豬流行性腹瀉病毒中國流行株的遺傳變異分析與S基因高變區(qū)的表達
發(fā)布時間:2021-04-26 16:18
自2010年10月份起,由豬流行性腹瀉病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的豬急性腹瀉在中國多個養(yǎng)豬省份暴發(fā)。該病是以腹瀉、嘔吐、脫水和對哺乳仔豬高致死率為特征的一種高度接觸性腸道傳染病,易感豬發(fā)病率可高達100%,給豬場帶來了嚴(yán)重的經(jīng)濟損失。為了解PEDV的遺傳變異情況,本研究根據(jù)GeneBank中PEDV經(jīng)典毒株CV777株的全序列設(shè)計了19對特異性引物,采用RT-PCR方法對分離自河南省某豬場的PEDV流行株CH/ZMDZY/11的全基因組進行分段擴增、克隆和測序,獲得了基因組的完整序列。在此基礎(chǔ)上,作者對2010-2012年間PEDV中國流行株的遺傳變異情況進行了分析,核苷酸和氨基酸序列比對結(jié)果顯示,與經(jīng)典毒株CV777相比,目前中國PEDV流行株已經(jīng)發(fā)生了變異。來自中國各地的10株P(guān)EDV流行株具有很高的同源性(98.2%~99.1%),并與韓國強毒株DR13和中國早期毒株CH-S親緣關(guān)系較近,而與經(jīng)典毒株CV777的親緣關(guān)系較遠(96.8%~97%)。PEDV中國流行株與參考毒株相比,各主要基因均發(fā)生了不同程度的變異,尤其以S...
【文章來源】:河南農(nóng)業(yè)大學(xué)河南省
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
摘要
文獻綜述
1 PEDV 的生物學(xué)特性
2 PEDV 的基因組特點及主要編碼蛋白的功能
3 PEDV 分子流行病學(xué)研究進展
4 PED 診斷方法研究進展
5 PED 防控研究進展
6 本研究的目的與意義
試驗一 PEDV CH/ZMDZY/11 株全基因組序列測定與分析
1 材料與方法
2 結(jié)果
3 討論
試驗二 2010-2012年中國豬流行性腹瀉病毒流行株的遺傳變異分析
1 材料與方法
2 結(jié)果
3 討論
試驗三 PEDV 中國流行株 S 基因高變區(qū)的表達與鑒定
1 材料與方法
2 結(jié)果
3 討論
參考文獻
Abstract
附錄1:作者讀研期間已發(fā)表文章
附錄2:PEDV CH/ZMDZY/11 株全基因序列(登錄號:KC196276.1)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]豬流行性腹瀉病毒PEDV-GD12株的分離與鑒定[J]. 古洪浪,鄧勝朝,崔進,劉曉露,劉超,袁航,馬嵐,張桂紅. 中國獸醫(yī)雜志. 2013(11)
[2]豬流行性腹瀉病毒RT-PCR鑒別診斷方法的建立[J]. 吳玉璐,程群,虞凌雪,侯怡軒,王康,劉光清,童光志,周艷君. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(20)
[3]2011—2012年我國部分地區(qū)豬流行性腹瀉病毒ORF3基因的遺傳變異分析[J]. 郭容利,何孔旺,茅愛華,劉浩飛,俞正玉,倪艷秀,溫立斌,李彬,王小敏,張雪寒,呂立新,周俊明. 畜牧與獸醫(yī). 2013(05)
[4]2010~2012年華中地區(qū)豬流行性腹瀉病毒分子特征和遺傳進化分析[J]. 鄭逢梅,霍金耀,趙軍,常洪濤,王曉夢,陳陸,王川慶. 病毒學(xué)報. 2013(02)
[5]豬流行性腹瀉病毒E基因真核表達載體的構(gòu)建與鑒定[J]. 付通超,萬紅平,程渝,顏其貴. 畜牧獸醫(yī)雜志. 2012(04)
[6]2011年豬流行性腹瀉病毒的遺傳變異分析[J]. 劉孝珍,陳建飛,時洪艷,張鑫,石達,劉勝旺,馮力. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2012(03)
[7]豬流行性腹瀉病毒SYBRⅠ實時熒光定量RT-PCR檢測方法的建立[J]. 修金生,周倫江,陳如敬,王隆柏,陳小權(quán). 中國獸醫(yī)科學(xué). 2012(02)
[8]豬流行性腹瀉病毒基因及其疫苗的研究[J]. 王鳳,湯德元,李春燕,王彬,張曉杰,甘振磊,劉志杰. 豬業(yè)科學(xué). 2010(12)
[9]豬流行性腹瀉病毒、豬傳染性胃腸炎病毒和豬A群輪狀病毒多重RT-PCR檢測方法的建立及臨床應(yīng)用[J]. 張坤,何啟蓋. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2010(08)
[10]TaqMan熒光定量PCR檢測豬流行性腹瀉病毒方法的建立與初步應(yīng)用[J]. 劉鄧,袁秀芳,冉多良,徐麗華,牛登元,王朝文,王一成. 中國動物傳染病學(xué)報. 2010(01)
碩士論文
