馬、驢Y-STR與Y-CNV遺傳變異及其睪丸組織轉(zhuǎn)錄組研究
發(fā)布時(shí)間:2021-07-04 12:39
線粒體DNA與Y染色體微衛(wèi)星(Y-STR)、Y染色體單核苷酸多態(tài)性(Y-SNP)標(biāo)記是研究動(dòng)物母系與父系遺傳變異與起源進(jìn)化的重要工具。利用常染色體微衛(wèi)星標(biāo)記和線粒體基因組分析馬、驢遺傳多樣性、起源進(jìn)化的研究很多,但利用Y染色體雄性特異區(qū)Y-STR和Y染色體拷貝數(shù)變異(Y-CNV)研究馬屬動(dòng)物遺傳變異的報(bào)道甚少。Y-CNV可以揭示動(dòng)物Y染色體雄性特異區(qū)基因的拷貝數(shù)變異,該變異與雄性繁殖力性狀密切相關(guān)。許多物種的Y染色體基因拷貝數(shù)已被鑒定,但馬和驢Y染色體基因的拷貝數(shù)變異未見報(bào)道。睪丸組織是精子發(fā)生的場(chǎng)所,了解公畜睪丸組織基因差異表達(dá)及microRNAs的表達(dá)對(duì)提高雄性繁殖力非常重要。隱睪癥是單側(cè)或雙側(cè)睪丸未下降至陰囊的先天性畸形,會(huì)降低動(dòng)物繁殖力。因此,研究馬正常睪丸與隱睪間的差異表達(dá)基因,對(duì)揭示動(dòng)物隱睪的遺傳機(jī)理及導(dǎo)致繁殖力下降的原因十分重要。本研究利用熒光微衛(wèi)星方法分析了馬、驢Y染色體遺傳多樣性與父系起源;利用實(shí)時(shí)熒光定量方法鑒定了馬、驢Y染色體基因的拷貝數(shù)變異;利用RNA-seq和生物信息學(xué)方法分析了馬正常睪丸和隱睪的差異表達(dá)基因和microRNAs表達(dá)差異,中國(guó)地方驢睪丸組織的差...
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:185 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
MSY常染色質(zhì)序列分子進(jìn)化途徑
不同顏色區(qū)分 X 基因在 Y 染色體上同源基因的類(藍(lán)色);X-轉(zhuǎn)座基因(粉色)。圖中四個(gè)黃色矩形代表 4 Skaletsky et al. 2003)。 Ks versus X-linked gene order for 31 X–Y gene (or gene/pseudo-linked gene names indicates whether Y homologues are X-degenX-transposed (pink). Within the plot, four yellow rectangles denofined ‘evolutionary strata’ (Adapted from Skaletsky et al. 2003).
鎖基因及其 Ks。不同顏色區(qū)分 X 基因在 Y 染色體上同源基因的類型:基因(藍(lán)色);X-轉(zhuǎn)座基因(粉色)。圖中四個(gè)黃色矩形代表 4 個(gè)進(jìn)化Skaletsky et al. 2003)。 Plot of Ks versus X-linked gene order for 31 X–Y gene (or gene/pseudogene) g of X-linked gene names indicates whether Y homologues are X-degenerate (ue) or X-transposed (pink). Within the plot, four yellow rectangles denote foudefined ‘evolutionary strata’ (Adapted from Skaletsky et al. 2003).
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]馬基因組研究進(jìn)展[J]. 楊虹,馬月輝,李蓓,芒來(lái). 遺傳. 2010(03)
[2]應(yīng)用微衛(wèi)星標(biāo)記分析23個(gè)中國(guó)地方馬種的遺傳多樣性[J]. 凌英會(huì),成月嬌,王艷萍,關(guān)偉軍,韓建林,傅寶玲,趙倩君,何曉紅,浦亞斌,馬月輝. 生物多樣性. 2009(03)
[3]中國(guó)8個(gè)地方驢種遺傳多樣性和系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系的微衛(wèi)星分析[J]. 朱文進(jìn),張美俊,葛慕湘,關(guān)學(xué)敏,蘇詠梅,姜玉鎖,張桂賢,郭傳甲. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2006(02)
本文編號(hào):3264803
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:185 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
MSY常染色質(zhì)序列分子進(jìn)化途徑
不同顏色區(qū)分 X 基因在 Y 染色體上同源基因的類(藍(lán)色);X-轉(zhuǎn)座基因(粉色)。圖中四個(gè)黃色矩形代表 4 Skaletsky et al. 2003)。 Ks versus X-linked gene order for 31 X–Y gene (or gene/pseudo-linked gene names indicates whether Y homologues are X-degenX-transposed (pink). Within the plot, four yellow rectangles denofined ‘evolutionary strata’ (Adapted from Skaletsky et al. 2003).
鎖基因及其 Ks。不同顏色區(qū)分 X 基因在 Y 染色體上同源基因的類型:基因(藍(lán)色);X-轉(zhuǎn)座基因(粉色)。圖中四個(gè)黃色矩形代表 4 個(gè)進(jìn)化Skaletsky et al. 2003)。 Plot of Ks versus X-linked gene order for 31 X–Y gene (or gene/pseudogene) g of X-linked gene names indicates whether Y homologues are X-degenerate (ue) or X-transposed (pink). Within the plot, four yellow rectangles denote foudefined ‘evolutionary strata’ (Adapted from Skaletsky et al. 2003).
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]馬基因組研究進(jìn)展[J]. 楊虹,馬月輝,李蓓,芒來(lái). 遺傳. 2010(03)
[2]應(yīng)用微衛(wèi)星標(biāo)記分析23個(gè)中國(guó)地方馬種的遺傳多樣性[J]. 凌英會(huì),成月嬌,王艷萍,關(guān)偉軍,韓建林,傅寶玲,趙倩君,何曉紅,浦亞斌,馬月輝. 生物多樣性. 2009(03)
[3]中國(guó)8個(gè)地方驢種遺傳多樣性和系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系的微衛(wèi)星分析[J]. 朱文進(jìn),張美俊,葛慕湘,關(guān)學(xué)敏,蘇詠梅,姜玉鎖,張桂賢,郭傳甲. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2006(02)
本文編號(hào):3264803
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