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區(qū)分犬瘟熱病毒Asia-Ⅰ型野毒株及疫苗株的AS-PCR方法

發(fā)布時間:2021-04-29 01:59
  犬瘟熱是一種接觸性傳染病,可侵害免疫系統(tǒng)、呼吸系統(tǒng)、消化系統(tǒng),甚至神經(jīng)系統(tǒng),導致全身性的病理變化,對寵物犬、毛皮動物等存在巨大威脅。目前常用的膠體金檢測法不能有效區(qū)分疫苗免疫與動物自然感染。為建立一種高效準確的鑒別犬瘟熱病毒野毒株和疫苗株的檢測方法,本試驗對從武漢地區(qū)收集已確診犬瘟熱的6只犬分離得到的野毒株以及3株廣泛使用的CDV疫苗株進行全基因組測序,從氨基酸水平和堿基水平比對分析后,確定H基因為AS-PCR引物設(shè)計的靶基因。通過對H基因進行分型,發(fā)現(xiàn)武漢地區(qū)流行的CDV均為Asia-Ⅰ型,而疫苗株Y2為America-I型,疫苗株Y1和Y3均為America-II型。對比179株Asia-Ⅰ型(6株野毒株樣品+173株GenBank Asia-Ⅰ型)與3株疫苗株的CDV-H基因序列,采用AS-PCR技術(shù)(3′端錯配)設(shè)計出1對能有效區(qū)分犬瘟熱Asia-Ⅰ型野毒株和疫苗株的特異性引物,上游引物序列為5′-TTAAATGATAATGACATAGTG-3′,下游引物序列為5′-CCTGGCAAGGCAAGA-3′。結(jié)果顯示該引物有較強的特異性,6株樣品野毒株均可擴增出長894 bp的片段... 

【文章來源】:畜牧獸醫(yī)學報. 2020,51(10)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:10 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 材料
        1.1.1 主要毒株及樣品
        1.1.2 主要試劑與儀器
    1.2 方法
        1.2.1 病毒RNA提取與反轉(zhuǎn)錄
        1.2.2 PCR擴增與測序
        1.2.3 AS-PCR引物設(shè)計
        1.2.4 靈敏性與特異性試驗
        1.2.5 臨床樣品檢測
2 結(jié) 果
    2.1 基因堿基水平的同源性分析比較
    2.2 野毒株和疫苗株的分型結(jié)果
    2.3 H基因分析
    2.4 AS-PCR引物及優(yōu)化
    2.5 AS-PCR引物靈敏度和特異性檢測
    2.6 臨床樣本檢測
3 討 論
4 結(jié) 論


【參考文獻】:
期刊論文
[1]采用ASPCR技術(shù)檢測抗藥性雨久花ALS突變基因堿基種類的探討[J]. 吳明根,金萬赫,許勇男.  安徽農(nóng)業(yè)大學學報. 2011(02)
[2]SYBR GreenⅠ熒光定量RT-PCR檢測犬瘟熱病毒方法的建立及應用[J]. 黃國君,岳華,楊發(fā)龍,蘭道亮,湯承,盧建遠.  中國預防獸醫(yī)學報. 2008(06)
[3]SYBR Green I熒光RT-PCR檢測犬瘟熱方法的建立和應用[J]. 邵四海,孔繁德,吳德峰,陳瓊,徐淑菲,溫海.  生物技術(shù)通報. 2008(01)
[4]犬瘟熱病毒RT-PCR檢測方法的建立[J]. 王金良,沈志強,管宇,肖躍強,趙元楷.  動物醫(yī)學進展. 2006(12)
[5]等位基因特異PCR技術(shù)的研究與應用[J]. 陳吉寶,景蕊蓮,員海燕,衛(wèi)波.  植物遺傳資源學報. 2005(04)

博士論文
[1]不同宿主來源犬瘟熱病毒遺傳分析與生物學特性研究[D]. 李天松.吉林農(nóng)業(yè)大學 2012



本文編號:3166612

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