河南省部分地區(qū)豬腹瀉類冠狀病毒流行病學(xué)調(diào)查及PEDV遺傳進(jìn)化分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-06 17:58
目前調(diào)查研究表明,豬流行性腹瀉病毒(PEDV)、豬傳染性胃腸炎病毒(TGEV)和豬δ冠狀病毒(PDCoV)是導(dǎo)致豬病毒性腹瀉的常見病原,它們都可使不同生長(zhǎng)階段豬群發(fā)生急性水樣腹瀉、嘔吐,嚴(yán)重時(shí)脫水致死,尤其在哺乳仔豬中有較高的感染率。由于這三種病原在臨床癥狀中難以區(qū)分,因而對(duì)豬病毒性腹瀉疑似病例進(jìn)行病原檢測(cè)尤為重要。為探究豬病毒性腹瀉在河南省地區(qū)的流行情況,本研究擬對(duì)河南省部分地區(qū)的豬群腹瀉冠狀病毒(PDCoV、TGEV和PEDV)的感染情況進(jìn)行調(diào)查,并對(duì)其中的25份PEDV陽(yáng)性病料進(jìn)行了ORF3、N、M基因的擴(kuò)增及序列測(cè)定,還對(duì)其中18株P(guān)EDV陽(yáng)性病料S基因進(jìn)行了擴(kuò)增及序列測(cè)定,并且與經(jīng)典毒株CV777及國(guó)內(nèi)外流行毒株基因序列進(jìn)行了遺傳進(jìn)化分析。1.河南省部分地區(qū)豬群腹瀉類冠狀病毒的流行病學(xué)調(diào)查對(duì)來自河南省部分地區(qū)豬場(chǎng)的2017年至2018年期間采集的255份腹瀉病料進(jìn)行RTPCR檢測(cè),以分析PDCoV、PEDV和TGEV在河南地區(qū)豬群中的流行情況。結(jié)果顯示255份腹瀉病料中,PEDV陽(yáng)性病料達(dá)115份,占45.10%,TGEV陽(yáng)性病料有68份,陽(yáng)性率占26.67%,PDCoV陽(yáng)性...
【文章來源】:河南農(nóng)業(yè)大學(xué)河南省
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
PEDV、PDCoV和TGEV目的片段的RT-PCR擴(kuò)增結(jié)果
18C D圖1-3 河南省不同地區(qū)豬場(chǎng)檢測(cè)腹瀉情況分布Fig.1-3 Diarrhea distribution in pig farms in different areas of Henan province.A:檢測(cè)樣品陽(yáng)性分布;B:檢測(cè)PDCoV陽(yáng)性分布;C: 檢測(cè)PEDV陽(yáng)性分布;D: 檢測(cè)TGEV陽(yáng)性分布;A: positive distribution of test samples; B: detection of PDCoV positive distribution; C: detection of PEDVpositive distribution; D: detection of TGEV positive distribution;2.4 不同時(shí)間PEDV、TGEV 和PDCoV檢測(cè)結(jié)果根據(jù)不同時(shí)間檢測(cè)腹瀉冠狀病毒感染情況如表1-6和圖1-4,運(yùn)用RT-PCR方法在7-8月份PDCoV、TGEV和PEDV均未檢測(cè)到,PEDV在一月份檢出率最高達(dá)96.43%;PDCoV在一月份檢出率最高達(dá)82.14%。而PEDV、PDCoV和TGEV在春冬季節(jié)感染相對(duì)較高,其中PEDV在冬季的檢出率高達(dá)85.48%,PDCoV和TGEV在春季的檢出率分別為14.39%和45.45%。顯示腹瀉冠狀病毒的感染受季節(jié)變化影響,在較低環(huán)境中容易發(fā)生腹瀉冠狀病毒的感染。
2017.12 16 12(75) 1(6.25) 5(31.25)2018.1 28 27(96.43) 0(0) 23(82.14)圖1-4 不同時(shí)間豬場(chǎng)腹瀉檢測(cè)陽(yáng)性率分布情況Fig.1-4 Distribution of positive rates of diarrhea in pig farms at different times2.5 不同生長(zhǎng)階段PEDV、PDCoV和TGEV檢測(cè)結(jié)果運(yùn)用RT-PCR方法進(jìn)行PEDV、PDCoV和TGEV病原核酸檢測(cè),按照不同生長(zhǎng)階段進(jìn)行比較,結(jié)果見表1-7和圖1-5,河南省不同豬群中哺乳仔豬感染PEDV陽(yáng)性率為75.90%,PDCoV的陽(yáng)性率為48.19%,而TGEV在哺乳仔豬階段的陽(yáng)性率為13.25%。在母豬階段PEDV的感染也相對(duì)較高為27.59%,而PDCoV較低為2.59%。從整體來看,豬群感染腹瀉類冠狀病毒大多處于哺乳仔豬階段。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2013-2014年黑龍江地區(qū)豬流行性腹瀉病毒檢測(cè)及M基因的遺傳進(jìn)化分析[J]. 劉佳麗,王梓,趙莉,王瑞翀,李一經(jīng),王麗,唐麗杰,徐義剛,劉敏,喬薪瑗. 中國(guó)獸醫(yī)雜志. 2017(08)
[2]豬Delta冠狀病毒和豬流行性腹瀉病毒雙重RT-PCR診斷方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 韓麗,周雍,李炳曉,曹貝貝,梁青青,張利衛(wèi),胡慧. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2017(05)
[3]豬δ冠狀病毒SYBR Green Ⅰ熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 張利衛(wèi),曹貝貝,張?jiān)骑w,張君濤,韋學(xué)雷,蘭培英,胡慧. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2017(06)
