哈薩克綿羊DRB1基因外顯子1和4多態(tài)性與布魯氏菌病的相關(guān)性研究
發(fā)布時間:2021-05-11 08:36
試驗(yàn)旨在對哈薩克綿羊DRB1基因外顯子1和4多態(tài)性與布魯氏菌病的相關(guān)性進(jìn)行研究。使用虎紅平板凝集試驗(yàn)(RBPT)對試羊的血清進(jìn)行血清學(xué)檢測,參考GenBank中綿羊MHC ClassⅡ區(qū)DRB1基因序列(登錄號:NC040271.1),對其外顯子1和4片段設(shè)計引物,采用PCR-SSCP和DNA測序技術(shù)對230只哈薩克綿羊的DRB1基因進(jìn)行多態(tài)性檢測,分析其多態(tài)位點(diǎn)與哈薩克綿羊布魯氏菌易感性之間的關(guān)系。RBPT檢測發(fā)現(xiàn)66只哈薩克綿羊?yàn)椴剪斒暇腥娟栃?陽性檢出率為28.7%。外顯子1片段存在一個SNP位點(diǎn)(F1-G22A),測序確定兩種基因型(GG、GA),優(yōu)勢等位基因和基因型分別為G、GG,F1-G22A多態(tài)位點(diǎn)的易感基因型為GA?ǚ綑z驗(yàn)表明,哈薩克綿羊DRB1基因F1-G22A多態(tài)位點(diǎn)與布魯氏菌易感性的相關(guān)性不顯著(P>0.05)。通過生物信息學(xué)在線軟件分析得出,F1-G22A多態(tài)位點(diǎn)導(dǎo)致了RNA二級結(jié)構(gòu)的改變和最小自由能的降低,引起了蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的改變。DRB1基因外顯子4片段未發(fā)現(xiàn)SNPs。由此得出,哈薩克綿羊DRB1基因F1-G22A多態(tài)位點(diǎn)與...
【文章來源】:中國畜牧獸醫(yī). 2020,47(12)北大核心
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 樣品來源
1.1.2 主要試劑和儀器
1.2 方法
1.2.1 布魯氏菌病檢測
1.2.2 哈薩克綿羊基因組DNA的提取及PCR擴(kuò)增
1.2.3 哈薩克綿羊DRB1基因的SSCP分析
1.2.4 測序分析
1.2.5 統(tǒng)計分析及生物信息學(xué)分析
2 結(jié) 果
2.1 布魯氏菌病檢測
2.2 哈薩克綿羊DRB1基因外顯子1、外顯子4 PCR擴(kuò)增
2.3 哈薩克綿羊DRB1基因外顯子1和外顯子4多態(tài)性分析
2.4 哈薩克綿羊DRB1基因外顯子1多態(tài)位點(diǎn)F1-G22A與布魯氏菌易感性的相關(guān)性分析
2.5 F1-G22A多態(tài)位點(diǎn)生物信息學(xué)分析
2.6 易感布魯氏菌哈薩克綿羊DRB1基因外顯子1 F1-G22A基因型分析
3 討 論
4 結(jié) 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]布魯氏菌BP26蛋白的原核表達(dá)及鑒定[J]. 魯友銘,李俊萱,吳勝昔,曾政,黃恒,李令臣,侯力嘉. 重慶理工大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)). 2019(10)
[2]新疆畜間布魯氏菌病免疫評估與防控模式研究[J]. 劉文進(jìn),何成武,寧多武,宋煥堂,李艷. 家畜生態(tài)學(xué)報. 2019(10)
[3]哈薩克羊DRB1基因外顯子3多態(tài)性及生物信息學(xué)分析[J]. 王元元,嚴(yán)國,羅成,齊江姣,周光普,譚君,高劍峰. 中國畜牧獸醫(yī). 2018(03)
[4]改良試管凝集試驗(yàn)和虎紅平板凝集試驗(yàn)檢測羊布魯氏菌病結(jié)果比較[J]. 馮華. 中國草食動物科學(xué). 2017(04)
[5]甘肅高山細(xì)毛羊DRB1基因內(nèi)含子2微衛(wèi)星多態(tài)性與生長速度的關(guān)聯(lián)分析[J]. 成述儒,王華,樊慶山,王欣榮,張利平,吳建平. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2016(12)
[6]貴州白山羊DRA和DRB1基因的表達(dá)差異分析[J]. 黃蘭,徐偉,封竣淇,劉彬,康建兵,錢成,蔡惠芬,羅衛(wèi)星. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(08)
[7]中國美利奴羊OLA-DQB1基因exon 2遺傳多態(tài)性與布魯氏菌病易感性的關(guān)聯(lián)分析[J]. 王文文,許萬云,胡夢薇,李建華,劉朋濤,高劍峰. 中國畜牧獸醫(yī). 2015(06)
[8]綿羊和人主要組織相容性復(fù)合體DRB1基因外顯子2多態(tài)性及生物信息學(xué)分析[J]. 陳月娥,李建華,茍亞峰,王文文,朱軍保,高劍峰. 中國畜牧獸醫(yī). 2014(04)
[9]羊布魯氏菌病的危害與防治[J]. 張廣俊. 四川畜牧獸醫(yī). 2013(01)
