發(fā)布時(shí)間：2021-05-06 06:59

　　豬的毛色是品種的重要特征之一,作為一種可利用的遺傳標(biāo)記,可用于鑒定品種純度和親緣關(guān)系、確定雜交組合、評(píng)價(jià)產(chǎn)品質(zhì)量等。研究表明,豬的毛色表型差異主要取決于毛發(fā)中色素的種類、比例及分布。本研究中,以清平豬及其與法系大白雜交后代作為研究對(duì)象,選擇5個(gè)影響黑色素合成的相關(guān)基因（MC1R、ASIP、TYR、TYRP1和SLC45A2）作為候選基因,在實(shí)驗(yàn)室前期100頭清平母豬GWAS測(cè)序結(jié)果中篩選SNPs,利用目標(biāo)捕獲測(cè)序技術(shù)鑒定雜交后代的5個(gè)色素合成相關(guān)基因SNPs位點(diǎn)的基因型,研究其單核苷酸多態(tài)性。主要研究結(jié)果如下:1.清平豬MC1R基因CDs區(qū)篩選到7個(gè)SNPs位點(diǎn),4個(gè)錯(cuò)義突變的ID號(hào)分別是rs326921593、rs705222433、rs45434630和rs45434629,3個(gè)同義突變的ID號(hào)分別是rs327940565、rs45435031和rs345201947。測(cè)序結(jié)果說(shuō)明,清平豬的黑色表型是由E^D1等位基因控制的,屬于顯性黑毛體系,與其他中國(guó)黑豬的研究結(jié)果一致。2.清平豬ASIP基因CDs區(qū)篩選到1個(gè)非同義突變SNP,ID號(hào)為rs695545599。... 

