行高篩選力培養(yǎng),挑取陽性克隆接種到QDO/X/A重復篩選,以此得到更多、更為準確且重復性更高的陽性結(jié)果。與NCBI數(shù)據(jù)庫比對,提示篩選出了七種與NS3存在潛...
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學山東省
【文章頁數(shù)】:86 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
TMUV基因組結(jié)構(gòu)圖
坦布蘇病毒 NS3 蛋白互作宿主蛋白的篩選、驗證反應(yīng)中的活躍程度(Gebhard et al., 2012);其中,用伴隨其錨定到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上,從而促進 NS3 解旋酶的解旋率(Shiryaev et al., 2009)。它同時又可以協(xié)NA 依賴性 RNA 聚合酶(RNA-dependent RNA p程中,它能夠協(xié)助分離瞬時形成的 dsRNA 中間體。三者的復合物,在 DENV 感染的宿主細胞內(nèi)能夠協(xié)W lk B et al., 2012);也有相關(guān)研究顯示 NS3 蛋白,被歸為類似前凋亡蛋白,以觸發(fā)宿主細胞凋亡,
一種蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)復合物,則在空間上重構(gòu)這兩個結(jié)構(gòu)域,由此可告基因的轉(zhuǎn)錄(Wang et al., 2018)。將重構(gòu)后的對應(yīng)載體分別轉(zhuǎn)化進系統(tǒng)中,如果誘餌和獵物相互作用,DNA-BD 結(jié)合域識別后并錨定,而此時與之互作的 pGal4 激活域能轉(zhuǎn)錄激活 UAS 啟動子所控制編基因。四種常用的報告基因是 AUR1-C、ADE2、HIS3 和 MEL1,他達,可以使酵母菌具備在營養(yǎng)缺陷培養(yǎng)基上仍能正常生長的特性。為篩選到的假陽性克隆,培養(yǎng)基中加入 X-α-Gal,可使 LacZ 表達之后顯行分辨和篩選(Walhout et al., 2001)。雙雜交技術(shù)近年來已被廣泛應(yīng)用于蛋白研究領(lǐng)域,漸漸成為發(fā)現(xiàn)和研和蛋白質(zhì)之間相互作用的基礎(chǔ)平臺。酵母雙雜交系統(tǒng)建立在真核生物白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用,即使是蛋白質(zhì)之間短暫存在的微弱瞬時效應(yīng)因產(chǎn)物被敏感地檢測到,該技術(shù)原理簡單,應(yīng)用廣泛,這將為相關(guān)研面上的支持(Hamdi et al., 2012)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]PRDX家族蛋白與腫瘤的發(fā)生發(fā)展[J]. 呂麗娜,黃贊松,王小超. 右江民族醫(yī)學院學報. 2018(02)
[2]NALP3炎性復合體及p38 MAPK信號通路在氧化應(yīng)激中的作用及阿魏酸鈉的干預(yù)機制[J]. 汪蓮,謝敏,況菊. 四川大學學報(醫(yī)學版). 2018(02)
[3]穩(wěn)定過表達人MGST1基因抑制肺腺癌細胞SPC-A-1的凋亡[J]. 曾寶真,葛春蕾,付橋粉,張志偉,宋鑫,黃文華. 中國腫瘤生物治療雜志. 2017(06)
[4]坦布蘇病毒在種鴨中的垂直傳播[J]. 張英,趙丹丹,刁有祥,陳浩,提金鳳,張璐,楊國平. 中國獸醫(yī)學報. 2016(11)
[5]過氧化物還原酶在MAPK信號通路中的調(diào)節(jié)作用[J]. 郭芳,符民桂,姜志勝. 中國動脈硬化雜志. 2016(11)
[6]雞病防控中的主要生物安全措施[J]. 王宗海. 養(yǎng)禽與禽病防治. 2014(12)
[7]探針檢測鴨黃病毒的地高辛標記DNA的制備與應(yīng)用[J]. 高緒慧,刁有祥,唐熠,于春梅,張大丙,岳澄濱. 中國獸醫(yī)學報. 2012(04)
[8]鴨坦布蘇病毒研究進展[J]. 朱麗萍,顏世敢. 中國預(yù)防獸醫(yī)學報. 2012(01)
[9]坦布蘇病毒致病特性及其流行病學[J]. 萬春和,黃瑜. 動物醫(yī)學進展. 2011(12)
[10]鴨坦布蘇病毒病病原的分離鑒定及生物學特性研究[J]. 李澤君. 中國家禽. 2011(17)
博士論文
[1]鴨坦布蘇病毒細胞適應(yīng)毒免疫原性及致弱分子基礎(chǔ)研究[D]. 章麗嬌.中國農(nóng)業(yè)大學 2017