[10]藏綿羊MHC-DRB1基因第3外顯子的PCR-SSCP檢測及其序列分析[J]. 徐飛,成述儒,劉秀,王繼卿,胡江,羅玉柱. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2011(05)
博士論文
[1]吉林省布魯氏菌流行株種屬鑒定及其耐藥分子機(jī)制的研究[D]. 孫麗媛.吉林大學(xué) 2011
碩士論文
[1]中國美利奴羊MHC-DRB1 exon2單倍型構(gòu)建及與布魯氏菌病易感性關(guān)聯(lián)性[D]. 陳月娥.石河子大學(xué) 2014
[2]甘肅高山細(xì)毛羊微衛(wèi)星親子鑒定及DRB1基因第3外顯子多態(tài)性研究[D]. 李潔.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
本文編號:3181101
【文章來源】:中國畜牧獸醫(yī). 2020,47(12)北大核心
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 樣品來源
1.1.2 主要試劑和儀器
1.2 方法
1.2.1 布魯氏菌病檢測
1.2.2 哈薩克綿羊基因組DNA的提取及PCR擴(kuò)增
1.2.3 哈薩克綿羊DRB1基因的SSCP分析
1.2.4 測序分析
1.2.5 統(tǒng)計分析及生物信息學(xué)分析
2 結(jié) 果
2.1 布魯氏菌病檢測
2.2 哈薩克綿羊DRB1基因外顯子1、外顯子4 PCR擴(kuò)增
2.3 哈薩克綿羊DRB1基因外顯子1和外顯子4多態(tài)性分析
2.4 哈薩克綿羊DRB1基因外顯子1多態(tài)位點(diǎn)F1-G22A與布魯氏菌易感性的相關(guān)性分析
2.5 F1-G22A多態(tài)位點(diǎn)生物信息學(xué)分析
2.6 易感布魯氏菌哈薩克綿羊DRB1基因外顯子1 F1-G22A基因型分析
3 討 論
4 結(jié) 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]布魯氏菌BP26蛋白的原核表達(dá)及鑒定[J]. 魯友銘,李俊萱,吳勝昔,曾政,黃恒,李令臣,侯力嘉. 重慶理工大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)). 2019(10)
[2]新疆畜間布魯氏菌病免疫評估與防控模式研究[J]. 劉文進(jìn),何成武,寧多武,宋煥堂,李艷. 家畜生態(tài)學(xué)報. 2019(10)
[3]哈薩克羊DRB1基因外顯子3多態(tài)性及生物信息學(xué)分析[J]. 王元元,嚴(yán)國,羅成,齊江姣,周光普,譚君,高劍峰. 中國畜牧獸醫(yī). 2018(03)
[4]改良試管凝集試驗(yàn)和虎紅平板凝集試驗(yàn)檢測羊布魯氏菌病結(jié)果比較[J]. 馮華. 中國草食動物科學(xué). 2017(04)
[5]甘肅高山細(xì)毛羊DRB1基因內(nèi)含子2微衛(wèi)星多態(tài)性與生長速度的關(guān)聯(lián)分析[J]. 成述儒,王華,樊慶山,王欣榮,張利平,吳建平. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2016(12)
[6]貴州白山羊DRA和DRB1基因的表達(dá)差異分析[J]. 黃蘭,徐偉,封竣淇,劉彬,康建兵,錢成,蔡惠芬,羅衛(wèi)星. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(08)
[7]中國美利奴羊OLA-DQB1基因exon 2遺傳多態(tài)性與布魯氏菌病易感性的關(guān)聯(lián)分析[J]. 王文文,許萬云,胡夢薇,李建華,劉朋濤,高劍峰. 中國畜牧獸醫(yī). 2015(06)
[8]綿羊和人主要組織相容性復(fù)合體DRB1基因外顯子2多態(tài)性及生物信息學(xué)分析[J]. 陳月娥,李建華,茍亞峰,王文文,朱軍保,高劍峰. 中國畜牧獸醫(yī). 2014(04)
[9]羊布魯氏菌病的危害與防治[J]. 張廣俊. 四川畜牧獸醫(yī). 2013(01)
[10]藏綿羊MHC-DRB1基因第3外顯子的PCR-SSCP檢測及其序列分析[J]. 徐飛,成述儒,劉秀,王繼卿,胡江,羅玉柱. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2011(05)
博士論文
[1]吉林省布魯氏菌流行株種屬鑒定及其耐藥分子機(jī)制的研究[D]. 孫麗媛.吉林大學(xué) 2011
碩士論文
[1]中國美利奴羊MHC-DRB1 exon2單倍型構(gòu)建及與布魯氏菌病易感性關(guān)聯(lián)性[D]. 陳月娥.石河子大學(xué) 2014
[2]甘肅高山細(xì)毛羊微衛(wèi)星親子鑒定及DRB1基因第3外顯子多態(tài)性研究[D]. 李潔.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
本文編號:3181101
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