大足黑山羊TET1基因多態(tài)性及其與胎盤性狀的關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-28 11:24
山羊的胎產(chǎn)羔數(shù)是山羊生產(chǎn)中重要的育種指標(biāo),提高山羊的胎產(chǎn)羔數(shù)對(duì)保障養(yǎng)羊業(yè)持續(xù)健康發(fā)展、提高養(yǎng)羊業(yè)的經(jīng)濟(jì)效益和農(nóng)民積極性具有重要意義。由于產(chǎn)羔數(shù)的遺傳力低(0.1~0.15)和負(fù)的母體效應(yīng)特點(diǎn),多年來通過表型選擇直接提高母羊的胎產(chǎn)羔數(shù)的進(jìn)展緩慢。雖然人們也希望通過對(duì)影響產(chǎn)羔數(shù)的生理因素如排卵數(shù)、子宮容積等進(jìn)行選擇來加以提高,但因排卵數(shù)與胚胎存活率存在負(fù)的遺傳相關(guān),直接選擇子宮容積難度大,總體收效不大。因此,探索一個(gè)與產(chǎn)羔數(shù)呈強(qiáng)正相關(guān),且遺傳力高的性狀,如胎盤效率,來選擇種母羊和選留后備母羊,以提高山羊的產(chǎn)羔率是十分必要的。10-11異位蛋白1(Ten-Eleven Translocation 1,TET1)作為去甲基化主導(dǎo)作用的雙加氧酶成員,在哺乳動(dòng)物早期胎盤發(fā)育、胚胎著床、胎兒生長(zhǎng)、基因印記以及相關(guān)信號(hào)通路調(diào)控中具有普遍作用,是影響胎盤性狀進(jìn)而影響繁殖性能的一個(gè)重要候選基因,可以作為繁殖性狀輔助選擇的分子標(biāo)記。國內(nèi)外尚無山羊TET1基因及其與山羊胎盤性狀的關(guān)聯(lián)研究的相關(guān)報(bào)告。本論文以大足黑山羊?yàn)檠芯繉?duì)象,旨在探索TET1基因多態(tài)性及其對(duì)胎盤性狀的影響,為通過標(biāo)記輔助選擇提高山羊繁殖性能...
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖4-1.雙變量相關(guān)性分析熱圖
4結(jié)果與分析23可以看出,單羔、雙羔、三羔這三組產(chǎn)羔類型在胎盤重、子葉面積這兩種性狀上都是差異極顯著的,而在胎盤效率上三組數(shù)據(jù)都差異不顯著。單羔組的子葉總數(shù)極顯著地小于雙羔組和三羔組,而雙羔和三羔之間子葉總數(shù)差異不顯著。單羔組的子葉密度顯著大于三羔組,而單羔組和雙羔組差異不顯著;雙羔組和三羔組地差異也不顯著。在子葉承載效率方面,單羔組顯著大于雙羔和三羔組,但雙羔和三羔地差異不顯著。大足黑山羊不同胎次類型的胎盤性狀進(jìn)行比較發(fā)現(xiàn),只有子葉密度在經(jīng)產(chǎn)和初產(chǎn)母羊間差異顯著,而其他性狀差異均不顯著。表4-2以及表4-3中的結(jié)果與雙變量相關(guān)性熱圖的結(jié)果是一致的。4.2TET1基因序列的克隆4.2.1基因組DNA的檢測(cè)利用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)基因組DNA,結(jié)果如圖4-2所示。從圖中可以看出,基因組DNA較為完整,可以用于后續(xù)的分子實(shí)驗(yàn)中。同時(shí),用紫外分光光度計(jì)檢測(cè)DNA濃度和純度,結(jié)果顯示大多數(shù)樣本的OD260/280值在1.8-2.0之間,說明提取的基因組DNA純度較好。圖4-2.瓊脂糖電泳檢測(cè)DNA質(zhì)量Figure4-1.DetectionofDNAqualitybyagaroseelectrophoresis4.2.2引物最佳退火溫度的確定設(shè)計(jì)合成21對(duì)引物,對(duì)每對(duì)引物進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn)以確定其最佳的退火溫度,通過瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物,結(jié)果如圖4-3所示。具體如下:引物對(duì)TET1-1的退火溫度為60℃,TET1-2的退火溫度為60℃,TET1-3的退火溫度為64℃,TET1-4的退火溫度為63℃,TET1-5的退火溫度為60℃,TET1-6的退火溫度為61℃,TET1-7的退火溫度為60℃,TET1-8的退火溫度為61℃,TET1-9的退火
