本研究旨在探討西藏高原放牧藏豬、舍飼藏豬與瘦肉型豬（杜×長(zhǎng)×大,DLY豬）盲腸微生物的群落組成及多樣性,從而部分揭示西藏高原藏豬腸道微生物的特異性。選用日齡相近的放牧藏豬、舍飼藏豬及DLY豬各5頭,放牧藏豬由林芝本地農(nóng)牧民采用傳統(tǒng)方式放牧養(yǎng)殖,舍飼藏豬及DLY豬圈養(yǎng)并飼喂相同飼糧,160日齡時(shí)前腔靜脈放血屠宰,采集盲腸食糜于液氮速凍待測(cè)。采用高通量測(cè)序技術(shù)測(cè)定樣品16S rRNA V3-V4區(qū)域的基因序列。結(jié)果表明,在15個(gè)樣本的16S rRNA基因V3-V4區(qū)測(cè)序共獲得了659 904條有效序列,其中放牧藏豬213 031條、舍飼藏豬219 417條、DLY豬227 456條。放牧藏豬盲腸微生物OTU總數(shù)、Chao1指數(shù)、ACE指數(shù)及香農(nóng)（Shannon）指數(shù)均顯著高于舍飼藏豬與DLY豬（P<0.05）,而舍飼藏豬與DLY豬無(wú)顯著差異（P>0.05）。3個(gè)類型豬盲腸微生物共劃分為13個(gè)門,56個(gè)屬。厚壁菌門（Firmicutes）是3個(gè)類型豬相對(duì)豐度共同最高的門。放線菌門（Actinobacteria）與疣微菌門（Verrucomicrobia）在放牧藏豬中相對(duì)豐度顯著高... 

【文章來(lái)源】：畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,51(09)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：9 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
    1.2 屠宰采樣
    1.3 總DNA提取
    1.4 PCR擴(kuò)增
    1.5 文庫(kù)制備及測(cè)序
    1.6 測(cè)序信息分析
2 結(jié) 果
    2.1 盲腸微生物群落的豐富度及多樣性分析
    2.2 盲腸微生物群落分類學(xué)組成分析
    2.3 盲腸微生物群落組成聚類分析
3 討 論
4 結(jié) 論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]利用宏基因組學(xué)鑒定藏豬腹瀉糞便病毒種群[J]. 胡承哲,周群,李玉,張敏,湯承,張斌.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(12)
[2]飼糧能量水平對(duì)斷奶藏仔豬生產(chǎn)性能、養(yǎng)分消化率和血液生化指標(biāo)的影響[J]. 譚占坤,張定華,商鵬,劉鎖珠,強(qiáng)巴央宗,張健,董亞南.  西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(07)
[3]藏豬糞樣微生物對(duì)不同纖維底物的體外發(fā)酵[J]. 劉鎖珠,李龍,付冠華,王利紅,強(qiáng)巴央宗,李家奎.  中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(07)
[4]藏豬耐粗飼特性及其生化機(jī)理研究[J]. 李江凌,陳曉暉,劉銳,王秋實(shí),曾凱,廖黨金,高榮,呂學(xué)斌.  中國(guó)豬業(yè). 2015(02)
[5]藏豬食草機(jī)理的研究——藏豬腸道微生物的多樣性分析[J]. 肖文萍,劉海艷,趙海波,白龍,彭甲銀,劉雪青,王建剛,宋宇軒,曹斌云.  中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(03)

博士論文
[1]藏豬腸道細(xì)菌群落組成與纖維素分解菌的研究[D]. 楊偉平.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015



本文編號(hào)：3157358