[2]PRDX3和UNG1在氧化應(yīng)激中相互作用的機制研究[D]. 劉志磊.清華大學 2016
[3]過氧化物酶6(Peroxiredoxin 6)在肝細胞肝癌中的表達和作用機制研究[D]. 魯?shù)?浙江大學 2016
[4]坦布蘇病毒ZC株感染性克隆的構(gòu)建和部分3’非編碼區(qū)功能的初步研究[D]. 陳浩.山東農(nóng)業(yè)大學 2015
[5]鴨坦布蘇病毒生物學特性、基因組特征、診斷方法以及感染性克隆的研究[D]. 于可響.揚州大學 2013
[6]坦布蘇病毒的分離鑒定及重組腺病毒介導shRNA抑制坦布蘇病毒在體外復制的研究[D]. 唐熠.山東農(nóng)業(yè)大學 2013
[7]丙型肝炎病毒非結(jié)構(gòu)蛋白3解旋酶保守性表位單克隆抗體及其意義[D]. 邊奕鑫.南方醫(yī)科大學 2013
碩士論文
[1]鴨坦布蘇病毒核酸免疫的初步建立[D]. 張澤.山東農(nóng)業(yè)大學 2018
[2]p38MAPK和JNK信號通路在甲狀腺功能減退雄性大鼠睪丸線粒體氧化應(yīng)激中的作用研究[D]. 常曉茹.蘭州大學 2018
[3]日本乙型腦炎病毒NS4B蛋白與NS3解旋酶的相互作用研究[D]. 呂博敏.華中農(nóng)業(yè)大學 2017
[4]MGST1抑制肺腺癌細胞的凋亡及其機制研究[D]. 曾寶真.南方醫(yī)科大學 2017
[5]利用酵母雙雜交系統(tǒng)篩選PEDV蛋白間互作及與nsp14、nsp16互作的宿主蛋白[D]. 焦永.華中農(nóng)業(yè)大學 2016
[6]乙型腦炎病毒NS1蛋白的宿主互作蛋白篩選與鑒定[D]. 周玉鵬.四川農(nóng)業(yè)大學 2016
[7]基于轉(zhuǎn)錄組分析的PUB蛋白與甘藍S-位點受體激酶的相互作用研究[D]. 畢云龍.西南大學 2016
[8]坦布蘇病毒對櫻桃谷育成鴨的致病性研究[D]. 路云建.山東農(nóng)業(yè)大學 2016
[9]穩(wěn)定表達乙型腦炎病毒NS2B/NS4B細胞系的構(gòu)建及其在篩選互作蛋白中的初步應(yīng)用[D]. 徐秋萍.華中農(nóng)業(yè)大學 2015
[10]坦布蘇病毒NS5蛋白單克隆抗體的制備與鑒定及快速檢測膠體金試紙條方法的建立[D]. 楊國平.山東農(nóng)業(yè)大學 2015
本文編號:3316282
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學山東省
【文章頁數(shù)】:86 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
TMUV基因組結(jié)構(gòu)圖
坦布蘇病毒 NS3 蛋白互作宿主蛋白的篩選、驗證反應(yīng)中的活躍程度(Gebhard et al., 2012);其中,用伴隨其錨定到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上,從而促進 NS3 解旋酶的解旋率(Shiryaev et al., 2009)。它同時又可以協(xié)NA 依賴性 RNA 聚合酶(RNA-dependent RNA p程中,它能夠協(xié)助分離瞬時形成的 dsRNA 中間體。三者的復合物,在 DENV 感染的宿主細胞內(nèi)能夠協(xié)W lk B et al., 2012);也有相關(guān)研究顯示 NS3 蛋白,被歸為類似前凋亡蛋白,以觸發(fā)宿主細胞凋亡,
一種蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)復合物,則在空間上重構(gòu)這兩個結(jié)構(gòu)域,由此可告基因的轉(zhuǎn)錄(Wang et al., 2018)。將重構(gòu)后的對應(yīng)載體分別轉(zhuǎn)化進系統(tǒng)中,如果誘餌和獵物相互作用,DNA-BD 結(jié)合域識別后并錨定,而此時與之互作的 pGal4 激活域能轉(zhuǎn)錄激活 UAS 啟動子所控制編基因。四種常用的報告基因是 AUR1-C、ADE2、HIS3 和 MEL1,他達,可以使酵母菌具備在營養(yǎng)缺陷培養(yǎng)基上仍能正常生長的特性。為篩選到的假陽性克隆,培養(yǎng)基中加入 X-α-Gal,可使 LacZ 表達之后顯行分辨和篩選(Walhout et al., 2001)。雙雜交技術(shù)近年來已被廣泛應(yīng)用于蛋白研究領(lǐng)域,漸漸成為發(fā)現(xiàn)和研和蛋白質(zhì)之間相互作用的基礎(chǔ)平臺。酵母雙雜交系統(tǒng)建立在真核生物白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用,即使是蛋白質(zhì)之間短暫存在的微弱瞬時效應(yīng)因產(chǎn)物被敏感地檢測到,該技術(shù)原理簡單,應(yīng)用廣泛,這將為相關(guān)研面上的支持(Hamdi et al., 2012)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]PRDX家族蛋白與腫瘤的發(fā)生發(fā)展[J]. 呂麗娜,黃贊松,王小超. 右江民族醫(yī)學院學報. 2018(02)
