FMDV感染對(duì)腸道菌群及Ⅰ型干擾素對(duì)FMDV感染的影響
發(fā)布時(shí)間：2021-06-06 19:52
口蹄疫（FMD）是由口蹄疫病毒感染引起豬、牛、羊等偶蹄動(dòng)物的一種急性,烈性傳染病,給我國(guó)畜牧業(yè)健康發(fā)展造成巨大威脅。目前,對(duì)于FMD大部分的研究主要集中于口蹄疫病理及病因上,而對(duì)宿主感染FMDV后腸道菌群的變化狀況卻鮮有報(bào)道。利用Illumina高通量測(cè)序技術(shù),我們研究了口蹄疫病毒感染對(duì)乳鼠腸道菌群的影響。研究發(fā)現(xiàn)在門水平,與對(duì)照組相比,口蹄疫病毒感染顯著提高了乳鼠腸道中Proteobacteria的豐度,而降低了Fusobacteria和Firmicutes的豐度。在屬水平,與對(duì)照組相比,口蹄疫病毒感染顯著降低了Fusobacterium的豐度。由此可見,口蹄疫病毒感染與乳鼠腸道微生物菌群多樣性及物種豐度的變化存在關(guān)聯(lián)性。為了進(jìn)一步研究抗病毒狀態(tài)下腸道菌群的情況,首先我們對(duì)I型干擾素的IFN-ε,δ,ω,αω亞型進(jìn)行了研究。近幾年的研究顯示epsilon干擾素在病毒急性期感染期間并不會(huì)導(dǎo)致它的上調(diào),它在FMDV感染的表達(dá)情況未見報(bào)道。首先我們通過建立檢測(cè)小鼠epsilon干擾素的實(shí)時(shí)熒光定量方法,檢測(cè)了乳鼠IFN-ε在感染前后及不同時(shí)間段的變化,發(fā)現(xiàn)IFN-εmRNA轉(zhuǎn)錄水平在乳鼠感...
【文章來源】：中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】：64 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
型干擾素的信號(hào)通路Figure1.TypeIInterferonSignalingPathway
分析軟件對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析，顯著性分析采用單因素方差有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。的分類學(xué)鑒定中共收集了 26 個(gè)糞便樣品用于測(cè)序后續(xù)的分析，共產(chǎn)生 1相應(yīng)的平均每個(gè)樣本為 11612 條序列（范圍從 7882 到 128每個(gè)樣品序列長(zhǎng)度分布見圖 2.1。此外，稀釋曲線基本達(dá)到檢測(cè)到，并且測(cè)序量能夠反應(yīng)樣品中絕大部分的微生物信息OTUs 劃分為不同類別，包括門，類，聚，科和屬水平。將至 OTU 用于后續(xù)的分析。根據(jù)獲得的 OTU 數(shù)據(jù)來制作每個(gè)樣覆蓋率。在這些樣品中共有 9 門，14 類，20 個(gè)目，39 個(gè)科
圖 2.2 乳鼠腸道樣本測(cè)序序列稀釋曲線（相似度：97%）.2 Rarefaction curve of sequenced reads in feces of mice (similari腸道菌群在門類水平的變化情況 組中優(yōu)勢(shì)細(xì)菌的百分比為 80%的 Firmicutes，2.27%% Actinobacteria，而在 FF 組乳鼠中的百分比分別為對(duì)照組與病毒感染組腸道微生物中也主要由 Firmacteria 組成（圖 2.4，2.5，2.6）。盡管如此，病毒異（圖 2.4），例如在聚類水平上，口蹄疫病毒感染icutes 和 Fusobacteria 降低了。圖 2.6 呈現(xiàn)了腸道微heatmap），結(jié)果表明 FF 組小鼠腸道微生物結(jié)構(gòu)發(fā)
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]小鼠干擾素limitin蛋白的表達(dá)及其鑒定[J]. 龔美嬌,程翠翠,馬炳,代軍飛,張杰,王雯慧. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2018(03)
[2]Pathological and therapeutic interactions between bacteriophages,microbes and the host in inflammatory bowel disease[J]. Janka Babickova,Roman Gardlik. World Journal of Gastroenterology. 2015(40)
[3]Inflammatory bowel disease in the dog:Differences and similarities with humans[J]. Matteo Cerquetella,Andrea Spaterna,Fulvio Laus,Beniamino Tesei,Giacomo Rossi,Elisabetta Antonelli,Vincenzo Villanacci,Gabrio Bassotti. World Journal of Gastroenterology. 2010(09)
本文編號(hào)：3215032
【文章來源】：中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】：64 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
型干擾素的信號(hào)通路Figure1.TypeIInterferonSignalingPathway
分析軟件對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析，顯著性分析采用單因素方差有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。的分類學(xué)鑒定中共收集了 26 個(gè)糞便樣品用于測(cè)序后續(xù)的分析，共產(chǎn)生 1相應(yīng)的平均每個(gè)樣本為 11612 條序列（范圍從 7882 到 128每個(gè)樣品序列長(zhǎng)度分布見圖 2.1。此外，稀釋曲線基本達(dá)到檢測(cè)到，并且測(cè)序量能夠反應(yīng)樣品中絕大部分的微生物信息OTUs 劃分為不同類別，包括門，類，聚，科和屬水平。將至 OTU 用于后續(xù)的分析。根據(jù)獲得的 OTU 數(shù)據(jù)來制作每個(gè)樣覆蓋率。在這些樣品中共有 9 門，14 類，20 個(gè)目，39 個(gè)科
圖 2.2 乳鼠腸道樣本測(cè)序序列稀釋曲線（相似度：97%）.2 Rarefaction curve of sequenced reads in feces of mice (similari腸道菌群在門類水平的變化情況 組中優(yōu)勢(shì)細(xì)菌的百分比為 80%的 Firmicutes，2.27%% Actinobacteria，而在 FF 組乳鼠中的百分比分別為對(duì)照組與病毒感染組腸道微生物中也主要由 Firmacteria 組成（圖 2.4，2.5，2.6）。盡管如此，病毒異（圖 2.4），例如在聚類水平上，口蹄疫病毒感染icutes 和 Fusobacteria 降低了。圖 2.6 呈現(xiàn)了腸道微heatmap），結(jié)果表明 FF 組小鼠腸道微生物結(jié)構(gòu)發(fā)
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]小鼠干擾素limitin蛋白的表達(dá)及其鑒定[J]. 龔美嬌,程翠翠,馬炳,代軍飛,張杰,王雯慧. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2018(03)
[2]Pathological and therapeutic interactions between bacteriophages,microbes and the host in inflammatory bowel disease[J]. Janka Babickova,Roman Gardlik. World Journal of Gastroenterology. 2015(40)
[3]Inflammatory bowel disease in the dog:Differences and similarities with humans[J]. Matteo Cerquetella,Andrea Spaterna,Fulvio Laus,Beniamino Tesei,Giacomo Rossi,Elisabetta Antonelli,Vincenzo Villanacci,Gabrio Bassotti. World Journal of Gastroenterology. 2010(09)
本文編號(hào)：3215032
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