為了解新疆南疆部分地區(qū)不同蜱種攜帶斑點(diǎn)熱群立克次體（spotted fever group Rickettsia,SFGR）情況,采用PCR技術(shù)擴(kuò)增16S rDNA基因和SFGR外膜蛋白A（OmpA）基因,進(jìn)行蜱種鑒定及SFGR檢測(cè)。對(duì)測(cè)序陽(yáng)性樣本進(jìn)行BLAST序列分析,應(yīng)用DNAStar和Mega 6.0軟件構(gòu)建遺傳進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果顯示:從新疆南疆9個(gè)縣市共采集蜱1 340只,其種類包括3屬4種,分別為圖蘭扇頭蜱、邊緣革蜱、銀盾革蜱、亞洲璃眼蜱;在隨機(jī)挑選的90份蜱DNA樣本中共檢測(cè)出57份SFGR陽(yáng)性樣本,其中阿拉爾市十一團(tuán)、七連地區(qū)的陽(yáng)性樣本均來(lái)自犬體表寄生蜱,其余地區(qū)的陽(yáng)性樣本均來(lái)自綿羊體表寄生蜱。序列分析及遺傳進(jìn)化樹(shù)顯示,此次檢測(cè)的亞洲璃眼蜱、邊緣革蜱攜帶的SFGR與GenBank公布的SFGR疆內(nèi)株Candidatus R.barbariae（登錄號(hào)為MG668832.1）親緣關(guān)系最近,處于同一分支;圖蘭扇頭蜱攜帶的SFGR也同疆內(nèi)株R.massiliae、R.conorii、Candidatus R.barbariae（MG668831.1、KP214024.1、MG6688... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,40(04)北大核心CSCD

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【部分圖文】：

蜱線粒體16S rDNA 基因PCR擴(kuò)增

圖1 蜱線粒體16S rDNA 基因PCR擴(kuò)增表3 新疆南疆不同地區(qū)蜱內(nèi)SFGR體感染率 采樣地點(diǎn) 蜱數(shù)量/只 檢測(cè)數(shù)/只 陽(yáng)性數(shù)/只 感染率/% 阿瓦提縣 500 12 10 83.33 烏什縣 80 12 2 16.67 沙雅縣 459 37 24 64.86 庫(kù)車縣 100 10 5 50.00 新和縣 20 2 2 100.00 阿拉爾市十團(tuán) 110 10 9 90.00 阿拉爾市八團(tuán) 30 2 2 100.00 阿拉爾市十一團(tuán) 40 4 2 50.00 阿拉爾市七連 1 1 1 100.00 合計(jì) 1 340 90 57 63.33

90份蜱線粒體16S rDNA基因序列經(jīng)BLAST比對(duì),結(jié)果顯示與GenBank中已公布的圖蘭扇頭蜱、銀盾革蜱、邊緣革蜱、亞洲璃眼蜱基因序列同源性高達(dá)99%以上,選取部分序列構(gòu)建遺傳進(jìn)化樹(shù)(圖3)。57份SFGR OmpA基因序列與GenBank公布的蜱SFGR OmpA基因序列比對(duì)發(fā)現(xiàn),存在4種不同的SFGR基因型(圖4)。圖4 SFGR OmpA基因系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]內(nèi)蒙古錫林郭勒盟地區(qū)優(yōu)勢(shì)蜱種及其基因多樣性分析[J]. 黃芳,黃天鵬,賀海燕,吳咪,朝木麗格,王云沖,格日勒?qǐng)D.  中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(03)
[2]新疆部分地區(qū)優(yōu)勢(shì)種革蜱攜帶綿羊無(wú)漿體的檢測(cè)及其進(jìn)化關(guān)系[J]. 聞秀秀,王寧,蘇布賽,劉世芳,許正茂,吾力江·卡馬力,巴音查汗.  中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(09)
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碩士論文
[1]新疆南疆圖蘭扇頭蜱鑒定及其攜帶部分病原檢測(cè)[D]. 李飛.塔里木大學(xué) 2017
[2]新疆邊境地區(qū)蜱種、蜱傳立克次體分布規(guī)律及分子特征研究[D]. 郭利萍.石河子大學(xué) 2017



本文編號(hào)：3288451