在舍飼養(yǎng)羊生產中,飼草料成本占總成本比例最高,約占65%⁷0%,而且隨著飼料原料價格的不斷上漲,飼草料成本也將日益增加。因此,提高綿羊飼料效率,不僅能充分利用飼草料資源,降低舍飼養(yǎng)羊的飼料成本,提高舍飼養(yǎng)羊經濟效益,而且對于保護生態(tài)環(huán)境、實現可持續(xù)性發(fā)展等具有極其重要的戰(zhàn)略意義。剩余采食量（Residual feed intake,RFI）是衡量綿羊飼料利用效率的理想育種指標。本研究在系統(tǒng)地性能測定基礎上,開展飼料效率相關性狀的特征和遺傳參數估計的研究,結合16S rDNA測序和轉錄組測序技術,探討綿羊RFI與瘤胃微生物區(qū)系及肝臟組織基因表達的關系。1試驗群體構建及飼料效率相關性狀特征分析與遺傳力估計本研究采用單欄飼養(yǎng),系統(tǒng)地測定了來自41個父系半同胞家系的207只80-180d湖羊公羔的RFI、生長性狀、胴體性狀、體組成和肌肉品質等59個性狀（199個指標）。結果表明:湖羊公羔在80-180d期間飼料轉化率（Feed conversion ratio,FCR）隨日齡的增長而升高,全期平均值為5.77,變異系數為10.02%,具有較高的選擇潛力。FCR、RFI、日... 

【文章來源】：蘭州大學甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數】：132 頁

【學位級別】：博士

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中文摘要
Abstract
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第一章 研究背景
    1.1 引言
    1.2 飼料利用效率是綿羊的重要經濟性狀
    1.3 RFI的測定
    1.4 RFI的影響因素
        1.4.1 采食量
        1.4.2 消化吸收
        1.4.3 體組成與新陳代謝
        1.4.4 活動量
        1.4.5 體溫調節(jié)
    1.5 RFI的研究進展
        1.5.1 RFI候選基因的研究
        1.5.2 RFI性狀的轉錄調控研究
        1.5.3 RFI的微生物菌群結構研究
    1.6 本研究的目的與意義
第二章 育肥期湖羊公羔飼料效率相關性狀特征及遺傳參數分析
    2.1 引言
    2.2 材料與方法
        2.2.1 試驗羊群
        2.2.2 性狀測定
        2.2.3 試驗分組與統(tǒng)計分析
    2.3 結果與分析
        2.3.1 飼料效率相關性狀描述性統(tǒng)計量
        2.3.2 性狀間的相關性分析
        2.3.3 不同RFI湖羊公羔生長性狀的比較分析
        2.3.4 不同RFI湖羊公羔胴體性狀、體組成和肌肉品質的比較分析
        2.3.5 育肥期湖羊公羔重要經濟性狀的遺傳力估計
    2.4 討論
    2.5 小結
第三章 不同RFI羔羊瘤胃微生物多樣性的研究
    3.1 引言
    3.2 材料與方法
        3.2.1 試驗群體與飼養(yǎng)管理
        3.2.2 剩余采食量（Residual feed intake，RFI）和飼料轉化率（Feed conversion rate，FCR）的計算
        3.2.3 樣品采集
        3.2.4 試劑耗材
        3.2.5 儀器設備
        3.2.6 瘤胃內容物DNA提取與質量檢測
        3.2.7 16 SrDNA V3-V4區(qū)PCR擴增子測序
        3.2.8 測序數據分析
    3.3 結果與分析
        3.3.1 DNA樣品及16S V3-V4區(qū)PCR擴增產物質量
        3.3.2 16 SrDNA V3-V4 測序數據量與質量
        3.3.3 Alpha多樣性分析
        3.3.4 Beta多樣性分析
        3.3.5 羔羊瘤胃微生物組成及功能富集分析
        3.3.6 不同RFI羔羊瘤胃微生物區(qū)系差異分析
        3.3.7 差異微生物的LEfSe及功能富集分析
    3.4 討論
    3.5 小結
第四章 極端RFI羔羊肝臟組織轉錄組分析
    4.1 前言
    4.2 材料與方法
        4.2.1 組織樣品
        4.2.2 試劑耗材
        4.2.3 儀器設備
        4.2.4 肝臟組織總RNA的提取與檢測
        4.2.5 mRNA測序
    4.3 結果與分析
        4.3.1 總RNA的提取與質量檢測
        4.3.2 原始數據的質量控制
        4.3.3 Clean reads與參考基因組的比對
        4.3.4 Reads在各個染色體上的密度分布情況
        4.3.5 樣品間表達相關性檢查
        4.3.6 差異表達mRNA轉錄本分析
        4.3.7 差異表達基因的KEGG富集分析
        4.3.8 差異表達基因的Q-PCR驗證
    4.4 討論
    4.5 小結
第五章 差異表達基因的SNPs掃描及其與飼料效率性狀的關聯分析
    5.1 前言
    5.2 材料與方法
        5.2.1 試驗群體
        5.2.2 性狀測定
        5.2.3 樣品采集與DNA提取
        5.2.4 SNPs掃描與基因型檢測
        5.2.5 基因型與飼料轉化率的關聯分析
    5.3 結果與分析
        5.3.1 試驗群體DNA質量與濃度
        5.3.2 綿羊ADRA2A和 RYR2 基因目的片段的PCR擴增
        5.3.3 綿羊ADRA2A和 RYR2 基因SNPs掃描
        5.3.4 綿羊ADRA2A和 RYR2 基因SNPs檢測及其與飼料轉化率的關聯分析
    5.4 討論
        5.4.1 KASPar SNP分型技術
        5.4.2 綿羊ADRA2A和 RYR2 基因與飼料轉化率
    5.5 小結
第六章 全文小結
    6.1 主要結論
    6.2 創(chuàng)新點
    6.3 研究展望
參考文獻
在學期間的研究成果
致謝
附錄


【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
[1]北京鴨RFI性狀遺傳參數分析及應用研究[D]. 張云生.西北農林科技大學 2018
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碩士論文
[1]豬PPARGC1A基因在不同組織和生長發(fā)育階段中的差異表達[D]. 閔小紅.四川農業(yè)大學 2008



本文編號：3180611