為研究豬流行性腹瀉病毒（PEDV）變異株特性,通過細(xì)胞培養(yǎng)、細(xì)胞病變（CPE）觀察、RT-PCR、間接免疫熒光實(shí)驗(yàn)和透射電鏡觀察分離鑒定1株P(guān)EDV變異株（CH/YNKM-8/2013株）并分析了全基因組序列。運(yùn)用基因組分段擴(kuò)增方法,測得該毒株的全基因組序列（GenBank登錄號為KF761675.1）。該毒株S基因N端比CV777毒株S基因的N端長9bp,包括15bp的插入和6bp的缺失,表明CH/YNKM-8/2013為變異毒株。同源性分析顯示,該毒株的基因組序列與我國廣東2011年分離毒株LC的同源關(guān)系最近,相似性為99.6%,與韓國毒株KNU-1305和美國毒株USA/Minnesota84/2013的序列相似性均為99.0%,而與CV777疫苗毒株的相似性較低,為96.7%。序列進(jìn)化樹分析表明該毒株和我國新近毒株、韓國及美國的變異毒株進(jìn)化關(guān)系較近,而與我國之前流行的PEDV毒株以及疫苗毒株CV777處于不同分支。 

【文章來源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016,35(04)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 病料的來源和處理
    1.2 細(xì)胞、菌株和主要試劑
    1.3 病毒分離
    1.4 病毒的鑒定
    1.5 全基因組測序和序列分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 病毒的分離
    2.2 病毒的鑒定
    2.3 全基因組的序列
    2.4 全基因組和S基因的同源性分析
    2.5 全基因組和全S基因的進(jìn)化樹分析
    2.6 CH/YNKM-8/2013毒株、CV777毒株和其他參考毒株全基因組和全S基因組序列突變位點(diǎn)分析
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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