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基于高通量測序和Q-PCR芯片技術(shù)分析養(yǎng)殖環(huán)境中蒼蠅攜帶細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)和耐藥基因特點(diǎn)

發(fā)布時間:2021-04-22 19:42
  利用高通量測序和定量聚合酶鏈反應(yīng)芯片技術(shù),分析和比較雞舍和奶牛舍糞便和蒼蠅細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)、潛在致病菌以及耐藥基因(Antibiotic resistance gene,ARG)和移動遺傳元件(Mobile genetic element,MGE)。動物糞便和蒼蠅樣品中鑒定出13個共有細(xì)菌門,且優(yōu)勢菌門一致,分別為厚壁菌門(Firmicutes)、變形菌門(Proteobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)和放線菌門(Actinobacteria)。另外,從蒼蠅和糞便樣品中分別檢測到32和21個潛在致病菌屬,其中9個為兩者共有;從蒼蠅和糞便中分別擴(kuò)增出242和273個ARG/MGE,其中215個為兩者共有。溯源分析顯示,蒼蠅攜帶菌群結(jié)構(gòu)、ARG和MGE均與其所處環(huán)境動物糞便相似性較高。養(yǎng)殖環(huán)境是蒼蠅攜帶細(xì)菌菌群和耐藥基因重要來源,蒼蠅可作為分析養(yǎng)殖環(huán)境中耐藥基因特點(diǎn)重要參考。 

【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,51(11)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:10 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 樣品采集
    1.2 細(xì)菌菌群分析
    1.3 Q-PCR芯片檢測
    1.4 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)
    2.2 細(xì)菌菌群α多樣性分析
    2.3 蒼蠅細(xì)菌菌群溯源
    2.4 潛在致病菌
    2.5 ARG和MGE特點(diǎn)
    2.6 共有ARG和MGE
3 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]畜禽養(yǎng)殖場空氣中可培養(yǎng)抗生素耐藥菌污染特點(diǎn)研究[J]. 張?zhí)m河,賀雨偉,陳默,高敏,仇天雷,王旭明.  環(huán)境科學(xué). 2016(12)
[2]垃圾填埋場蒼蠅和惡臭污染控制技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 張杰,李杭芬,趙由才,張瑞娜,宋立杰,邰俊.  環(huán)境污染與防治. 2016(01)



本文編號:3154355

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