[4]2011—2016年浙江省豬流行性腹瀉病毒S基因與ORF3基因遺傳進(jìn)化分析[J]. 吳旺霞,王一成,吳潤(rùn),袁秀芳,徐麗華,李軍星,蘇菲. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(03)
[5]豬德爾塔冠狀病毒RT-PCR檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用[J]. 鄭麗,王利麗,路超,楊春蕾,李富強(qiáng),張莉,鄢明華. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2017(03)
[6]豬δ冠狀病毒檢測(cè)方法研究進(jìn)展[J]. 龍?jiān)气P,王毅謙,姜珊,蘇志同,李寒玲,吳紹強(qiáng),姜焱. 畜牧與獸醫(yī). 2017(03)
[7]豬德爾塔冠狀病毒病的綜合防治措施[J]. 張永香,陳海南. 獸醫(yī)導(dǎo)刊. 2017(01)
[8]新發(fā)PDCoV和TGEV雙重RT-PCR檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 劉玲玲,曹貝貝,張利衛(wèi),韓麗,韋學(xué)雷,蘭培英,胡慧,王亞賓. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2016(12)
[9]以原核表達(dá)的豬δ冠狀病毒N蛋白為包被抗原的間接ELISA方法的建立[J]. 張帆帆,宋德平,郭楠楠,葉昱,周信榮,李安琪,張敏,彭棋,陳燕君,黃冬艷,唐玉新. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(10)
[10]新發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒屬——丁型冠狀病毒[J]. 王逸雯,黃耀偉. 生命的化學(xué). 2016(04)
博士論文
[1]河南省豬流行性腹瀉病毒遺傳進(jìn)化分析及免疫學(xué)檢測(cè)方法的建立[D]. 李任峰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
碩士論文
[1]中東呼吸綜合征冠狀病毒受體結(jié)合的分子機(jī)制研究[D]. 胡亞偉.安徽大學(xué) 2014
[2]豬傳染性胃腸炎病毒膜蛋白親和多肽的篩選與鑒定[D]. 鄒昊.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]豬流行性腹瀉病毒S、M、ORF3基因的克隆和序列分析[D]. 李衡.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]豬傳染性胃腸炎病毒的分離鑒定及結(jié)構(gòu)基因重組桿狀病毒的構(gòu)建[D]. 冷勇.西南大學(xué) 2013
[5]攜PEDV M、N基因的減毒沙門氏菌株構(gòu)建及其免疫原性研究[D]. 任玉鵬.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[6]兩種豬腸道冠狀病毒診斷方法的建立和國(guó)內(nèi)新分離毒株主要結(jié)構(gòu)蛋白基因克隆與序列分析[D]. 楊群.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
[7]三株豬流行性腹瀉病毒的Envelope(Small Membrane,sM)編碼基因的序列測(cè)定比較[D]. 劉春艷.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2003
本文編號(hào):3268708
【文章來源】:河南農(nóng)業(yè)大學(xué)河南省
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
PEDV、PDCoV和TGEV目的片段的RT-PCR擴(kuò)增結(jié)果
18C D圖1-3 河南省不同地區(qū)豬場(chǎng)檢測(cè)腹瀉情況分布Fig.1-3 Diarrhea distribution in pig farms in different areas of Henan province.A:檢測(cè)樣品陽(yáng)性分布;B:檢測(cè)PDCoV陽(yáng)性分布;C: 檢測(cè)PEDV陽(yáng)性分布;D: 檢測(cè)TGEV陽(yáng)性分布;A: positive distribution of test samples; B: detection of PDCoV positive distribution; C: detection of PEDVpositive distribution; D: detection of TGEV positive distribution;2.4 不同時(shí)間PEDV、TGEV 和PDCoV檢測(cè)結(jié)果根據(jù)不同時(shí)間檢測(cè)腹瀉冠狀病毒感染情況如表1-6和圖1-4,運(yùn)用RT-PCR方法在7-8月份PDCoV、TGEV和PEDV均未檢測(cè)到,PEDV在一月份檢出率最高達(dá)96.43%;PDCoV在一月份檢出率最高達(dá)82.14%。而PEDV、PDCoV和TGEV在春冬季節(jié)感染相對(duì)較高,其中PEDV在冬季的檢出率高達(dá)85.48%,PDCoV和TGEV在春季的檢出率分別為14.39%和45.45%。顯示腹瀉冠狀病毒的感染受季節(jié)變化影響,在較低環(huán)境中容易發(fā)生腹瀉冠狀病毒的感染。
