隴東肉牛A-FABP和SCD1基因多態(tài)性及其與肉質(zhì)性狀的相關(guān)性研究
發(fā)布時間:2021-05-09 05:28
早勝牛在長期的適應(yīng)性馴化及雜交改良過程中,形成了具有耐粗飼、生長發(fā)育快和產(chǎn)肉性能優(yōu)良的隴東肉牛群體,其中包括分布在慶陽、平?jīng)龅脑鐒倥<氨荒系聹亍⑽鏖T塔爾和秦川牛雜交改良類群。為進(jìn)一步研究隴東肉牛肉品質(zhì)及其遺傳基礎(chǔ),挖掘地方品種潛在的遺傳資源優(yōu)勢,促進(jìn)甘肅地區(qū)肉牛產(chǎn)業(yè),本試驗(yàn)以5個早勝牛類群(慶陽類群、平?jīng)鲱惾、南德溫與慶陽類群雜種、西門塔爾與平?jīng)鲱惾弘s種、秦川牛與平?jīng)鲱惾弘s種)為研究對象,采用PCR-SSCP技術(shù)、DNA測序和DNA序列分析技術(shù)檢測了A-FABP基因第2、3、4外顯子和SCD1基因第5外顯子的多態(tài)性,分析了肉牛群體的遺傳結(jié)構(gòu)和多樣性。采用最小二乘法(SAS9.3,Cary,NC,USA)模型研究了A-FABP基因和SCD1基因的遺傳突變位點(diǎn)與試驗(yàn)肉牛群體胴體品質(zhì)和肉質(zhì)性狀的相關(guān)性,旨在尋找對該肉牛類群的胴體和肉質(zhì)性狀有顯著影響的功能基因或分子標(biāo)記,為隴東肉牛的主要經(jīng)濟(jì)性狀分子標(biāo)記輔助選擇(MAS)及類群選育提供參考依據(jù)。試驗(yàn)主要結(jié)果如下:1.20A-FABP基因外顯子2和3分別存在c.280A>G和c.408G>C突變,并分別形成了3種基因型。SCD1基因外...
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Summary
第一部分 文獻(xiàn)綜述
1.前言
2.候選基因的研究進(jìn)展
2.1 脂肪型脂肪酸結(jié)合蛋白(A-FABP)基因
2.1.1 A-FABP 的結(jié)構(gòu)和生物學(xué)特性
2.1.2 A-FABP 的功能
2.1.3 A-FABP 基因的研究進(jìn)展
2.2 硬脂酰輔酶 A 去飽和酶Ⅰ(SCD1)基因
2.2.1 SCD1 的結(jié)構(gòu)和生物學(xué)特性
2.2.2 SCD1 的功能
2.2.3 SCD1 基因的研究進(jìn)展
3.家畜分子遺傳標(biāo)記技術(shù)
3.1 直接測序
3.2 DNA 芯片
3.3 單鏈構(gòu)象多態(tài)性
4.本研究目的及意義
第二部分 材料與方法
1 試驗(yàn)材料
1.1 試驗(yàn)動物
1.2 實(shí)驗(yàn)藥品與試劑
1.3 溶液與緩沖液的配置
1.4 主要儀器設(shè)備
2 試驗(yàn)方法
2.1 試驗(yàn)技術(shù)路線
2.2 試驗(yàn)樣品采集
2.2.1 血樣肉樣來源
2.2.2 牛肉品質(zhì)的測定
2.3 基因組 DNA 的提取方法
2.4 基因組DNA濃度和純度的檢測、純化及稀釋
2.4.1 基因組DNA的瓊脂糖凝膠電泳檢測
2.4.2 基因組 DNA 的分光光度計檢測
2.5 檢測位點(diǎn)引物設(shè)計
2.6 最佳 PCR 反應(yīng)體系及擴(kuò)增條件
2.7 擴(kuò)增結(jié)果檢測
2.8 擴(kuò)增產(chǎn)物的 PCR-SSCP 分析
2.8.1 聚丙烯酰胺凝膠組成
2.8.2 聚丙烯酰胺凝膠電泳
2.8.3 銀染過程
3.數(shù)據(jù)統(tǒng)計及分析
3.1 基因頻率、基因型頻率的計算
3.2 多態(tài)信息含量
3.3 純合度、雜合度和有效等位基因數(shù)
3.4 統(tǒng)計分析模型
第三部分 試驗(yàn)結(jié)果與討論
1 肉牛基因組 DNA 檢測結(jié)果
2 PCR 檢測和遺傳特性分析
2.1 A-FABP 基因外顯子 2 PCR-SSCP 結(jié)果
2.1.1 A-FABP 基因外顯子 2 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
2.1.2 A-FABP 基因外顯子 2 的 SSCP 電泳結(jié)果及測序分析
2.1.3 A-FABP 基因外顯子 2 遺傳多態(tài)性分析
2.1.4 基因型與胴體、肉質(zhì)性狀的相關(guān)性分析
2.2 A-FABP 基因外顯子 3 PCR-SSCP 結(jié)果
2.2.1 A-FABP 基因外顯子 3 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
2.2.2 A-FABP 基因外顯子 3 SSCP 電泳結(jié)果及測序分析
2.2.3 A-FABP 基因外顯子 3 遺傳多態(tài)性分析
2.2.4 基因型與胴體、肉質(zhì)性狀的相關(guān)性分析
2.3 A-FABP 基因外顯子 4 PCR-SSCP 結(jié)果
2.3.1 A-FABP 基因外顯子 4 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
2.3.2 A-FABP 基因外顯子 4 的 SSCP 電泳結(jié)果
2.4 SCD1 基因 PCR-SSCP 結(jié)果
2.4.1 SCD1 基因 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