[1]豬流行性腹瀉病毒檢測方法建立及基因變異分析[D]. 霍金耀.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]PEDV S與豬IL-18聯(lián)合DNA疫苗免疫效果研究[D]. 斯琴高娃.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]三株豬流行性腹瀉病毒的Envelope(Small Membrane,sM)編碼基因的序列測定比較[D]. 劉春艷.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2003
本文編號:3161723
【文章來源】:河南農(nóng)業(yè)大學(xué)河南省
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
摘要
文獻綜述
1 PEDV 的生物學(xué)特性
2 PEDV 的基因組特點及主要編碼蛋白的功能
3 PEDV 分子流行病學(xué)研究進展
4 PED 診斷方法研究進展
5 PED 防控研究進展
6 本研究的目的與意義
試驗一 PEDV CH/ZMDZY/11 株全基因組序列測定與分析
1 材料與方法
2 結(jié)果
3 討論
試驗二 2010-2012年中國豬流行性腹瀉病毒流行株的遺傳變異分析
1 材料與方法
2 結(jié)果
3 討論
試驗三 PEDV 中國流行株 S 基因高變區(qū)的表達與鑒定
1 材料與方法
2 結(jié)果
3 討論
參考文獻
Abstract
附錄1:作者讀研期間已發(fā)表文章
附錄2:PEDV CH/ZMDZY/11 株全基因序列(登錄號:KC196276.1)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]豬流行性腹瀉病毒PEDV-GD12株的分離與鑒定[J]. 古洪浪,鄧勝朝,崔進,劉曉露,劉超,袁航,馬嵐,張桂紅. 中國獸醫(yī)雜志. 2013(11)
[2]豬流行性腹瀉病毒RT-PCR鑒別診斷方法的建立[J]. 吳玉璐,程群,虞凌雪,侯怡軒,王康,劉光清,童光志,周艷君. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(20)
[3]2011—2012年我國部分地區(qū)豬流行性腹瀉病毒ORF3基因的遺傳變異分析[J]. 郭容利,何孔旺,茅愛華,劉浩飛,俞正玉,倪艷秀,溫立斌,李彬,王小敏,張雪寒,呂立新,周俊明. 畜牧與獸醫(yī). 2013(05)
[4]2010~2012年華中地區(qū)豬流行性腹瀉病毒分子特征和遺傳進化分析[J]. 鄭逢梅,霍金耀,趙軍,常洪濤,王曉夢,陳陸,王川慶. 病毒學(xué)報. 2013(02)
[5]豬流行性腹瀉病毒E基因真核表達載體的構(gòu)建與鑒定[J]. 付通超,萬紅平,程渝,顏其貴. 畜牧獸醫(yī)雜志. 2012(04)
[6]2011年豬流行性腹瀉病毒的遺傳變異分析[J]. 劉孝珍,陳建飛,時洪艷,張鑫,石達,劉勝旺,馮力. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2012(03)
[7]豬流行性腹瀉病毒SYBRⅠ實時熒光定量RT-PCR檢測方法的建立[J]. 修金生,周倫江,陳如敬,王隆柏,陳小權(quán). 中國獸醫(yī)科學(xué). 2012(02)
[8]豬流行性腹瀉病毒基因及其疫苗的研究[J]. 王鳳,湯德元,李春燕,王彬,張曉杰,甘振磊,劉志杰. 豬業(yè)科學(xué). 2010(12)
[9]豬流行性腹瀉病毒、豬傳染性胃腸炎病毒和豬A群輪狀病毒多重RT-PCR檢測方法的建立及臨床應(yīng)用[J]. 張坤,何啟蓋. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2010(08)
[10]TaqMan熒光定量PCR檢測豬流行性腹瀉病毒方法的建立與初步應(yīng)用[J]. 劉鄧,袁秀芳,冉多良,徐麗華,牛登元,王朝文,王一成. 中國動物傳染病學(xué)報. 2010(01)
碩士論文
[1]豬流行性腹瀉病毒檢測方法建立及基因變異分析[D]. 霍金耀.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]PEDV S與豬IL-18聯(lián)合DNA疫苗免疫效果研究[D]. 斯琴高娃.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]三株豬流行性腹瀉病毒的Envelope(Small Membrane,sM)編碼基因的序列測定比較[D]. 劉春艷.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2003
本文編號:3161723
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