肌肉生長是由許多因子共同調(diào)節(jié)的復雜生化過程，肌細胞增強因子2C（myocyteenhancer factor2C, MEF2C）是一類在肌肉發(fā)育中發(fā)揮關(guān)鍵作用的轉(zhuǎn)錄因子。MEF2C基因可以通過同源或異源二聚體結(jié)合到肌肉特異性基因控制區(qū)域的A/T富集序列來激活肌肉基因表達，也可以通過其DNA結(jié)合域與其他因子互作來調(diào)控骨骼肌發(fā)育。MEF2C基因?qū)τ诩∪獍l(fā)育至關(guān)重要。然而，目前關(guān)于MEF2C基因的研究主要集中在人和小鼠骨骼肌和心肌的發(fā)生機制上，在畜禽中相關(guān)研究還很少。本研究通過生物信息學分析、測序和分子生物學等技術(shù)方法，對牛MEF2C基因的結(jié)構(gòu)、遺傳變異和組織表達等進行研究。初步探究牛MEF2C基因在肌肉發(fā)生中的作用，揭示對黃牛重要生長性狀有顯著效應(yīng)的分子標記，為進一步改良我國黃牛品種的經(jīng)濟性狀提供理論基礎(chǔ)。本研究的主要成果如下：1.黃牛MEF2C基因遺傳變異研究本試驗首先通過DNA池測序和限制性片段長度多態(tài)性聚合酶鏈式反應(yīng)（ForcedPCR-RFLP）技術(shù)鑒定和檢測了MEF2C基因在5個中國黃牛品種及其雜交群共1095頭黃牛中的遺傳變異。發(fā)現(xiàn)了4個位于內(nèi)含子中的多態(tài)位點，分別命名為SNP... 

【文章來源】：西北農(nóng)林科技大學陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：73 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

牛基因組DNA的電泳檢測Fig.2-1ElectrophoresisdetectofgenomicDNA

圖 2-1 �；蚪M DNA 的電泳檢測Fig. 2-1 Electrophoresis detect of genomic DNA2.2.2 牛 MEF2C 基因 SNP 位點鑒定以 DNA 池為模板，擴增了牛 MEF2C 基因 11 個外顯子。擴增產(chǎn)物測序后，用相關(guān)生物軟件（Chromas）將測序結(jié)果與權(quán)威數(shù)據(jù)庫中提供的 MEF2C 基因原序列比對后，發(fā)現(xiàn) 4 個較為明顯的單核苷酸突變，分別位于第 1、第 3 和第 4 內(nèi)含子中。其中，SNP 1（g.T96732C）位于第 4 內(nèi)含子，SNP 2（g.C76904T）和 SNP 3（g.G76992T）位于第 3內(nèi)含子中，SNP 4（g.A18286C）位于第 1 內(nèi)含子中（圖 2-2）。SNP 1(g.T96732C) SNP2 (g.C76904T)

圖 2-3 4 個突變位點 PCR-RFLP 凝膠電泳類型Fig. 2-3 Electrophoresis patterns of PCR-RFLP analysis at four loci MEF2C 基因遺傳變異的群體遺傳學分析在一個群體中，保持基因的遺傳多樣性，其實質(zhì)即保持群體中所擁有的基因種類數(shù)，于品種資源的保護和育種工作的改進非常重要。因此，為了有效評估分析群體的遺樣性，根據(jù) MEF2C 基因 4 個 SNPs 位點基因分型結(jié)果，利用一些數(shù)據(jù)統(tǒng)計和分析，計算出相關(guān)遺傳多樣性指數(shù)（Nei 1973），結(jié)果如表 2-6 中所示�；蛐秃偷任换蝾l率分析表明，在秦川牛和郟縣紅牛群體中，SNP 1-C-TC，SNPCC，SNP 3-G-GG，SNP 4-A-AA 分別在所屬位點中比其他等位基因和基因型頻率高，屬位點中為主導基因和基因型。依據(jù)多態(tài)信息含量（polymorphism informationent,PIC）等級劃分（Botstein et al. 1980），除了 SNP 3 位點在郟縣紅牛群體中為低度多態(tài)性（PIC<0.25）外，SNP 1、SNP 2 和 SNP 3 在秦川牛和郟縣紅牛中屬于中度性（0.25<PIC<0.50）。而 SNP 4 位點在兩個群體中屬于低度多態(tài)性（PIC<0.25）。根2檢驗，4 個位點的基因型頻率在秦川牛和郟縣紅牛中符合哈代-溫伯格平衡0.05）。在遺傳指數(shù)分析中，4 位點的基因的純合度（heterozygosity,Ho）都大于 0.5，

