馬立克氏病病毒貴州株meq基因的克隆及遺傳進(jìn)化分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-13 06:23
為了解從貴陽(yáng)市某養(yǎng)殖場(chǎng)矮腳黃雞病料中分離的馬立克氏病病毒(MDV)的遺傳變異情況及meq基因的分子特征,試驗(yàn)對(duì)臨床病料進(jìn)行MDV meq基因PCR檢測(cè)、克隆及序列分析。結(jié)果:從檢測(cè)樣品中擴(kuò)增出1 020 bp MDV meq基因片段(命名為MDV GZ 2019 meq),將該片段克隆至p MD19-T載體,經(jīng)測(cè)序?yàn)? 020 bp序列。同源性分析結(jié)果顯示:該病毒株與國(guó)內(nèi)特超強(qiáng)毒MDV分離株GXY2株的核苷酸序列和推導(dǎo)氨基酸序列同源性最高,分別為99.8%、99.4%;推導(dǎo)氨基酸序列比對(duì)結(jié)果顯示存在5個(gè)突變位點(diǎn),分別為第63位(R→G)、第80位(D→Y)、第139位(T→A)、第176位(P→R)、第217位(P→A)。除第63位突變位點(diǎn)外,其余4個(gè)突變位點(diǎn)均與GXY2株一致。結(jié)論:本次分離的MDV貴州株與國(guó)內(nèi)特超強(qiáng)毒MDV分離株GXY2株同源性最高,推測(cè)其為MDV強(qiáng)毒株。
【文章來(lái)源】:貴州畜牧獸醫(yī). 2020,44(06)
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【部分圖文】:
MDV核酸PCR檢測(cè)結(jié)果
MDV meq基因克隆菌液PCR鑒定結(jié)果
測(cè)序結(jié)果顯示MDV GZ 2019 meq基因全長(zhǎng)1 020 bp,共編碼339個(gè)氨基酸,將其與Gen Bank登錄的10株MDV參考株的meq基因進(jìn)行核苷酸序列、推導(dǎo)氨基酸序列同源性比對(duì)。由圖3可見(jiàn):MDV GZ 2019meq基因與參考毒株的核苷酸同源性為98.7%~99.8%。其與國(guó)內(nèi)特超強(qiáng)毒MDV分離株GXY2株的同源性最高(99.8%),與國(guó)內(nèi)強(qiáng)毒MDV分離株J-1株、美國(guó)特超強(qiáng)毒MDV分離株648A株的同源性最低(98.7%)。由圖4可見(jiàn):MDV GZ 2019 meq基因與參考毒株的推導(dǎo)氨基酸同源性為96.7%~99.4%。其與國(guó)內(nèi)特超強(qiáng)毒MDV分離株GXY2株的同源性最高(99.4%),與荷蘭溫和型MDV分離株CVI988株的同源性最低(96.7%)。圖4 MDV GZ 2019 meq基因推導(dǎo)氨基酸序列同源性比對(duì)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用CRISPR/Cas9技術(shù)缺失MDV分離株meq基因的研究[J]. 張峰,于正浩,蘭興鴿,張艷萍,王永強(qiáng),高立,高玉龍,李凱,祁小樂(lè),崔紅玉,潘青,王笑梅,劉長(zhǎng)軍. 中國(guó)家禽. 2019(09)
[2]河南省3株馬立克病病毒Meq基因的序列分析[J]. 張?zhí)靷?章劍君,何宏軒. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2017(12)
[3]不同代次缺失meq基因的重組馬立克病毒SC9-1株主要基因序列同源性分析[J]. 陳俊霞,韓妮,張言坤,孫鵬,周忠文,蘇帥,崔治中. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(05)
[4]雞馬立克氏病病毒廣西株Meq基因的克隆與序列分析[J]. 屈素潔,鄒聯(lián)斌,胡杰,粟艷瓊,莫?jiǎng)偬m,施開(kāi)創(chuàng),尹彥文,李軍,張步嫻. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2016(01)
本文編號(hào):3281533
【文章來(lái)源】:貴州畜牧獸醫(yī). 2020,44(06)
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【部分圖文】:
MDV核酸PCR檢測(cè)結(jié)果
MDV meq基因克隆菌液PCR鑒定結(jié)果
測(cè)序結(jié)果顯示MDV GZ 2019 meq基因全長(zhǎng)1 020 bp,共編碼339個(gè)氨基酸,將其與Gen Bank登錄的10株MDV參考株的meq基因進(jìn)行核苷酸序列、推導(dǎo)氨基酸序列同源性比對(duì)。由圖3可見(jiàn):MDV GZ 2019meq基因與參考毒株的核苷酸同源性為98.7%~99.8%。其與國(guó)內(nèi)特超強(qiáng)毒MDV分離株GXY2株的同源性最高(99.8%),與國(guó)內(nèi)強(qiáng)毒MDV分離株J-1株、美國(guó)特超強(qiáng)毒MDV分離株648A株的同源性最低(98.7%)。由圖4可見(jiàn):MDV GZ 2019 meq基因與參考毒株的推導(dǎo)氨基酸同源性為96.7%~99.4%。其與國(guó)內(nèi)特超強(qiáng)毒MDV分離株GXY2株的同源性最高(99.4%),與荷蘭溫和型MDV分離株CVI988株的同源性最低(96.7%)。圖4 MDV GZ 2019 meq基因推導(dǎo)氨基酸序列同源性比對(duì)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用CRISPR/Cas9技術(shù)缺失MDV分離株meq基因的研究[J]. 張峰,于正浩,蘭興鴿,張艷萍,王永強(qiáng),高立,高玉龍,李凱,祁小樂(lè),崔紅玉,潘青,王笑梅,劉長(zhǎng)軍. 中國(guó)家禽. 2019(09)
[2]河南省3株馬立克病病毒Meq基因的序列分析[J]. 張?zhí)靷?章劍君,何宏軒. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2017(12)
[3]不同代次缺失meq基因的重組馬立克病毒SC9-1株主要基因序列同源性分析[J]. 陳俊霞,韓妮,張言坤,孫鵬,周忠文,蘇帥,崔治中. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(05)
[4]雞馬立克氏病病毒廣西株Meq基因的克隆與序列分析[J]. 屈素潔,鄒聯(lián)斌,胡杰,粟艷瓊,莫?jiǎng)偬m,施開(kāi)創(chuàng),尹彥文,李軍,張步嫻. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2016(01)
本文編號(hào):3281533
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