多胎細(xì)毛羊育種是我國細(xì)毛羊產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重點方向,提升細(xì)毛羊繁殖力是當(dāng)下細(xì)毛羊品種選育的重中之重,但控制其多胎性狀的基因仍不清楚。本研究以我國具有代表性的細(xì)毛羊品種高山美利奴羊、中國美利奴羊、青海細(xì)毛羊、敖漢細(xì)毛羊為研究對象,以控制羊繁殖性狀基因BMPRIB、BMP15、GDF9、FSHR、FSHβ、INHA、INHBA、GnRHR、GnRH為細(xì)毛羊多胎性狀候選基因,基于全基因組測序結(jié)果,進(jìn)行外顯子單核苷酸多態(tài)性篩選,并采用RNAfold和NPS@軟件預(yù)測單核苷酸多態(tài)性對候選基因mRNA二級結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的影響。將引起高山美利奴羊候選基因編碼氨基酸變化位點作為該基因特異性候選位點,利用直接測序法檢測高山美利奴羊多態(tài)性,分析候選基因多態(tài)性與產(chǎn)羔數(shù)的相關(guān)性,篩選影響多胎性狀的基因。主要研究結(jié)果如下:1.四個細(xì)毛羊品種多胎性狀候選基因中BMPR-IB基因外顯子檢測到5個SNPs（A753G、T1020C、C1035T、C1269A、C1626A）;BMP15基因外顯子上沒有檢測到SNP位點;GDF9基因外顯子共檢測到7個SNPs（G260A、C471T、G477A、G721A、G750A、... 

【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】：71 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
英文縮略表
第一章 引言
    1.1 研究用細(xì)毛羊品種介紹
        1.1.1 高山美利奴羊
        1.1.2 中國美利奴羊
        1.1.3 青海細(xì)毛羊
        1.1.4 敖漢細(xì)毛羊
    1.2 多胎性狀候選基因單核苷酸多態(tài)性研究進(jìn)展
        1.2.1 BMPR-IB基因
        1.2.2 BMP15基因
        1.2.3 GDF9基因
        1.2.4 FSHR與FSHβ基因
        1.2.5 INHA與INHBA基因
        1.2.6 GnRHR與GnRH基因
    1.3 DNA分子標(biāo)記技術(shù)
        1.3.1 單核苷酸多態(tài)性
        1.3.2 直接測序法
    1.4 本研究的目的意義
第二章 細(xì)毛羊BMPR-IB、BMP15、GDF9基因多態(tài)性檢測與分析
    2.1 試驗材料
        2.1.1 試驗動物
        2.1.2 主要試驗試劑及儀器
    2.2 試驗方法
        2.2.1 樣品的采集
        2.2.2 血液基因組DNA提取及質(zhì)量檢測
        2.2.3 全基因組測序及BMPR-IB、BMP15、GDF9 基因外顯子多態(tài)位點檢測
        2.2.4 細(xì)毛羊BMPR-IB、BMP15、GDF9 基因多態(tài)位點遺傳多樣性分析
        2.2.5 生物信息學(xué)分析
        2.2.6 高山美利奴羊BMPR-IB基因多態(tài)性與產(chǎn)羔數(shù)關(guān)聯(lián)分析
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 細(xì)毛羊BMPR-IB、BMP15、GDF9基因外顯子SNPs篩選
        2.3.2 細(xì)毛羊BMPR-IB、BMP15、GDF9基因群體遺傳學(xué)分析
        2.3.3 生物信息學(xué)分析
        2.3.4 高山美利奴羊BMPR-IB基因多態(tài)性與產(chǎn)羔數(shù)關(guān)聯(lián)分析
    2.4 討論
    2.5 小結(jié)
第三章 細(xì)毛羊FSHR和FSHβ基因多態(tài)性檢測與分析
    3.1 試驗材料
    3.2 試驗方法
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 細(xì)毛羊FSHR與FSHβ基因外顯子SNPs篩選
        3.3.2 細(xì)毛羊FSHR與FSHβ基因群體遺傳學(xué)分析
        3.3.3 生物信息學(xué)分析
        3.3.4 高山美利奴羊FSHR基因多態(tài)性與產(chǎn)羔數(shù)關(guān)聯(lián)分析
    3.4 討論
    3.5 小結(jié)
第四章 細(xì)毛羊INHA和INHBA基因多態(tài)性檢測與分析
    4.1 試驗材料
    4.2 試驗方法
    4.3 結(jié)果與分析
        4.3.1 細(xì)毛羊INHA與INHBA基因外顯子SNPs篩選
        4.3.2 細(xì)毛羊INHA與INHBA基因群體遺傳學(xué)分析
        4.3.3 生物信息學(xué)分析
        4.3.4 高山美利奴羊INHA與INHBA基因多態(tài)性與產(chǎn)羔數(shù)關(guān)聯(lián)分析
    4.4 討論
    4.5 小結(jié)
第五章 細(xì)毛羊GnRHR和GnRH基因多態(tài)性檢測與分析
    5.1 試驗材料
    5.2 試驗方法
    5.3 結(jié)果與分析
        5.3.1 細(xì)毛羊GnRHR與GnRH基因外顯子SNPs篩選
        5.3.2 細(xì)毛羊GnRHR與GnRH基因群體遺傳學(xué)分析
        5.3.3 生物信息學(xué)分析
        5.3.4 高山美利奴羊GnRHR與GnRH基因多態(tài)性與產(chǎn)羔數(shù)關(guān)聯(lián)分析
    5.4 討論
    5.5 小結(jié)
第六章 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡歷


【參考文獻(xiàn)】：
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博士論文
[1]陸地棉TM-1參考基因組構(gòu)建及比較基因組分析[D]. 陳杰丹.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
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碩士論文
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[2]天祝白牦牛FSH、FSHR基因多態(tài)性分析與雙胎性狀的關(guān)聯(lián)研究[D]. 邢耀潭.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011



本文編號：3168487