基于Cytb基因全序列4個雞品種遺傳多態(tài)性和起源
發(fā)布時間:2021-04-27 00:48
動物線粒體細胞色素b (cytochrome b, Cytb)基因是重要的功能蛋白編碼基因,其進化速率中等,一個較小的片斷就包含了豐富的遺傳進化信息,被認為是研究動物從種內(nèi)到種間乃至科間的遺傳多態(tài)性和系統(tǒng)進化的理想分子標記。為探明我國江西省部分地方雞(Gallus domesticus)品種線粒體Cytb基因遺傳多態(tài)性特點,本研究以江西省4個地方雞品種為研究對象,利用DNA測序技術(shù)測定Cytb基因全長序列,進行遺傳多態(tài)性分析。結(jié)果表明,4個品種Cytb序列全長均為1 143 bp,共有12個突變位點和9種單倍型,其中單倍型Hap4為4個品種共有。4個品種平均核苷酸差異(average number of nucleotide differences, K)為1.971,平均單倍型多樣度(haplotype diversity, Hd)為0.724,平均核苷酸多樣度(nucleotide diversity, Pi)為0.001 72;安義瓦灰雞K和Pi均最大,分別為3.105和0.002 72;白耳黃雞Hd最大,為0.752;絲羽烏骨雞的K值、Pi值和Hd值均最低。4個雞品種在形成過程...
【文章來源】:農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學報. 2020,28(06)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.1.1 供試雞品種
1.1.2 試劑
1.1.3 紅色原雞序列
1.2 總DNA提取
1.3 雞Cytb基因PCR擴增
1.3.1 引物設計與合成
1.3.2 PCR擴增與測序
1.4 雞Cytb基因序列分析
2 結(jié)果與分析
2.1 Cytb基因全序列多態(tài)位點和單倍型分布
2.2 Cytb基因全序列平均核苷酸差異、核苷酸多樣度和單倍型多樣度
2.3 4個雞品種群體內(nèi)與群體間遺傳距離
2.4 4個雞品種Cytb基因序列系統(tǒng)發(fā)育樹
3 討論
3.1 4個雞品種Cytb基因全序列遺傳多態(tài)性
3.2 4個雞品種基于Cytb基因的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和遺傳起源
3.3 保種和開發(fā)利用
4 結(jié)論
本文編號:3162441
【文章來源】:農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學報. 2020,28(06)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.1.1 供試雞品種
1.1.2 試劑
1.1.3 紅色原雞序列
1.2 總DNA提取
1.3 雞Cytb基因PCR擴增
1.3.1 引物設計與合成
1.3.2 PCR擴增與測序
1.4 雞Cytb基因序列分析
2 結(jié)果與分析
2.1 Cytb基因全序列多態(tài)位點和單倍型分布
2.2 Cytb基因全序列平均核苷酸差異、核苷酸多樣度和單倍型多樣度
2.3 4個雞品種群體內(nèi)與群體間遺傳距離
2.4 4個雞品種Cytb基因序列系統(tǒng)發(fā)育樹
3 討論
3.1 4個雞品種Cytb基因全序列遺傳多態(tài)性
3.2 4個雞品種基于Cytb基因的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和遺傳起源
3.3 保種和開發(fā)利用
4 結(jié)論
本文編號:3162441
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