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肉雞CMTR2基因分子特征及其表達(dá)譜分析

發(fā)布時(shí)間:2021-07-21 01:49
  【目的】分析肉雞加帽甲基轉(zhuǎn)移酶基因(CMTR2)分子特征及其表達(dá)譜,為后續(xù)開(kāi)展雞CMTR2基因結(jié)構(gòu)及生物學(xué)功能研究打下基礎(chǔ)!痉椒ā恳园我婕樱ˋA)肉雞為研究對(duì)象,利用RT-PCR克隆CMTR2基因,使用DNAMAN、ProtParam、SOPMA、SWISS-MODEL、TMHMM 2.0和SignalP 3.0等在線軟件進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并以實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)分析其表達(dá)特征!窘Y(jié)果】肉雞CMTR2基因編碼區(qū)(CDS)序列全長(zhǎng)為2350 bp(登錄號(hào)MN296490),其開(kāi)放閱讀框(ORF)為2292 bp,編碼763個(gè)氨基酸殘基;肉雞CMTR2氨基酸序列與原雞CMTR2氨基酸序列的相似性為99.74%,只有2個(gè)氨基酸殘基差異,與火雞CMTR2氨基酸序列的親緣關(guān)系較近(相似性為95.94%)。肉雞CMTR2蛋白分子量為86855.48 Da,理論等電點(diǎn)(p I)為6.08,在哺乳動(dòng)物網(wǎng)織紅細(xì)胞體外表達(dá)的半衰期為30 h,在酵母體內(nèi)表達(dá)的半衰期大于20 h,在大腸桿菌體內(nèi)表達(dá)的半衰期大于10 h。肉雞CMTR2蛋白為不穩(wěn)定的親水性蛋白,無(wú)信號(hào)肽和跨膜區(qū)域,包含61個(gè)磷酸化位點(diǎn)、... 

【文章來(lái)源】:南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,51(08)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)

【部分圖文】:

肉雞CMTR2基因分子特征及其表達(dá)譜分析


雞CMTR2基因PCR擴(kuò)增電泳結(jié)果

氨基酸序列,進(jìn)化樹(shù),同源性,氨基酸序列


實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)結(jié)果顯示,CMTR2基因在42日齡AA肉雞8種組織中的相對(duì)表達(dá)量排序?yàn)槠⑴K>肺臟>胸肌>腹脂>肝臟>腎臟>腿肌>心臟,以在脾臟中的相對(duì)表達(dá)量最高,顯著高于在其他組織中的相對(duì)表達(dá)量(P<0.05,下同),而在心臟中的相對(duì)表達(dá)量顯著低于在其他組織中的相對(duì)表達(dá)量(圖10-A)。肉雞CMTR2基因的時(shí)空表達(dá)變化趨勢(shì)顯示,在21日齡時(shí)的相對(duì)表達(dá)量最高,極顯著高于其他日齡;在14日齡的相對(duì)表達(dá)量最低,而在28~42日齡的相對(duì)表達(dá)量呈逐漸上升趨勢(shì)(圖10-B)。圖3 肉雞CMTR2蛋白信號(hào)肽預(yù)測(cè)結(jié)果

氨基酸序列,肉雞,進(jìn)化樹(shù),信號(hào)肽


肉雞CMTR2蛋白信號(hào)肽預(yù)測(cè)結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]靜寧雞PPARα基因克隆與生物信息學(xué)分析[J]. 楊妍梅,李玉,覃圣,蔣劉芽,趙金潭,陸曉東,熊杰,陳偉基,扎西英派.  江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2019(02)
[2]人類胞內(nèi)蛋白半衰期與其亞細(xì)胞定位的相關(guān)性研究[J]. 賈浩,張小白,宋曉峰.  計(jì)算機(jī)與應(yīng)用化學(xué). 2011(04)
[3]蛋白質(zhì)糖基化修飾研究進(jìn)展[J]. 李軍,杜鑫,Hosseini Moghaddam S.H.,陳玉銀.  科技通報(bào). 2009(06)
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[5]蛋白質(zhì)磷酸化修飾的研究進(jìn)展[J]. 姜錚,王芳,何湘,劉大偉,陳宣男,趙紅慶,黃留玉,袁靜.  生物技術(shù)通訊. 2009(02)
[6]二硫鍵和巰基在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)功能中的作用及分析方法[J]. 田悅,杜軍保.  實(shí)用兒科臨床雜志. 2007(19)
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碩士論文
[1]模式動(dòng)物雞與果蠅的心臟發(fā)育研究[D]. 張?jiān)戮?湖南師范大學(xué) 2004



本文編號(hào):3294052

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