2.4.2 SCD1 基因 SSCP 電泳結(jié)果及測序分析
2.4.3 SCD1 基因遺傳多態(tài)性分析
2.4.4 基因型與胴體、肉質(zhì)性狀的相關(guān)性分析
3 討論
3.1 基因的遺傳特性
3.1.1 A-FABP 基因遺傳多態(tài)性分析
3.1.2 SCD1 基因遺傳多態(tài)性分析
3.2 基因多態(tài)性與肉質(zhì)性狀的關(guān)系
3.2.1 A-FABP 基因相關(guān)性分析
3.2.2 SCD1 基因相關(guān)性分析
第四部分 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄 1
附錄 2
致謝
作者簡介
導(dǎo)師簡介
本文編號:3176712
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Summary
第一部分 文獻(xiàn)綜述
1.前言
2.候選基因的研究進(jìn)展
2.1 脂肪型脂肪酸結(jié)合蛋白(A-FABP)基因
2.1.1 A-FABP 的結(jié)構(gòu)和生物學(xué)特性
2.1.2 A-FABP 的功能
2.1.3 A-FABP 基因的研究進(jìn)展
2.2 硬脂酰輔酶 A 去飽和酶Ⅰ(SCD1)基因
2.2.1 SCD1 的結(jié)構(gòu)和生物學(xué)特性
2.2.2 SCD1 的功能
2.2.3 SCD1 基因的研究進(jìn)展
3.家畜分子遺傳標(biāo)記技術(shù)
3.1 直接測序
3.2 DNA 芯片
3.3 單鏈構(gòu)象多態(tài)性
4.本研究目的及意義
第二部分 材料與方法
1 試驗(yàn)材料
1.1 試驗(yàn)動物
1.2 實(shí)驗(yàn)藥品與試劑
1.3 溶液與緩沖液的配置
1.4 主要儀器設(shè)備
2 試驗(yàn)方法
2.1 試驗(yàn)技術(shù)路線
2.2 試驗(yàn)樣品采集
2.2.1 血樣肉樣來源
2.2.2 牛肉品質(zhì)的測定
2.3 基因組 DNA 的提取方法
2.4 基因組DNA濃度和純度的檢測、純化及稀釋
2.4.1 基因組DNA的瓊脂糖凝膠電泳檢測
2.4.2 基因組 DNA 的分光光度計檢測
2.5 檢測位點(diǎn)引物設(shè)計
2.6 最佳 PCR 反應(yīng)體系及擴(kuò)增條件
2.7 擴(kuò)增結(jié)果檢測
2.8 擴(kuò)增產(chǎn)物的 PCR-SSCP 分析
2.8.1 聚丙烯酰胺凝膠組成
2.8.2 聚丙烯酰胺凝膠電泳
2.8.3 銀染過程
3.數(shù)據(jù)統(tǒng)計及分析
3.1 基因頻率、基因型頻率的計算
3.2 多態(tài)信息含量
3.3 純合度、雜合度和有效等位基因數(shù)
3.4 統(tǒng)計分析模型
第三部分 試驗(yàn)結(jié)果與討論
1 肉牛基因組 DNA 檢測結(jié)果
2 PCR 檢測和遺傳特性分析
2.1 A-FABP 基因外顯子 2 PCR-SSCP 結(jié)果
2.1.1 A-FABP 基因外顯子 2 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
2.1.2 A-FABP 基因外顯子 2 的 SSCP 電泳結(jié)果及測序分析
2.1.3 A-FABP 基因外顯子 2 遺傳多態(tài)性分析
2.1.4 基因型與胴體、肉質(zhì)性狀的相關(guān)性分析
2.2 A-FABP 基因外顯子 3 PCR-SSCP 結(jié)果
2.2.1 A-FABP 基因外顯子 3 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
2.2.2 A-FABP 基因外顯子 3 SSCP 電泳結(jié)果及測序分析
2.2.3 A-FABP 基因外顯子 3 遺傳多態(tài)性分析
2.2.4 基因型與胴體、肉質(zhì)性狀的相關(guān)性分析
2.3 A-FABP 基因外顯子 4 PCR-SSCP 結(jié)果
2.3.1 A-FABP 基因外顯子 4 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
2.3.2 A-FABP 基因外顯子 4 的 SSCP 電泳結(jié)果
2.4 SCD1 基因 PCR-SSCP 結(jié)果
2.4.1 SCD1 基因 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
2.4.2 SCD1 基因 SSCP 電泳結(jié)果及測序分析
2.4.3 SCD1 基因遺傳多態(tài)性分析
2.4.4 基因型與胴體、肉質(zhì)性狀的相關(guān)性分析
3 討論
3.1 基因的遺傳特性
3.1.1 A-FABP 基因遺傳多態(tài)性分析
3.1.2 SCD1 基因遺傳多態(tài)性分析
3.2 基因多態(tài)性與肉質(zhì)性狀的關(guān)系
3.2.1 A-FABP 基因相關(guān)性分析
3.2.2 SCD1 基因相關(guān)性分析
第四部分 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄 1
附錄 2
致謝
作者簡介
導(dǎo)師簡介
本文編號:3176712
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