發(fā)布時(shí)間：2021-04-24 01:55

　　隨著人們消費(fèi)觀念和文化結(jié)構(gòu)的不斷改變,馬匹的作用已由過(guò)去的役用轉(zhuǎn)變?yōu)楝F(xiàn)在的健身休閑娛樂(lè)騎乘工具。培育具有良好的觀賞性且速度耐力兼具,并有良好的抗病力和適應(yīng)性的馬匹品種,是馬匹育種工作的熱點(diǎn)。骨髓是研究免疫功能的典型器官,在機(jī)體起著造血和免疫細(xì)胞及免疫因子生成的功能。對(duì)骨髓表達(dá)譜的研究,有助于解析不同生物個(gè)體間免疫差異的分子機(jī)理。本實(shí)驗(yàn)利用Illumina Miseq高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)構(gòu)建的兩個(gè)蒙古馬和純血馬骨髓表達(dá)譜文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序,得到的數(shù)據(jù)用軟件處理后,在KO、KEGG、KOG等數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行注釋,得到的結(jié)果如下：1.蒙古馬和純血馬骨髓表達(dá)譜文庫(kù)測(cè)序得到的原始數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)去雜和篩選后,分別獲得了7116170和7219956的有效reads。2.對(duì)測(cè)序得到的基因數(shù)據(jù)在染色體上進(jìn)行注釋,兩個(gè)文庫(kù)注釋到1號(hào)、8號(hào)和11號(hào)染色體的reads最多,注釋到29號(hào)、30號(hào)和31號(hào)的reads最少。3.兩個(gè)文庫(kù)共篩出318差異表達(dá)基因,對(duì)比純血馬骨髓,蒙古馬骨髓表達(dá)量顯著上調(diào)的基因共有241個(gè),表達(dá)量顯著下調(diào)的基因共有77,其中有21個(gè)差異表達(dá)基因與免疫相關(guān)。4.GO功能富集分析和KEGG功能富集分析中均顯... 

【文章來(lái)源】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】：52 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 引言
    1.1 免疫概述
        1.1.1 免疫系統(tǒng)的組成
        1.1.2 免疫應(yīng)答反應(yīng)
        1.1.3 骨髓的生理生化功能
    1.2 馬常見(jiàn)疾病及免疫相關(guān)基因的研究進(jìn)展
    1.3 免疫相關(guān)基因研究技術(shù)
        1.3.1 基因表達(dá)譜
        1.3.2 轉(zhuǎn)錄組
        1.3.3 高通量測(cè)序
        1.3.4 Illumina/Solexa測(cè)序技術(shù)
    1.4 多樣本mRNA-seq數(shù)據(jù)的處理方法
        1.4.1 表達(dá)差異GO類別富集分析
        1.4.2 表達(dá)差異KOG富集分析
        1.4.3 表達(dá)差異KEGG富集分析
    1.5 蒙古馬與純血馬的體況特征
    1.6 本實(shí)驗(yàn)的目的意義以及主要研究?jī)?nèi)容
        1.6.1 實(shí)驗(yàn)的目的和意義
        1.6.2 實(shí)驗(yàn)內(nèi)容與方法
2 蒙古馬與純血馬骨髓表達(dá)譜文庫(kù)差異基因的研究
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)主要設(shè)備和儀器
        2.1.3 主要試劑
    2.2 實(shí)驗(yàn)過(guò)程
        2.2.1 總RNA的提取和檢測(cè)
        2.2.2 測(cè)序文庫(kù)的制備
        2.2.3 文庫(kù)測(cè)序
        2.2.4 骨髓表達(dá)譜文庫(kù)數(shù)據(jù)的可靠性驗(yàn)證
        2.2.5 數(shù)據(jù)的處理與分析
3 結(jié)果
    3.1 蒙古馬和純血馬骨髓表達(dá)譜文庫(kù)的建立
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)提取的總RNA質(zhì)量檢測(cè)結(jié)果
        3.1.2 構(gòu)建的cDNA文庫(kù)質(zhì)量檢測(cè)結(jié)果
    3.2 測(cè)序數(shù)據(jù)處理和分析結(jié)果
        3.2.1 基因組注釋信息
        3.2.2 染色體上的注釋結(jié)果
        3.2.3 基因表達(dá)譜分析結(jié)果
        3.2.4 差異基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)可靠性驗(yàn)證
4 分析討論
    4.1 建庫(kù)所用RNA的質(zhì)量評(píng)估
    4.2 染色體注釋結(jié)果分析
    4.3 差異表達(dá)基因結(jié)果分析
    4.4 差異表達(dá)基因GO富集分析
    4.5 差異表達(dá)基因KOG富集分析
    4.6 差異表達(dá)基因KEGG富集分析
5 結(jié)論、創(chuàng)新點(diǎn)與展望
    5.1 結(jié)論
    5.2 創(chuàng)新點(diǎn)
    5.3 論文的局限性
致謝
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)介


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]馬Toll樣受體表達(dá)水平SYBR Green Ⅰ熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 趙一萍,白東義,李蓓,黃金龍,張宇宏,芒來(lái).  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(02)
[2]蒙古馬不同組織器官TLR1、TLR2、TLR4和TLR6 mRNA轉(zhuǎn)錄水平研究[J]. 趙一萍,黃金龍,白東義,陳建興,趙啟南,芒來(lái).  中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2012(10)
[3]人骨髓和臍帶來(lái)源間充質(zhì)干細(xì)胞體外支持造血能力的比較研究[J]. 劉蒙,楊少光,劉鵬霞,杜偉廷,顧東生,盧士紅,邢文,韓忠朝.  中國(guó)實(shí)驗(yàn)血液學(xué)雜志. 2009(05)
[4]食管癌患者骨髓CK19 mRNA的表達(dá)及其臨床意義[J]. 陳少斌,林鵬,陳捷鑫,文靜,楊弘,解明然,張旭.  中國(guó)腫瘤臨床. 2009(19)
[5]成體骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞生物學(xué)特性及在組織工程和再生醫(yī)學(xué)中的作用[J]. 杜振宗,王海龍,宋劍非,鄭民,李牧.  中國(guó)組織工程研究與臨床康復(fù). 2009(33)
[6]中國(guó)漢族人群人類白細(xì)胞抗原DRB1* 04等位基因多態(tài)性[J]. 羅廣平,葉欣,夏文杰,程良紅,鄒紅巖,丁浩強(qiáng).  中國(guó)輸血雜志. 2009(04)
[7]鼻咽癌轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的現(xiàn)狀與進(jìn)展[J]. 黃琛,武明花,李桂源.  生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2007(11)
[8]不同年齡段人骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞生物學(xué)特性的研究[J]. 黃科,周敦華,黃紹良,梁舜華.  中國(guó)實(shí)驗(yàn)血液學(xué)雜志. 2005(06)

博士論文
[1]蒙古馬免疫相關(guān)基因表達(dá)研究及脾臟表達(dá)譜分析[D]. 趙一萍.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]梅花鹿鹿茸頂端組織轉(zhuǎn)錄組分析及不同生長(zhǎng)期差異基因篩選[D]. 幺寶金.吉林大學(xué) 2012
[3]馬MHC-Ⅱ類分子遺傳多樣性的研究[D]. 孟青龍.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005

碩士論文
[1]大黃魚(yú)脾臟轉(zhuǎn)錄組和表達(dá)譜分析以及過(guò)氧化物酶4結(jié)構(gòu)與功能研究[D]. 母尹楠.國(guó)家海洋局第三海洋研究所 2011



本文編號(hào)：3156455