蛋殼基質(zhì)蛋白卵黃蛋白原-32基因（ovocalyxin-32, OCX-32）是影響蛋殼礦化的一種特異性基質(zhì)蛋白。為了探討蛋殼基質(zhì)蛋白OCX-32基因變異對雞蛋殼品質(zhì)的遺傳效應,本研究以長順綠殼蛋雞（Gallus gallus）為素材,測定其蛋殼品質(zhì),采用PCR產(chǎn)物純化直接測序法對OCX-32基因進行SNPs篩查,分析其對蛋殼品質(zhì)的影響。結果表明,在長順綠殼蛋雞OCX-32基因中檢測到3個中度多態(tài)的SNPs位點,分別位于內(nèi)含子1的g.22592362 C>T突變、外顯子6的g.22599114 C>T錯義突變（蘇氨酸變?yōu)榧琢虬彼幔┖蚲.22599127 G>A同義突變,均產(chǎn)生3種基因型;g.22599114 C>T和g.22599127 G>A突變位點的基因型分布均偏離了Hardy-Weinberg平衡（P<0.05）。3個SNPs突變位點不存在強連鎖不平衡,共發(fā)現(xiàn)4種單倍型和10種雙倍型。生物信息學分析發(fā)現(xiàn),g.22599114 C>T和g.22599127 G>A突變可引起mRNA自由能和蛋白結構的變化,CG組合的自由能為-338.9... 

【文章來源】：農(nóng)業(yè)生物技術學報. 2020,28(03)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：10 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 實驗動物與器材
    1.2 引物設計
    1.3 PCR擴增
    1.4 OCX-32基因mRNA二級結構和蛋白質(zhì)高級結構預測
    1.5 統(tǒng)計分析
2 結果與分析
    2.1 OCX-32基因PCR擴增
    2.2 OCX-32基因SNPs鑒定
    2.3 OCX-32基因SNPs位點部分遺傳特性分析
    2.4 OCX-32基因SNPs位點的連鎖不平衡、單倍型及雙倍型分析
T和g.22599127G>A位點對mRNA二級結構的影響">    2.5 OCX-32基因g.22599114 C>T和g.22599127G>A位點對mRNA二級結構的影響
    2.6 OCX-32基因蛋白質(zhì)二級結構和三級結構預測
    2.7 OCX-32基因SNPs位點與長順綠殼蛋雞蛋殼品質(zhì)的關聯(lián)性分析
3 討論
4 結論


【參考文獻】：
期刊論文
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[6]防護林散養(yǎng)草雞不同產(chǎn)蛋期蛋形、蛋殼指數(shù)比較[J]. 楊智青,陳應江,金崇富,丁海榮,時凱,陳長寬.  畜牧獸醫(yī)雜志. 2013(06)
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博士論文
[1]雞蛋殼超微結構與晶體結構的測定及全基因組關聯(lián)分析[D]. 段忠意.中國農(nóng)業(yè)大學 2017

碩士論文
[1]汶上蘆花雞蛋品質(zhì)及其候選基因遺傳效應分析[D]. 夏佳豪.山東農(nóng)業(yè)大學 2018
[2]鴨 MyoD1、SCD1、DRD1 基因變異對肉質(zhì)和血清生化指標的遺傳效應研究[D]. 潘蘭兵.貴州大學 2014



本文編號：3201250