與PCV2基因組DNA相互作用宿主細胞蛋白的篩選及其功能研究
發(fā)布時間:2021-04-08 04:47
豬圓環(huán)病毒2型(Porcine circovirus type2, PCV2)基因組為單鏈環(huán)狀DNA,包含兩個主要開放閱讀框。ORF1編碼2個與病毒復(fù)制相關(guān)的蛋白(Rep和Rep’),Rep由全長ORF1編碼314個氨基酸(aa)組成,Rep’由ORF1轉(zhuǎn)錄剪接內(nèi)含子而來,由178個aa組成。Rep與Rep’蛋白形成的復(fù)合體是病毒復(fù)制所必需的,在宿主細胞酶類分子的參與下,該病毒復(fù)制以滾環(huán)復(fù)制機制(Rolling-circle replication, RCR)完成的。由于PCV2基因組較小,編碼蛋白數(shù)量有限,據(jù)此推測病毒復(fù)制需要宿主細胞酶類分子的參與,究竟宿主細胞哪類蛋白參與其中所知甚少。本研究通過酵母單雜交技術(shù)篩選宿主細胞中與PCV2復(fù)制相關(guān)的蛋白,從病毒宿主細胞-豬腎細胞株(PK-15)中初步鑒定出有4種蛋白與PCV2基因組莖環(huán)序列發(fā)生互作,這4種蛋白分別為配體相關(guān)蛋白復(fù)合體(AP2α2)、ETS相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子(Elf4)、鐵硫束組裝酶(ISCU)蛋白和肌動蛋白(p-actin);進一步通過蛋白過表達及RNAi技術(shù)驗證這些蛋白對PCV2病毒復(fù)制的調(diào)節(jié)作用。第一、與PCV2基因組莖環(huán)...
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:51 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
RCR溶爐模型(A);PCV的復(fù)制模型(B)
重組載體pAbAi-SL54雙酶切和凝膠電泳表明,從重組質(zhì)粒上切下了與蓮環(huán)結(jié)構(gòu)序列長度一致的片段(60 bp)(圖2.1),表明目的順式元件序列已成功與pAbAi載體連接。將酶切片段長度正確的重組質(zhì)粒送測序鑒定,插入序列與基環(huán)寡聚核若酸序列完全一致且方向正確,將誘館載體命名為 pAbAi-SL54。2. 2. 2誘館酵母菌株AbA的最低使用濃度的確定菌落PCR鑒定結(jié)果(圖2.2)表明獲得了長度約為1.4 kb的目的片段,證明線性化的pAbAi-SL54株誘餅載體已整合到酵母YlHGold基因組中,成功獲得了誘謂酵母菌株。將誘館酵母涂布在含不同濃度AbA的SDAUra固體培養(yǎng)基上,當(dāng)AbA濃度達到200ng/mL時,仍不能完全抑制酵母菌的生長,因此繼續(xù)提高AbA濃度,當(dāng)AbA的濃度提高到1000 ng/mL時
3.2.1目的基因的PCR擴増以PK-15細胞cDNA為模板,PCR擴增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,AP2(x2、Elf4和ISCU基因分別在預(yù)期位置2601 bp、1989 bp和919 bp處出現(xiàn)特異性條帶,表明三種擴增產(chǎn)物正確(圖3.1)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]抗豬圓環(huán)病毒2型Cap蛋白中和性單克隆抗體的制備及鑒定[J]. 黃立平,劉長明,危艷武,張朝霞,陸月華,郭龍軍. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2009(02)
[2]豬圓環(huán)病毒2型免疫過氧化物酶單層細胞試驗抗體檢測試劑盒的研制及應(yīng)用[J]. 劉長明,張超范,危艷武,張朝霞,袁婧. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2007(08)
[3]豬圓環(huán)病毒2型細胞培養(yǎng)適應(yīng)毒株的培育和鑒定[J]. 劉長明,張超范,危艷武,譚斌,陸月華,谷守林. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2006(03)
[4]酵母單雜交體系——一種研究DNA-蛋白質(zhì)相互作用的有效方法[J]. 廖名湘,方福德. 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院學(xué)報. 2000(04)
本文編號:3124879
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:51 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
RCR溶爐模型(A);PCV的復(fù)制模型(B)
重組載體pAbAi-SL54雙酶切和凝膠電泳表明,從重組質(zhì)粒上切下了與蓮環(huán)結(jié)構(gòu)序列長度一致的片段(60 bp)(圖2.1),表明目的順式元件序列已成功與pAbAi載體連接。將酶切片段長度正確的重組質(zhì)粒送測序鑒定,插入序列與基環(huán)寡聚核若酸序列完全一致且方向正確,將誘館載體命名為 pAbAi-SL54。2. 2. 2誘館酵母菌株AbA的最低使用濃度的確定菌落PCR鑒定結(jié)果(圖2.2)表明獲得了長度約為1.4 kb的目的片段,證明線性化的pAbAi-SL54株誘餅載體已整合到酵母YlHGold基因組中,成功獲得了誘謂酵母菌株。將誘館酵母涂布在含不同濃度AbA的SDAUra固體培養(yǎng)基上,當(dāng)AbA濃度達到200ng/mL時,仍不能完全抑制酵母菌的生長,因此繼續(xù)提高AbA濃度,當(dāng)AbA的濃度提高到1000 ng/mL時
3.2.1目的基因的PCR擴増以PK-15細胞cDNA為模板,PCR擴增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,AP2(x2、Elf4和ISCU基因分別在預(yù)期位置2601 bp、1989 bp和919 bp處出現(xiàn)特異性條帶,表明三種擴增產(chǎn)物正確(圖3.1)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]抗豬圓環(huán)病毒2型Cap蛋白中和性單克隆抗體的制備及鑒定[J]. 黃立平,劉長明,危艷武,張朝霞,陸月華,郭龍軍. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2009(02)
[2]豬圓環(huán)病毒2型免疫過氧化物酶單層細胞試驗抗體檢測試劑盒的研制及應(yīng)用[J]. 劉長明,張超范,危艷武,張朝霞,袁婧. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2007(08)
[3]豬圓環(huán)病毒2型細胞培養(yǎng)適應(yīng)毒株的培育和鑒定[J]. 劉長明,張超范,危艷武,譚斌,陸月華,谷守林. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2006(03)
[4]酵母單雜交體系——一種研究DNA-蛋白質(zhì)相互作用的有效方法[J]. 廖名湘,方福德. 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院學(xué)報. 2000(04)
本文編號:3124879
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