【文章來(lái)源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：73 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstrat
縮略詞表
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 前言
    2 毛色形成的生物學(xué)基礎(chǔ)
        2.1 黑素細(xì)胞的發(fā)育分化
        2.2 黑色素的合成
    3 毛色形成相關(guān)基因研究
        3.1 MC1R基因與毛色
        3.2 ASIP基因與毛色
        3.3 TYR基因與毛色
        3.4 TYRP1基因與毛色
        3.5 SLC45A2基因與毛色
    4 單核苷酸多態(tài)性研究
    5 目的和意義
第二章 材料與方法
    1 毛色分離群體的構(gòu)建
    2 本試驗(yàn)中毛色表型分類與記錄
    3 試驗(yàn)材料
        3.1 試驗(yàn)動(dòng)物
        3.2 主要藥品及試劑
        3.3 緩沖液及常用試劑的配制
        3.4 主要儀器和設(shè)備
    4 試驗(yàn)方法
        4.1 基因組DNA的提取
            4.1.1 組織(耳組織)中DNA的提取
            4.1.2 毛囊中DNA的提取
        4.2 基因組DNA的提取結(jié)果的濃度測(cè)定與電泳檢測(cè)
            4.2.1 DNA的濃度測(cè)定
            4.2.2 DNA的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
        4.3 毛色基因多態(tài)性檢測(cè)
            4.3.1 定制化目標(biāo)捕獲測(cè)序技術(shù)
            4.3.2 引物設(shè)計(jì)
        4.4 統(tǒng)計(jì)分析
            4.4.1 基因型頻率及其基因頻率的計(jì)算
            4.4.2 遺傳多態(tài)性分析
            4.4.3 基因型與性狀關(guān)聯(lián)分析
            4.4.4 主要分子生物學(xué)軟件和網(wǎng)站
第三章 結(jié)果與分析
    1 豬基因組DNA提取結(jié)果
    2 MC1R基因試驗(yàn)結(jié)果
        2.1 清平豬MC1R基因SNPs篩選
        2.2 清平豬MC1R基因SNPs群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
        2.3 清平豬MC1R基因SNPs遺傳多樣性分析
        2.4 F1代留種母豬MC1R基因rs45435032位點(diǎn)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
        2.5 F1代留種母豬MC1R基因rs45435032位點(diǎn)遺傳多樣性分析
        2.6 MC1R基因rs45435032位點(diǎn)與F2代7種毛色的關(guān)聯(lián)分析
    3 ASIP基因試驗(yàn)結(jié)果
        3.1 清平豬ASIP基因rs695545599位點(diǎn)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
        3.2 清平豬ASIP基因rs695545599位點(diǎn)遺傳多樣性分析
        3.3 F1代留種母豬ASIP基因rs695545599位點(diǎn)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
        3.4 F1代留種母豬ASIP基因rs695545599位點(diǎn)遺傳多樣性分析
        3.5 ASIP基因rs695545599位點(diǎn)F2代7種毛色的關(guān)聯(lián)分析
    4 TYR基因試驗(yàn)結(jié)果
C位點(diǎn)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析">        4.1 清平豬TYR基因g.22603899 G>C位點(diǎn)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
C位點(diǎn)遺傳多樣性分析">        4.2 清平豬TYR基因g.22603899 G>C位點(diǎn)遺傳多樣性分析
C位點(diǎn)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析">        4.3 F1代留種母豬TYR基因g.22603899 G>C位點(diǎn)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
C位點(diǎn)遺傳多樣性分析">        4.4 F1代留種母豬TYR基因g.22603899 G>C位點(diǎn)遺傳多樣性分析
C位點(diǎn)與F2代7種毛色的關(guān)聯(lián)分析">        4.5 TYR基因g.22603899 G>C位點(diǎn)與F2代7種毛色的關(guān)聯(lián)分析
        4.6 TYR蛋白的生物信息學(xué)分析
            4.6.1 TYR蛋白序列的理化性質(zhì)
            4.6.2 TYR的信號(hào)肽預(yù)測(cè)
            4.6.3 TYR蛋白序列二級(jí)結(jié)構(gòu)分析
    5 TYRP1基因試驗(yàn)結(jié)果
        5.1 清平豬TYRP1基因SNPs位點(diǎn)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
        5.2 清平豬TYRP1基因SNPs位點(diǎn)遺傳多樣性分析
        5.3 F1代留種母豬TYRP1基因SNPs位點(diǎn)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
        5.4 F1代留種母豬TYRP1基因SNPs位點(diǎn)遺傳多樣性分析
        5.5 TYRP1基因SNPs位點(diǎn)與F2代7種毛色的關(guān)聯(lián)分析
    6 SLC45A2基因試驗(yàn)結(jié)果
        6.1 清平豬SLC45A2基因rs318960545位點(diǎn)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
        6.2 清平豬SLC45A2基因rs318960545位點(diǎn)遺傳多樣性分析
        6.3 F1代留種母豬SLC45A2基因rs318960545位點(diǎn)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
        6.4 F1代留種母豬SLC45A2基因rs318960545位點(diǎn)遺傳多樣性分析
        6.5 SLC45A2基因rs318960545位點(diǎn)與F2代7種毛色的關(guān)聯(lián)分析
第四章 討論
    1 MC1R基因SNPs位點(diǎn)與毛色的關(guān)系
    2 ASIP基因SNPs位點(diǎn)與毛色的關(guān)系
    3 TYR基因SNPs點(diǎn)與毛色的關(guān)系
    4 TYRP1基因SNPs位點(diǎn)與毛色的關(guān)系
    5 SLC45A2基因SNPs位點(diǎn)與毛色的關(guān)系
第五章 總結(jié)
    1 本研究小結(jié)
    2 本研究的創(chuàng)新之處
    3 本研究的不足之處
參考文獻(xiàn)
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]海貍色獺兔與皺襞型獺兔不同交配組合生產(chǎn)性能比較研究[J]. 趙月平,楊翠軍,孫全文,吳淑琴,吳占福,郝榮超,盧敬,馬夢(mèng)盼,任玲玲.  中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2017(12)
[2]Slc45a2調(diào)控小鼠黑色素細(xì)胞色素生成[J]. 王海東,趙兵令,陳天直,于秀菊,楊玉靜,劉穎,常露程,赫曉燕,薛霖莉.  中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2017(04)
[3]單核苷酸多態(tài)性檢測(cè)方法研究進(jìn)展[J]. 常培葉,趙平.  中國(guó)老年學(xué)雜志. 2015(16)
[4]長(zhǎng)×巴F2代雜交豬黑素皮質(zhì)激素受體Ⅰ基因克隆與多態(tài)性分析[J]. 敖秋桅,嚴(yán)雪瑜,蔣欽楊,唐家梁,蘭干球,郭亞芬,蔣和生.  南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2015(02)
[5]紅褐色烏蘇里貉TYRP1基因的克隆及表達(dá)水平分析[J]. 朱艷菲,胡義潔,吳明明,李禎,孫金海,張廷榮.  中國(guó)畜牧雜志. 2014(11)
[6]動(dòng)物皮毛色澤形成機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 楊民紅,李蘭會(huì).  貴州畜牧獸醫(yī). 2013(05)
[7]野豬ASIP基因的突變位點(diǎn)及其與毛色表型的相關(guān)性研究[J]. 付冬麗,楊廣禮,代燎原,羅玉柱.  家畜生態(tài)學(xué)報(bào). 2013(02)
[8]七個(gè)眼皮膚白化�、裥图蚁档脑缙诋a(chǎn)前診斷[J]. 吳慶華,史惠蓉,劉寧,魯寧,江淼,趙振華,孔祥東.  中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志. 2012 (04)
[9]單核苷酸多態(tài)性（SNP）的研究進(jìn)展[J]. 張必弦,朱延明,來(lái)永才,胡小梅,李煒,李琬,畢影東,肖佳雷,張俐俐.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(21)
[10]Agouti基因及其表達(dá)產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)與功能[J]. 朱春鳳,馮永山.  黑龍江醫(yī)藥. 2012(03)

博士論文
[1]TRP-1在正常黑素細(xì)胞及惡性黑素瘤細(xì)胞中的作用研究[D]. 李春英.中國(guó)人民解放軍第四軍醫(yī)大學(xué) 2003

碩士論文
[1]獺兔青紫藍(lán)毛色候選基因篩選的初步研究[D]. 施麗娟.揚(yáng)州大學(xué) 2015
[2]TYR、ASIP基因多態(tài)性與綿羊毛色相關(guān)的研究[D]. 孟浩浩.石河子大學(xué) 2014
[3]TYR、TYRP1基因與朝鮮鵪鶉羽色相關(guān)性研究[D]. 徐瑩.河南科技大學(xué) 2014
[4]10個(gè)中國(guó)地方綿羊品種MC1R和ASIP基因多態(tài)性及其與毛色關(guān)聯(lián)性分析[D]. 付冬麗.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[5]山羊TYRP1基因序列分析及SNPs研究[D]. 鄭會(huì)芹.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[6]山羊Agouti基因與毛色表型相關(guān)分析及其遺傳變異的研究[D]. 唐春娟.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[7]清平豬部分種質(zhì)特性的研究[D]. 楊志軍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[8]豬黑素皮質(zhì)素受體1（MC1R）基因與毛色表型相關(guān)及5’UTR變異研究[D]. 頓桂玲.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007



本文編號(hào)：3171469