為了研究促卵泡素β亞基（follicle stimulating hormone, FSHβ）基因在貴州6個(gè)地方雞種中的多態(tài)性并進(jìn)行FSHβ基因生物信息學(xué)分析,試驗(yàn)以矮腳雞、白宜黑雞、烏蒙鳳雞、高腳雞、威寧雞、竹鄉(xiāng)雞為研究對象,分別構(gòu)建DNA混池,用PCR產(chǎn)物直接測序法檢測FSHβ基因多態(tài)性,對FSHβ蛋白二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)及基本性質(zhì)進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明:矮腳雞、白宜黑雞、烏蒙鳳雞、高腳雞、威寧雞和竹鄉(xiāng)雞分別有11,6,7,6,6,3個(gè)SNP位點(diǎn)。FSHβ蛋白不穩(wěn)定且為分泌蛋白,含有信號肽序列,但不是跨膜蛋白。亞細(xì)胞定位在分泌通路S上,有一個(gè)卷曲螺旋結(jié)構(gòu)（置信值低）和疏水區(qū)域,保守結(jié)構(gòu)域在17～123位氨基酸之間。說明貴州6個(gè)地方雞種FSHβ基因具有較高的遺傳多樣性。 

【文章來源】：黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(09)北大核心

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

6個(gè)雞種基因組DNA瓊脂糖電泳檢測結(jié)果

矮腳雞、白宜黑雞、烏蒙鳳雞、高腳雞、威寧雞和竹鄉(xiāng)雞各SNP位點(diǎn)等位基因頻率估算結(jié)果見表2。表2 6個(gè)雞種FSHβ基因各SNP位點(diǎn)等位基因頻率估算結(jié)果Table 2 Estimation of various SNP allele frequency of FSHβ gene in 6 chicken species SNP位點(diǎn) 位置 等位基因頻率 矮腳雞 白宜黑雞 烏蒙鳳雞 高腳雞 威寧雞 竹香雞 A332C 內(nèi)含子1 A(0.37)C(0.63) A(0.5)C(0.5) T1542C 外顯子3 T(0.46)C(0.54) C1714T 外顯子3 C(0.45)T(0.55) C(0.50)T(0.50) C(0. 54)T(0.46) A1960C 外顯子3 A(0.55)C(0.45) A(0.63)C(0.37) G2285T 外顯子3 G(0.49)T(0.51) G(0.40)T(0.60) G2399T 外顯子3 G(0.32)T(0.68) G(0.21)T(0.79) G(0.24)T(0.76) G(0.39)T(0.61) T2528C 外顯子3 T(0.42)C(0.58) T(0.29)C(0.71) T(0.16)C(0.84) T(0.29)C(0.71) T(0.42)C(0.58) T(0.55)C(0.45) A2536G 外顯子3 A(0.11)G(0.89) A(0.31)G(0.69) A(0.14)G(0.86) A(0.33)G(0.67) A(0.31)G(0.69) A(0.48)G(0.52) A2642G 外顯子3 A(0.34)G(0.66) T2643A 外顯子3 T(0.58)A(0.42) G2770A 外顯子3 G(0.15)A(0.85) G(0.22)A(0.78) T2882C 外顯子3 T(0.40)C(0.60) A3189G 外顯子3 A(0.30)G(0.70) A(0.33)G(0.67) A(0.25)G(0.75) A(0.44)G(0.56) A(0.36)G(0.64) A(0.55)G(0.45) A3229G 外顯子3 A(0.42)G(0.58) A(0.40)G(0.60)

RNAfold web serve(http://nibiru.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgi)在線軟件預(yù)測結(jié)果顯示,突變位點(diǎn)A3189G導(dǎo)致FSHβ基因的mRNA二級結(jié)構(gòu)發(fā)生了改變,使RNA自由能升高,穩(wěn)定性降低。自由能由-3 414.917 2 kJ/mol變?yōu)?3 411.986 3 kJ/mol。FSHβ基因A3189G位點(diǎn)突變前后mRNA二級結(jié)構(gòu)變化情況見圖4。3.5.2 FSHβ蛋白理化性質(zhì)分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[2]雞FSHβ、ESRα基因多態(tài)性及其合并基因型與產(chǎn)蛋性能的關(guān)聯(lián)性分析[J]. 秦玉梅,任嵩,李佳玉,張璐,楊嫻婧,廖和榮,孫杰.  江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(04)
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碩士論文
[1]寧都黃雞FSH β和PRL基因多態(tài)性與產(chǎn)蛋性能的關(guān)聯(lián)性分析[D]. 李江曼.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]雞PRL、PRLR、FSHβ和ESRα基因多態(tài)性及其與早期產(chǎn)蛋性能關(guān)系的研究[D]. 洪坤月.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[3]雞FSHβ基因SNPs分析及其與早期產(chǎn)蛋性能關(guān)系的研究[D]. 韓厚明.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006



本文編號：3137802