免疫應(yīng)激斷奶仔豬胸腺相關(guān)miRNAs篩選及分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-22 01:39
隨著現(xiàn)代養(yǎng)豬業(yè)的快速發(fā)展,仔豬的早期斷奶已經(jīng)成為國內(nèi)外集約化養(yǎng)豬生產(chǎn)的關(guān)鍵技術(shù)。然而,斷奶仔豬由于免疫系統(tǒng)發(fā)育不完善,容易受飼養(yǎng)環(huán)境中各種病原體的侵襲,導(dǎo)致免疫應(yīng)激,使用于生長和骨骼肌蛋白質(zhì)沉積的養(yǎng)分轉(zhuǎn)而用于維持機(jī)體免疫應(yīng)答,導(dǎo)致其代謝行為發(fā)生改變,進(jìn)而引起生長發(fā)育緩慢和生產(chǎn)效率降低,給畜牧業(yè)帶來嚴(yán)重經(jīng)濟(jì)損失,直接影響到豬場的生產(chǎn)水平和經(jīng)濟(jì)利益。免疫應(yīng)激嚴(yán)重影響胸腺的發(fā)育,胸腺做為中樞免疫器官在免疫調(diào)控中發(fā)揮重要作用,目前的研究主要集中在蛋白質(zhì)編碼基因,miRNA介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄后水平為免疫應(yīng)激分子機(jī)制提供了新的視角。本研究通過建立斷奶仔豬的免疫應(yīng)激模型,從胸腺中篩選相關(guān)差異表達(dá)miRNA,并對其進(jìn)行鑒定和生物信息分析,其研究結(jié)果有利于進(jìn)一步闡明斷奶仔豬免疫應(yīng)激的分子機(jī)制,也為利用miRNA及其靶基因信息來降低斷奶仔豬免疫應(yīng)激提供新的思路。本研究主要結(jié)果如下:1.將6頭大約克夏斷奶仔豬(21天斷奶)按胎次相同、出生體重相近、隨機(jī)分為試驗(yàn)組和對照組,每個(gè)組別各3頭豬。試驗(yàn)組注射100μg/kg BW的LPS,對照組注射等量的生理鹽水,3h后,采集斷奶仔豬胸腺及其他各種組織。檢測試驗(yàn)組和對照組仔...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
文獻(xiàn)綜述
1 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬生長發(fā)育的影響
1.1 免疫應(yīng)激的概念
1.2 斷奶仔豬易發(fā)生免疫應(yīng)激的原因
1.2.1 營養(yǎng)因素
1.2.2 環(huán)境因素
1.2.3 人為因素
1.2.4 心理因素
1.3 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬生長發(fā)育的影響
1.3.1 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬采食量的影響
1.3.2 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬生產(chǎn)性能和發(fā)育的影響
1.4 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬營養(yǎng)代謝的影響
1.4.1 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬營養(yǎng)需求的影響
1.4.2 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬蛋白質(zhì)代謝的影響
1.4.3 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬脂肪代謝的影響
1.4.4 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬糖代謝的影響
1.4.5 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬礦物代謝的影響
1.5 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬免疫功能的影響
1.6 斷奶仔豬免疫應(yīng)激的緩解方法
1.6.1 保證斷奶仔豬的營養(yǎng)
1.6.2 改善飼養(yǎng)環(huán)境
1.6.3 加強(qiáng)斷奶仔豬保健
1.6.4 嚴(yán)控疫苗質(zhì)量和免疫程序
2 MIRNA對免疫的調(diào)控
2.1 miRNA概述
2.2 miRNA的生成和作用機(jī)制
2.3 miRNA對免疫的調(diào)控作用
2.3.1 miRNA影響免疫細(xì)胞分化
2.3.2 miRNA對固有免疫的調(diào)控
2.3.3 miRNA與適應(yīng)性免疫
3 SOLEXA高通量測序技術(shù)為豬新MIRNA發(fā)掘提供了有效途徑
4 免疫應(yīng)激模型建立
5 本研究的目的和意義
試驗(yàn)
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 主要試劑與設(shè)備
1.3 方法
1.3.1 動物試驗(yàn)
1.3.2 樣品采集
1.3.3 血漿炎性細(xì)胞因子和生長激素水平檢測
1.3.4 胸腺RNA提取及檢測
1.3.5 小RNA文庫的建立和測序
1.3.6 Solexa數(shù)據(jù)處理
1.3.7 差異miRNA的QPCR鑒定
1.3.8 差異miRNA的組織表達(dá)譜分析
1.4 試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理和分析
1.4.1 靶基因的預(yù)測
1.4.2 差異表達(dá)miRNA的靶基因功能分析
1.4.3 KEGG通路分析
1.4.4 SPSS統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 血漿炎性細(xì)胞因子和生長激素水平檢測結(jié)果