【參考文獻】：
期刊論文
[1]精料補充料能量水平對早期斷奶犢牦牛生產(chǎn)性能和營養(yǎng)物質(zhì)表觀消化率的影響[J]. 楊俊,王之盛,保善科,王威,薛白,張海波,鄒華圍.  動物營養(yǎng)學報. 2013(09)
[2]MEF2基因家族的研究進展[J]. 程波,李利,王林杰,張紅平.  中國畜牧雜志. 2012(15)
[3]日糧能量水平對中衛(wèi)山羊羯羊生長與屠宰性能的影響[J]. 俞春山,葉勇,賈弟林,張振偉,薛劍峰,張兵,閆宏.  中國草食動物. 2011(01)
[4]Effects of Different Energy Levels on Nutrient Utilization and Serum Biochemical Parameters of Early-Weaned Calves[J]. ZHANG Rong, DIAO Qi-yu, ZHANG Nai-feng, TU Yan and JIANG Cheng-gang Feed Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, P.R.China.  Agricultural Sciences in China. 2010(05)
[5]內(nèi)參基因在實時定量PCR中應(yīng)用的研究進展[J]. 董曉麗,王加啟,卜登攀,張春林,李珊珊,趙國琦.  中國畜牧獸醫(yī). 2009(09)
[6]Mef2c真核表達載體的構(gòu)建及其在HEK293T細胞中的表達[J]. 溫見燕,于長安,楊鵬,陰彬,李耿,柯元南,廖文強.  山東醫(yī)藥. 2009(04)
[7]中國肉牛分子育種研究進展[J]. 陳宏,張春雷.  中國牛業(yè)科學. 2008(04)
[8]不同生長階段雜交肉牛生產(chǎn)性能的研究[J]. 張京躍,呂愛軍,穆阿麗,楊在賓.  中國草食動物. 2007(01)
[9]SHEsis,a powerful software platform for analyses of linkage disequilibrium,haplotype construction,and genetic association at polymorphism loci[J]. Yong Yong SHI1,2, Lin HE2,3,*1Bio-X Life Science Research Center, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China;2Institute for Nutritional Sciences, Shanghai Institute of Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences, Shanghai,China;3NHGG, Bio-X Center, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China.  Cell Research. 2005(02)
[10]轉(zhuǎn)錄因子MEF2對多種信號通路的調(diào)節(jié)及其生物學作用[J]. 張文煒,徐列明.  中國生物化學與分子生物學報. 2004(04)

博士論文
[1]MEF2A基因原核表達系統(tǒng)構(gòu)建及黃牛MEF2A、DLK1和CLPG基因遺傳分析[D]. 陳付英.西北農(nóng)林科技大學 2010
[2]黃牛能量平衡調(diào)控候選基因遺傳變異及其與生長性狀相關(guān)分析[D]. 張春雷.西北農(nóng)林科技大學 2007

碩士論文
[1]西雜牛PPARγ2、PGC-1α、MEF2C基因表達量及其與肌內(nèi)脂肪含量、嫩度的相關(guān)分析[D]. 李健.四川農(nóng)業(yè)大學 2010
[2]涼山半細毛羊Mef2A、Mef2C基因克隆與組織時空表達[D]. 吳忠海.四川農(nóng)業(yè)大學 2010
[3]黃牛NPM1、SREBP1c基因的克隆、SNPs檢測及其與生長性狀的關(guān)系[D]. 黃永震.西北農(nóng)林科技大學 2010
[4]豬MEF2C和MEF2D基因定位及MEF2C基因的表達研究[D]. 吳俊紅.浙江大學 2009
[5]豬骨骼肌衛(wèi)星細胞的培養(yǎng)、鑒定及豬MEF2B和MEF2C基因的初步研究[D]. 何波.華中農(nóng)業(yè)大學 2006



本文編號：3268135