[2]NALP3炎性復合體及p38 MAPK信號通路在氧化應(yīng)激中的作用及阿魏酸鈉的干預(yù)機制[J]. 汪蓮,謝敏,況菊. 四川大學學報(醫(yī)學版). 2018(02)
[3]穩(wěn)定過表達人MGST1基因抑制肺腺癌細胞SPC-A-1的凋亡[J]. 曾寶真,葛春蕾,付橋粉,張志偉,宋鑫,黃文華. 中國腫瘤生物治療雜志. 2017(06)
[4]坦布蘇病毒在種鴨中的垂直傳播[J]. 張英,趙丹丹,刁有祥,陳浩,提金鳳,張璐,楊國平. 中國獸醫(yī)學報. 2016(11)
[5]過氧化物還原酶在MAPK信號通路中的調(diào)節(jié)作用[J]. 郭芳,符民桂,姜志勝. 中國動脈硬化雜志. 2016(11)
[6]雞病防控中的主要生物安全措施[J]. 王宗海. 養(yǎng)禽與禽病防治. 2014(12)
[7]探針檢測鴨黃病毒的地高辛標記DNA的制備與應(yīng)用[J]. 高緒慧,刁有祥,唐熠,于春梅,張大丙,岳澄濱. 中國獸醫(yī)學報. 2012(04)
[8]鴨坦布蘇病毒研究進展[J]. 朱麗萍,顏世敢. 中國預(yù)防獸醫(yī)學報. 2012(01)
[9]坦布蘇病毒致病特性及其流行病學[J]. 萬春和,黃瑜. 動物醫(yī)學進展. 2011(12)
[10]鴨坦布蘇病毒病病原的分離鑒定及生物學特性研究[J]. 李澤君. 中國家禽. 2011(17)
博士論文
[1]鴨坦布蘇病毒細胞適應(yīng)毒免疫原性及致弱分子基礎(chǔ)研究[D]. 章麗嬌.中國農(nóng)業(yè)大學 2017
[2]PRDX3和UNG1在氧化應(yīng)激中相互作用的機制研究[D]. 劉志磊.清華大學 2016
[3]過氧化物酶6(Peroxiredoxin 6)在肝細胞肝癌中的表達和作用機制研究[D]. 魯?shù)?浙江大學 2016
[4]坦布蘇病毒ZC株感染性克隆的構(gòu)建和部分3’非編碼區(qū)功能的初步研究[D]. 陳浩.山東農(nóng)業(yè)大學 2015
[5]鴨坦布蘇病毒生物學特性、基因組特征、診斷方法以及感染性克隆的研究[D]. 于可響.揚州大學 2013
[6]坦布蘇病毒的分離鑒定及重組腺病毒介導shRNA抑制坦布蘇病毒在體外復制的研究[D]. 唐熠.山東農(nóng)業(yè)大學 2013
[7]丙型肝炎病毒非結(jié)構(gòu)蛋白3解旋酶保守性表位單克隆抗體及其意義[D]. 邊奕鑫.南方醫(yī)科大學 2013
碩士論文
[1]鴨坦布蘇病毒核酸免疫的初步建立[D]. 張澤.山東農(nóng)業(yè)大學 2018
[2]p38MAPK和JNK信號通路在甲狀腺功能減退雄性大鼠睪丸線粒體氧化應(yīng)激中的作用研究[D]. 常曉茹.蘭州大學 2018
[3]日本乙型腦炎病毒NS4B蛋白與NS3解旋酶的相互作用研究[D]. 呂博敏.華中農(nóng)業(yè)大學 2017
[4]MGST1抑制肺腺癌細胞的凋亡及其機制研究[D]. 曾寶真.南方醫(yī)科大學 2017
[5]利用酵母雙雜交系統(tǒng)篩選PEDV蛋白間互作及與nsp14、nsp16互作的宿主蛋白[D]. 焦永.華中農(nóng)業(yè)大學 2016
[6]乙型腦炎病毒NS1蛋白的宿主互作蛋白篩選與鑒定[D]. 周玉鵬.四川農(nóng)業(yè)大學 2016
[7]基于轉(zhuǎn)錄組分析的PUB蛋白與甘藍S-位點受體激酶的相互作用研究[D]. 畢云龍.西南大學 2016
[8]坦布蘇病毒對櫻桃谷育成鴨的致病性研究[D]. 路云建.山東農(nóng)業(yè)大學 2016
[9]穩(wěn)定表達乙型腦炎病毒NS2B/NS4B細胞系的構(gòu)建及其在篩選互作蛋白中的初步應(yīng)用[D]. 徐秋萍.華中農(nóng)業(yè)大學 2015
[10]坦布蘇病毒NS5蛋白單克隆抗體的制備與鑒定及快速檢測膠體金試紙條方法的建立[D]. 楊國平.山東農(nóng)業(yè)大學 2015
本文編號:3316282
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3316282.html
最近更新
教材專著