2.2 斷奶仔豬胸腺免疫應(yīng)激相關(guān)miRNA測序結(jié)果分析
2.2.1 RNA質(zhì)量檢測
2.2.2 solexa測序結(jié)果分析
2.2.3 仔豬胸腺中已知miRNAs的分析
2.2.4 己知miRNAs差異表達(dá)譜的分析
2.3 Q-PCR驗(yàn)證
2.4 組織表達(dá)譜分析
2.5 差異表達(dá)miRNAs的靶基因預(yù)測和WEGO功能分析
2.6 KEGG通路分析
3 討論
3.1 LPS與斷奶仔豬免疫應(yīng)激
3.2 solexa測序結(jié)果和差異miRNAs的鑒定
3.3 miRNA的組織表達(dá)譜分析
3.4 miRNA靶基因預(yù)測和WEGO功能分析
3.5 miRNA的KEGG通路分析
4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
本文編號:3296183
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
文獻(xiàn)綜述
1 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬生長發(fā)育的影響
1.1 免疫應(yīng)激的概念
1.2 斷奶仔豬易發(fā)生免疫應(yīng)激的原因
1.2.1 營養(yǎng)因素
1.2.2 環(huán)境因素
1.2.3 人為因素
1.2.4 心理因素
1.3 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬生長發(fā)育的影響
1.3.1 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬采食量的影響
1.3.2 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬生產(chǎn)性能和發(fā)育的影響
1.4 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬營養(yǎng)代謝的影響
1.4.1 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬營養(yǎng)需求的影響
1.4.2 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬蛋白質(zhì)代謝的影響
1.4.3 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬脂肪代謝的影響
1.4.4 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬糖代謝的影響
1.4.5 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬礦物代謝的影響
1.5 免疫應(yīng)激對斷奶仔豬免疫功能的影響
1.6 斷奶仔豬免疫應(yīng)激的緩解方法
1.6.1 保證斷奶仔豬的營養(yǎng)
1.6.2 改善飼養(yǎng)環(huán)境
1.6.3 加強(qiáng)斷奶仔豬保健
1.6.4 嚴(yán)控疫苗質(zhì)量和免疫程序
2 MIRNA對免疫的調(diào)控
2.1 miRNA概述
2.2 miRNA的生成和作用機(jī)制
2.3 miRNA對免疫的調(diào)控作用
2.3.1 miRNA影響免疫細(xì)胞分化
2.3.2 miRNA對固有免疫的調(diào)控
2.3.3 miRNA與適應(yīng)性免疫
3 SOLEXA高通量測序技術(shù)為豬新MIRNA發(fā)掘提供了有效途徑
4 免疫應(yīng)激模型建立
5 本研究的目的和意義
試驗(yàn)
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 主要試劑與設(shè)備
1.3 方法
1.3.1 動物試驗(yàn)
1.3.2 樣品采集
1.3.3 血漿炎性細(xì)胞因子和生長激素水平檢測
1.3.4 胸腺RNA提取及檢測
1.3.5 小RNA文庫的建立和測序
1.3.6 Solexa數(shù)據(jù)處理
1.3.7 差異miRNA的QPCR鑒定
1.3.8 差異miRNA的組織表達(dá)譜分析
1.4 試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理和分析
1.4.1 靶基因的預(yù)測
1.4.2 差異表達(dá)miRNA的靶基因功能分析
1.4.3 KEGG通路分析
1.4.4 SPSS統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 血漿炎性細(xì)胞因子和生長激素水平檢測結(jié)果
2.2 斷奶仔豬胸腺免疫應(yīng)激相關(guān)miRNA測序結(jié)果分析
2.2.1 RNA質(zhì)量檢測
2.2.2 solexa測序結(jié)果分析
2.2.3 仔豬胸腺中已知miRNAs的分析
2.2.4 己知miRNAs差異表達(dá)譜的分析
2.3 Q-PCR驗(yàn)證
2.4 組織表達(dá)譜分析
2.5 差異表達(dá)miRNAs的靶基因預(yù)測和WEGO功能分析
2.6 KEGG通路分析
3 討論
3.1 LPS與斷奶仔豬免疫應(yīng)激
3.2 solexa測序結(jié)果和差異miRNAs的鑒定
3.3 miRNA的組織表達(dá)譜分析
3.4 miRNA靶基因預(yù)測和WEGO功能分析
3.5 miRNA的KEGG通路分析
4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
本文編號:3296183
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