2017.12 16 12(75) 1(6.25) 5(31.25)2018.1 28 27(96.43) 0(0) 23(82.14)圖1-4 不同時(shí)間豬場(chǎng)腹瀉檢測(cè)陽(yáng)性率分布情況Fig.1-4 Distribution of positive rates of diarrhea in pig farms at different times2.5 不同生長(zhǎng)階段PEDV、PDCoV和TGEV檢測(cè)結(jié)果運(yùn)用RT-PCR方法進(jìn)行PEDV、PDCoV和TGEV病原核酸檢測(cè),按照不同生長(zhǎng)階段進(jìn)行比較,結(jié)果見表1-7和圖1-5,河南省不同豬群中哺乳仔豬感染PEDV陽(yáng)性率為75.90%,PDCoV的陽(yáng)性率為48.19%,而TGEV在哺乳仔豬階段的陽(yáng)性率為13.25%。在母豬階段PEDV的感染也相對(duì)較高為27.59%,而PDCoV較低為2.59%。從整體來看,豬群感染腹瀉類冠狀病毒大多處于哺乳仔豬階段。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2013-2014年黑龍江地區(qū)豬流行性腹瀉病毒檢測(cè)及M基因的遺傳進(jìn)化分析[J]. 劉佳麗,王梓,趙莉,王瑞翀,李一經(jīng),王麗,唐麗杰,徐義剛,劉敏,喬薪瑗. 中國(guó)獸醫(yī)雜志. 2017(08)
[2]豬Delta冠狀病毒和豬流行性腹瀉病毒雙重RT-PCR診斷方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 韓麗,周雍,李炳曉,曹貝貝,梁青青,張利衛(wèi),胡慧. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2017(05)
[3]豬δ冠狀病毒SYBR Green Ⅰ熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 張利衛(wèi),曹貝貝,張?jiān)骑w,張君濤,韋學(xué)雷,蘭培英,胡慧. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2017(06)
[4]2011—2016年浙江省豬流行性腹瀉病毒S基因與ORF3基因遺傳進(jìn)化分析[J]. 吳旺霞,王一成,吳潤(rùn),袁秀芳,徐麗華,李軍星,蘇菲. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(03)
[5]豬德爾塔冠狀病毒RT-PCR檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用[J]. 鄭麗,王利麗,路超,楊春蕾,李富強(qiáng),張莉,鄢明華. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2017(03)
[6]豬δ冠狀病毒檢測(cè)方法研究進(jìn)展[J]. 龍?jiān)气P,王毅謙,姜珊,蘇志同,李寒玲,吳紹強(qiáng),姜焱. 畜牧與獸醫(yī). 2017(03)
[7]豬德爾塔冠狀病毒病的綜合防治措施[J]. 張永香,陳海南. 獸醫(yī)導(dǎo)刊. 2017(01)
[8]新發(fā)PDCoV和TGEV雙重RT-PCR檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 劉玲玲,曹貝貝,張利衛(wèi),韓麗,韋學(xué)雷,蘭培英,胡慧,王亞賓. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2016(12)
[9]以原核表達(dá)的豬δ冠狀病毒N蛋白為包被抗原的間接ELISA方法的建立[J]. 張帆帆,宋德平,郭楠楠,葉昱,周信榮,李安琪,張敏,彭棋,陳燕君,黃冬艷,唐玉新. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(10)
[10]新發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒屬——丁型冠狀病毒[J]. 王逸雯,黃耀偉. 生命的化學(xué). 2016(04)
博士論文
[1]河南省豬流行性腹瀉病毒遺傳進(jìn)化分析及免疫學(xué)檢測(cè)方法的建立[D]. 李任峰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
碩士論文
[1]中東呼吸綜合征冠狀病毒受體結(jié)合的分子機(jī)制研究[D]. 胡亞偉.安徽大學(xué) 2014
[2]豬傳染性胃腸炎病毒膜蛋白親和多肽的篩選與鑒定[D]. 鄒昊.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]豬流行性腹瀉病毒S、M、ORF3基因的克隆和序列分析[D]. 李衡.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]豬傳染性胃腸炎病毒的分離鑒定及結(jié)構(gòu)基因重組桿狀病毒的構(gòu)建[D]. 冷勇.西南大學(xué) 2013
[5]攜PEDV M、N基因的減毒沙門氏菌株構(gòu)建及其免疫原性研究[D]. 任玉鵬.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[6]兩種豬腸道冠狀病毒診斷方法的建立和國(guó)內(nèi)新分離毒株主要結(jié)構(gòu)蛋白基因克隆與序列分析[D]. 楊群.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
[7]三株豬流行性腹瀉病毒的Envelope(Small Membrane,sM)編碼基因的序列測(cè)定比較[D]. 劉春艷.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2003
本文編號(hào):3268708
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3268708.html
最近更新
教材專著