為了鑒定和分析五指山豬背最長(zhǎng)肌和半腱肌中差異表達(dá)的lncRNA和mRNA,試驗(yàn)以6月齡五指山豬閹割公豬為試驗(yàn)動(dòng)物,在無(wú)菌狀態(tài)下逐頭采集背最長(zhǎng)肌和半腱肌樣品,采用RNA-Seq文庫(kù)和生物信息學(xué)方法對(duì)五指山豬肌肉組織中的lncRNA和mRNA進(jìn)行分析篩選,運(yùn)用DESeq軟件鑒定背最長(zhǎng)肌和半腱肌中差異表達(dá)的lncRNA和mRNA,并對(duì)差異表達(dá)的lncRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè)分析。結(jié)果表明:在五指山豬肌肉組織中共鑒定出4 086個(gè)lncRNA,其中正義型2 203個(gè)、反義型197個(gè)、內(nèi)含子型130個(gè)、基因間型1 556個(gè)。對(duì)比測(cè)序獲得的lncRNA和mRNA發(fā)現(xiàn),lncRNA和mRNA的長(zhǎng)度都主要分布在600～1 200 nt之間和3 000 nt以上。在背最長(zhǎng)肌與半腱肌間,存在82個(gè)差異表達(dá)的mRNA,其中前10位分別為ZIC4、ZIC1、PITX1、SIM1、PVALB、SEC14L5、SERPINB11、PRXL2B、ZNF862、MYBPH;存在32個(gè)差異表達(dá)的lncRNA,其中2個(gè)僅在背最長(zhǎng)肌中表達(dá),1個(gè)僅在半腱肌中表達(dá),29個(gè)在兩種肌肉組織中共表達(dá);獲得差異表達(dá)的lncRNA靶基因共7... 

【文章來(lái)源】：黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(07)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【部分圖文】：

lncRNA的鑒定與分類

五指山豬肌肉組織lncRNA和mRNA長(zhǎng)度特征的比對(duì)結(jié)果

差異表達(dá)IncRNA和mRNA的熱圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]豬牛羊肌肉組織質(zhì)構(gòu)特性差異比較及肌纖維分析[J]. 王亮,張寶善,李林強(qiáng),劉永鋒.  中國(guó)牛業(yè)科學(xué). 2016(03)
[2]海南五指山豬Myf5基因克隆與序列分析[J]. 晁哲,王峰,魏立民,孫瑞萍,黃麗麗,鄭心力.  黑龍江畜牧獸醫(yī). 2014(09)

碩士論文
[1]ZIC1基因聯(lián)合苦參堿對(duì)人乳腺癌MDA-MB-231細(xì)胞增殖、迀移及凋亡的影響研究[D]. 于民.江蘇大學(xué) 2016



本文編號(hào)：3308235