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NDV、IBV和ILTV診斷基因芯片的構(gòu)建及初步應用

發(fā)布時間:2021-06-14 03:18
  雞新城疫(Newcastle disease, ND)、傳染性支氣管炎(Infectious bronchitis,IB)和傳染性喉氣管炎(Infectious laryngotracheitis, ILT)是危害養(yǎng)禽業(yè)的主要呼吸道疫病。生產(chǎn)中臨床癥狀的相似性,使其檢測成為一個難題,快速聯(lián)合共檢新城疫、傳染性支氣管炎和傳染性喉氣管炎方法的建立具有重要意義。本研究以NDV、 IBV和ILTV為研究對象,構(gòu)建了一套禽呼吸道疫病共檢基因芯片,該芯片用于對NDV、IBV和ILTV的快速臨床檢測。本研究主要完成工作如下:1.探針質(zhì)粒菌的克隆及鑒定本試驗制備了3種病毒的6個探針質(zhì)粒菌。試驗針對NDV、IBV、ILTV基因組進行比對分析后,分別選取NDV、IBV、ILTV的2個保守基因,共設計了6對探針基因引物。試驗以NDV LaSota株、IBV H120株和ILTV標準株為材料,用RNA/DNA試劑盒抽提病毒RNA和DNA,以反轉(zhuǎn)錄后的cDNA和DNA為模板,PCR擴增獲得6個探針基因,分別為NDV-F (440 bp)、NDV-HN (465 bp)、IBV-M (368 bp)、IBV-N ... 

【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學四川省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:86 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

NDV、IBV和ILTV診斷基因芯片的構(gòu)建及初步應用


圖3-2基因芯片點樣設置??Fig.?3-2?The?design?of?DNA?microarray?spotting??2.?3.?3點樣后處理??

掃描圖像,基片,不合格,基因芯片


基基片對高溫幾乎不敏感,最終選擇使用氨基基片作為本試驗的基因芯、片基片。??本試驗基因芯片基片選玻璃基片,所用載玻片為氨基修飾的英光惰性的光學級??載玻片,合格基片和不合格基片的掃描圖像見圖3-5。基因芯片點制結(jié)束后都需要??進行抽檢掃描,確保沒有漏點。??圖3-5合格和不合格基片的掃描圍像??Fig.3-5?Qualified?and?unqualified?scanning?images??42??

掃描圖像,樣液,不同點,點樣


氨基基片和醒基基片的點樣液均不能使用含有游離氨基的緩沖液(如Tris),這會抑??制DNA與基片表面氨基基團的結(jié)合。??不同點樣緩沖液在點樣后掃描的結(jié)果見圖3-6。選用3?X?SSC點樣肘,提取到的??信號標準差、背景標準差分別為662.3、552.3,而選用BaiO⑥點樣液點樣時,提取??到的信號標準差、背景標準差分別為321.1、66.6。??Rowl;?3xSSC;??Row?2;?BaiO??printing?buffer??圖3-6不同點樣液點樣的形態(tài)比較??Fig.3-6?The?spot?morphology?of?differ^ent?printing?buffer??結(jié)果表明,選。常兀樱樱米鳛辄c樣緩沖液點樣時,樣點面積比較大,邊緣不規(guī)??貝IJ;選。拢幔椋希奎c樣緩沖液點樣時,樣點面積比較小、形狀均一規(guī)則,而且各參數(shù)??比較理想。因此,最終確定選取BaiO⑥點樣緩沖液作為點樣緩沖液。??3.3.3不同點樣濕度的選擇??在4個不同的點樣濕度(50%、60%、70%、80%)條件下分別進行點樣,80??°C烘干后進行掃描,W確定不同的點樣濕度對樣點的影響,??不同濕度下點樣的形態(tài)掃描圖像見圖3-7。由團可見,在50%濕度W下點樣時,??樣點容易出現(xiàn)點濃縮的現(xiàn)象

【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]雞傳染性喉氣管炎病毒的分離鑒定與PCR檢測方法的建立[D]. 張明偉.河南農(nóng)業(yè)大學 2009



本文編號:3228952

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