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雞腺病毒12個血清型代表毒株P(guān)enton蛋白基因分析

發(fā)布時間:2021-07-03 05:57
  為了解雞腺病毒(fowl adenovirus,FAdV)Penton基因的遺傳進化規(guī)律,試驗根據(jù)GenBank中已公布的各基因型序列設計特異性引物,通過PCR技術(shù)分別擴增12個血清型毒株的Penton基因,連接至pEASY-Blunt Simple Cloning Vector上進行序列測定,并將12個血清型毒株P(guān)enton蛋白的核苷酸序列與NCBI上已公布的標準毒株的核苷酸序列使用ClustalW法進行分析比對,繪制遺傳進化樹。結(jié)果顯示,12種血清型Penton蛋白核苷酸序列與各血清型標準毒株同源性均在99.2%以上,其中FAdV-1、FAdV-2、FAdV-3、FAdV-4、FAdV-6、FAdV-7、FAdV-8a、FAdV-8b、FAdV-10、FAdV-11與對應標準株同源性高達100%,這進一步證實了實驗室保存毒株與世界相應標準毒株的一致性。Penton蛋白雖然保守性較高,但不同種之間仍存在明顯差異。FAdV-A1與其他種毒株同源性為70.6%~73.3%;FAdV-B5與其他種毒株同源性為70.6%~77.9%;FAdV-C同種不同血清型之間核苷酸同源性為99.6%,F... 

【文章來源】:中國畜牧獸醫(yī). 2020,47(11)北大核心

【文章頁數(shù)】:10 頁

【部分圖文】:

雞腺病毒12個血清型代表毒株P(guān)enton蛋白基因分析


Penton基因核苷酸序列同源性比對

核苷酸序列,基因,血清型,基因型


圖4 Penton基因核苷酸序列同源性比對表3 12種血清型毒株BLAST結(jié)果Table 3 BLAST results of 12 serotype strains % 基因型Genotypes 血清型Serotypes 基因型Genotypes A B C D E A FAdV-1 99.03~100.00 78.30 75.11~75.25 75.45~76.21 77.23~77.58 B FAdV-5 \\ 99.02~99.20 76.09~76.45 79.44~80.45 82.00~82.70 C FAdV-4 98.49 \\ 98.86~100.00 76.06~76.26 77.97~78.24 FAdV-10 98.61 \\ 98.99~100.00 76.11~76.31 78.07~78.31 D FAdV-2 \\ 80.03~80.24 76.26~76.47 95.54~100.00 83.80~84.82 FAdV-3 \\ 79.87~80.08 75.47~75.68 95.62~100.00 84.01~84.98 FAdV-9 \\ 79.44~79.72 75.74~75.88 95.48~99.94 83.83~85.05 FAdV-11 \\ 80.10~80.31 76.09~76.31 95.54~100.00 84.32~85.18 E FAdV-6 \\ 82.42~82.43 78.05~78.35 84.39~85.05 97.83~100.00 FAdV-7 76.48~76.86 81.93~81.94 77.25~78.61 83.76~84.62 97.42~100.00 FAdV-8a \\ 81.93~82.08 78.37~78.58 83.86~84.70 97.72~100.00 FAdV-8b \\ 82.35~82.36 78.34~78.55 84.58~85.31 97.71~100.00 \,無此項\,There is no such item

基因,血清型,毒株


以各血清型毒株DNA為模板,使用設計的5對引物擴增Penton基因,得到各血清型的Penton基因長度約為1 831、1 899、1 691、1 794和1 774 bp(圖1),均與預期片段大小一致。2.2 不同毒株之間Penton基因的遺傳進化分析

【參考文獻】:
期刊論文
[1]禽腺病毒W(wǎng)株Hexon基因的分子特征及其致雞胚侏儒化研究[J]. 陳田田,劉琳,趙玉杰,劉建勛,王賽楠,何春輝,李新生.  畜牧與獸醫(yī). 2019(09)
[2]Ⅰ群禽腺病毒hexon基因分型與序列分析[J]. 朱小甫,吳旭錦.  動物醫(yī)學進展. 2018(10)
[3]新型雞心包炎—包涵體肝炎病毒的分離及鑒定[J]. 汪凱,蔡驍垚,葉建強,劉紅梅,張泉,劉芹防,李澤君,陳鴻軍.  中國動物傳染病學報. 2016(04)



本文編號:3262008

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