西南大學(xué)碩士學(xué)位論文24溫度為65℃,TET1-10的退火溫度為65℃,TET1-11的退火溫度為63℃,TET1-12的退火溫度為59℃,TET1-13的退火溫度為65℃,TET1-14的退火溫度為65℃,TET1-15的退火溫度為61℃,TET1-16的退火溫度為65℃,TET1-17的退火溫度為63℃,TET1-18的退火溫度為63℃,TET1-19的退火溫度為59℃,TET1-20的退火溫度為64℃,TET1-21的退火溫度為64℃。確定最佳退火溫度后,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),然后將樣品送往武漢天一輝遠(yuǎn)生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測(cè)序。圖4-3.引物的PCR產(chǎn)物瓊脂糖電泳圖A:1泳道為Maker,2-9泳道為TET-1,11泳道為Marker,12-19泳道為TET-2;B:從左到右每?jī)蓚(gè)條帶為一對(duì)引物。1泳道為Marker,2和3泳道為TET-3,4和5泳道為TET-4,6和7泳道為TET-5,8和9泳道為TET-6,10和11泳道為TET-7,12和13泳道為TET-8,14和15泳道為TET-9,16和17泳道為TET-10,18和19泳道為TET-11,20和21泳道為TET-12;C:從左到右每?jī)蓚(gè)條帶為一對(duì)引物。1泳道為Marker,2和3泳道為TET-13,4和5泳道為TET-14,6和7泳道為TET-15,8和9泳道為TET-16,10和11泳道為TET-17,12和13泳道為TET-18,14和15泳道為TET-19,16和17泳道為TET-20,18和19泳道為TET-21Figure4-3.AgaroseelectrophoresisofPCRproductsofprimers
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]云上黑山羊肌肉生長(zhǎng)抑制素基因多態(tài)性分析[J]. 江炎庭,王思宇,朱蘭,楊紅遠(yuǎn),洪瓊花. 中國草食動(dòng)物科學(xué). 2020(01)
[2]鵪鶉ESR1基因外顯子1多態(tài)性與早期生長(zhǎng)性能的關(guān)聯(lián)分析[J]. 曹恒,楊帥,白俊艷,樊紅燈,龐有志,付學(xué)言,盧小寧,時(shí)坤鵬. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(09)
[3]無角牦牛FTO基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)性分析[J]. 馬武,張浩,賈聰俊,閻萍,成述儒,梁春年. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020(02)
[4]SSR分子標(biāo)記技術(shù)在植物研究中的應(yīng)用[J]. 王玲玲,陳東亮,黃叢林,邢震. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(36)
[5]分子遺傳標(biāo)記技術(shù)及其在動(dòng)物育種中的研究進(jìn)展[J]. 宋志芳,于國生,解佑志,蘆春蓮,曹洪戰(zhàn). 豬業(yè)科學(xué). 2017(02)
[6]雞DGAT2基因第7外顯子多態(tài)性與生產(chǎn)性能的關(guān)聯(lián)[J]. 付金秀,郭紅威,李超,蔣瑞瑞,李轉(zhuǎn)見,王彥彬,康相濤,韓瑞麗. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2016(05)
[7]大足黑山羊胎盤子葉性狀和結(jié)構(gòu)及其與繁殖性能的相關(guān)性[J]. 羅南劍,管代祿,李黃琨,王燕,趙永聚. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(08)
[8]標(biāo)記輔助選擇技術(shù)在山羊育種中的應(yīng)用[J]. 肖玉萍,周磊,程勝利,楊保平,魏云霞. 中國草食動(dòng)物科學(xué). 2012(06)
[9]綿羊皮膚源EST-SSR標(biāo)記與羊毛性狀的關(guān)聯(lián)性分析[J]. 王遵寶,趙宗勝,吳洪賓,余鵬,張文祥,曾獻(xiàn)存. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2011(06)
[10]北川白山羊基因組與表型性狀相關(guān)的多態(tài)性RAPD標(biāo)記[J]. 蔡欣,茍興能,董紹森,劉暢,王雪,李勇. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2011(10)
博士論文
[1]絨山羊Y染色體的BAC篩選、鑒定與序列分析[D]. 肖紅梅.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
碩士論文
[1]MC4R基因在綿羊和山羊群體中的變異研究[D]. 喻運(yùn).華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]牛羊SSR分析及MHC進(jìn)化機(jī)制研究[D]. 陳李鵬.西南大學(xué) 2017
