為了探究綿羊脂多糖結(jié)合蛋白（LBP）基因的分子特性,試驗采用生物信息學(xué)方法對綿羊LBP基因及其編碼蛋白的開放閱讀框、理化性質(zhì)、疏水性、信號肽、跨膜結(jié)構(gòu)域、功能結(jié)構(gòu)域、二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)、三級模型、互作關(guān)系、系統(tǒng)進化樹進行了預(yù)測研究。結(jié)果表明:綿羊LBP基因的開放閱讀框長度為1 445 bp,編碼481個氨基酸,分子質(zhì)量為53.481 ku,理論等電點為8.18,屬于穩(wěn)定的堿性蛋白;親水性區(qū)域明顯多于疏水性區(qū)域,LBP蛋白為親水性蛋白;LBP蛋白可能含有的信號肽結(jié)構(gòu)在1～25位氨基酸處,無跨膜結(jié)構(gòu);LBP基因?qū)儆贐PI超家族,其具有BPI1和BPI2兩個主結(jié)構(gòu)域;α-螺旋和無規(guī)則卷曲是LBP蛋白二級結(jié)構(gòu)的主要形式;三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果與二級結(jié)構(gòu)相符,可信度高;LBP蛋白與乙醇脫氫酶（ADhFE1）及白細胞介素-6（IL-6）等互作;綿羊LBP基因與黃牛進化距離最近,其親緣關(guān)系較近。說明利用生物信息學(xué)方法分析綿羊LBP基因可初步揭示和驗證綿羊LBP基因及其編碼蛋白的結(jié)構(gòu)和功能。 

【文章來源】：黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(13)北大核心

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 LBP基因序列
    1.2 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 綿羊LBP基因開放閱讀框
    2.2 綿羊LBP基因編碼蛋白的理化性質(zhì)
    2.3 綿羊LBP基因編碼蛋白的親疏水性
    2.4 綿羊LBP基因編碼蛋白信號肽、跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測
    2.5 綿羊LBP基因編碼蛋白功能結(jié)構(gòu)域預(yù)測
    2.6 綿羊LBP基因編碼蛋白二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測
    2.7 綿羊LBP基因編碼蛋白三級結(jié)構(gòu)的預(yù)測及模型評價
    2.8 綿羊LBP基因編碼蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析
    2.9 綿羊LBP基因系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建及同源性分析
3 討論與結(jié)論


【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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[3]脂多糖結(jié)合蛋白功能位點分析及其抑制性多肽的篩選[D]. 徐德斌.第三軍醫(yī)大學(xué) 2004



本文編號：3190401