[3]寧都黃雞BMP15、INHA基因多態(tài)性與生長(zhǎng)、繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 金恒.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]家兔RERG、TGFBR1基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)性分析及TGFBR1對(duì)骨骼肌衛(wèi)星細(xì)胞生長(zhǎng)的影響[D]. 朱建爐.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[5]山羊CLPG基因染色體定位及其變異分析[D]. 沈祖楠.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[6]安徽白山羊多胎性能相關(guān)分子標(biāo)記的AFLP篩選[D]. 陳勝.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[7]內(nèi)蒙古絨山羊BMP-2基因DNA序列的克隆與熒光原位雜交定位[D]. 張海軍.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號(hào):3307823
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖4-1.雙變量相關(guān)性分析熱圖
4結(jié)果與分析23可以看出,單羔、雙羔、三羔這三組產(chǎn)羔類型在胎盤重、子葉面積這兩種性狀上都是差異極顯著的,而在胎盤效率上三組數(shù)據(jù)都差異不顯著。單羔組的子葉總數(shù)極顯著地小于雙羔組和三羔組,而雙羔和三羔之間子葉總數(shù)差異不顯著。單羔組的子葉密度顯著大于三羔組,而單羔組和雙羔組差異不顯著;雙羔組和三羔組地差異也不顯著。在子葉承載效率方面,單羔組顯著大于雙羔和三羔組,但雙羔和三羔地差異不顯著。大足黑山羊不同胎次類型的胎盤性狀進(jìn)行比較發(fā)現(xiàn),只有子葉密度在經(jīng)產(chǎn)和初產(chǎn)母羊間差異顯著,而其他性狀差異均不顯著。表4-2以及表4-3中的結(jié)果與雙變量相關(guān)性熱圖的結(jié)果是一致的。4.2TET1基因序列的克隆4.2.1基因組DNA的檢測(cè)利用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)基因組DNA,結(jié)果如圖4-2所示。從圖中可以看出,基因組DNA較為完整,可以用于后續(xù)的分子實(shí)驗(yàn)中。同時(shí),用紫外分光光度計(jì)檢測(cè)DNA濃度和純度,結(jié)果顯示大多數(shù)樣本的OD260/280值在1.8-2.0之間,說明提取的基因組DNA純度較好。圖4-2.瓊脂糖電泳檢測(cè)DNA質(zhì)量Figure4-1.DetectionofDNAqualitybyagaroseelectrophoresis4.2.2引物最佳退火溫度的確定設(shè)計(jì)合成21對(duì)引物,對(duì)每對(duì)引物進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn)以確定其最佳的退火溫度,通過瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物,結(jié)果如圖4-3所示。具體如下:引物對(duì)TET1-1的退火溫度為60℃,TET1-2的退火溫度為60℃,TET1-3的退火溫度為64℃,TET1-4的退火溫度為63℃,TET1-5的退火溫度為60℃,TET1-6的退火溫度為61℃,TET1-7的退火溫度為60℃,TET1-8的退火溫度為61℃,TET1-9的退火
西南大學(xué)碩士學(xué)位論文24溫度為65℃,TET1-10的退火溫度為65℃,TET1-11的退火溫度為63℃,TET1-12的退火溫度為59℃,TET1-13的退火溫度為65℃,TET1-14的退火溫度為65℃,TET1-15的退火溫度為61℃,TET1-16的退火溫度為65℃,TET1-17的退火溫度為63℃,TET1-18的退火溫度為63℃,TET1-19的退火溫度為59℃,TET1-20的退火溫度為64℃,TET1-21的退火溫度為64℃。確定最佳退火溫度后,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),然后將樣品送往武漢天一輝遠(yuǎn)生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測(cè)序。圖4-3.引物的PCR產(chǎn)物瓊脂糖電泳圖A:1泳道為Maker,2-9泳道為TET-1,11泳道為Marker,12-19泳道為TET-2;B:從左到右每?jī)蓚(gè)條帶為一對(duì)引物。1泳道為Marker,2和3泳道為TET-3,4和5泳道為TET-4,6和7泳道為TET-5,8和9泳道為TET-6,10和11泳道為TET-7,12和13泳道為TET-8,14和15泳道為TET-9,16和17泳道為TET-10,18和19泳道為TET-11,20和21泳道為TET-12;C:從左到右每?jī)蓚(gè)條帶為一對(duì)引物。1泳道為Marker,2和3泳道為TET-13,4和5泳道為TET-14,6和7泳道為TET-15,8和9泳道為TET-16,10和11泳道為TET-17,12和13泳道為TET-18,14和15泳道為TET-19,16和17泳道為TET-20,18和19泳道為TET-21Figure4-3.AgaroseelectrophoresisofPCRproductsofprimers
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]云上黑山羊肌肉生長(zhǎng)抑制素基因多態(tài)性分析[J]. 江炎庭,王思宇,朱蘭,楊紅遠(yuǎn),洪瓊花. 中國草食動(dòng)物科學(xué). 2020(01)
[2]鵪鶉ESR1基因外顯子1多態(tài)性與早期生長(zhǎng)性能的關(guān)聯(lián)分析[J]. 曹恒,楊帥,白俊艷,樊紅燈,龐有志,付學(xué)言,盧小寧,時(shí)坤鵬. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(09)
[3]無角牦牛FTO基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)性分析[J]. 馬武,張浩,賈聰俊,閻萍,成述儒,梁春年. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020(02)
[4]SSR分子標(biāo)記技術(shù)在植物研究中的應(yīng)用[J]. 王玲玲,陳東亮,黃叢林,邢震. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(36)
[5]分子遺傳標(biāo)記技術(shù)及其在動(dòng)物育種中的研究進(jìn)展[J]. 宋志芳,于國生,解佑志,蘆春蓮,曹洪戰(zhàn). 豬業(yè)科學(xué). 2017(02)
[6]雞DGAT2基因第7外顯子多態(tài)性與生產(chǎn)性能的關(guān)聯(lián)[J]. 付金秀,郭紅威,李超,蔣瑞瑞,李轉(zhuǎn)見,王彥彬,康相濤,韓瑞麗. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2016(05)
[7]大足黑山羊胎盤子葉性狀和結(jié)構(gòu)及其與繁殖性能的相關(guān)性[J]. 羅南劍,管代祿,李黃琨,王燕,趙永聚. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(08)
[8]標(biāo)記輔助選擇技術(shù)在山羊育種中的應(yīng)用[J]. 肖玉萍,周磊,程勝利,楊保平,魏云霞. 中國草食動(dòng)物科學(xué). 2012(06)
[9]綿羊皮膚源EST-SSR標(biāo)記與羊毛性狀的關(guān)聯(lián)性分析[J]. 王遵寶,趙宗勝,吳洪賓,余鵬,張文祥,曾獻(xiàn)存. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2011(06)
[10]北川白山羊基因組與表型性狀相關(guān)的多態(tài)性RAPD標(biāo)記[J]. 蔡欣,茍興能,董紹森,劉暢,王雪,李勇. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2011(10)
博士論文
[1]絨山羊Y染色體的BAC篩選、鑒定與序列分析[D]. 肖紅梅.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
碩士論文
[1]MC4R基因在綿羊和山羊群體中的變異研究[D]. 喻運(yùn).華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]牛羊SSR分析及MHC進(jìn)化機(jī)制研究[D]. 陳李鵬.西南大學(xué) 2017
[3]寧都黃雞BMP15、INHA基因多態(tài)性與生長(zhǎng)、繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 金恒.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]家兔RERG、TGFBR1基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)性分析及TGFBR1對(duì)骨骼肌衛(wèi)星細(xì)胞生長(zhǎng)的影響[D]. 朱建爐.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[5]山羊CLPG基因染色體定位及其變異分析[D]. 沈祖楠.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[6]安徽白山羊多胎性能相關(guān)分子標(biāo)記的AFLP篩選[D]. 陳勝.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[7]內(nèi)蒙古絨山羊BMP-2基因DNA序列的克隆與熒光原位雜交定位[D]. 張海軍.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號(hào):3307823
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