長(zhǎng)角血蜱MESK基因的克
發(fā)布時(shí)間:2021-03-30 11:29
蜱是重要的病原傳播媒介之一,通過在宿主表皮叮咬吸血廣泛傳播細(xì)菌、病毒、原蟲在內(nèi)的多種病原微生物。蜱的感染誘導(dǎo)宿主的免疫系統(tǒng)同時(shí)產(chǎn)生天然免疫和獲得性免疫。蜱源免疫調(diào)節(jié)蛋白的作用是在蜱吸血期間調(diào)節(jié)宿主的免疫系統(tǒng),參與宿主免疫細(xì)胞相關(guān)生理生化反應(yīng)及調(diào)節(jié)細(xì)胞信號(hào)通路,為蜱持續(xù)性吸血提供條件,同時(shí)影響蜱傳病原微生物在宿主的體內(nèi)傳播。目前已有多種具有免疫調(diào)節(jié)功能的蜱源蛋白被陸續(xù)發(fā)現(xiàn),并將其列為控蜱疫苗的靶基因,從而為研制控蜱生物疫苗奠定理論基礎(chǔ)。研究蜱源免疫調(diào)節(jié)蛋白既在防控蜱傳疾病上具有重大意義,同時(shí)也具有開發(fā)成免疫系統(tǒng)調(diào)節(jié)功能藥物,治療人類免疫系統(tǒng)相關(guān)疾病的巨大潛力。長(zhǎng)角血蜱(Haemaphysalis longicornis)MESK(Misexpression suppressor of KSR)基因是從長(zhǎng)角血蜱cDNA文庫(kù)中擴(kuò)增獲得,基于生物信息學(xué)分析和已有研究成果,預(yù)測(cè)其可能是作用于細(xì)胞絲裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated protein kinases, MAPK)信號(hào)通路的基因。目前確切的MESK系列基因生物學(xué)功能尚未得到詳盡的闡述。根據(jù)Swissmodel數(shù)據(jù)庫(kù)服...
【文章來源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:61 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
MAPK之間相互作用關(guān)系
圖 3.1 長(zhǎng)角血蜱 MESK 基因開放閱讀框的擴(kuò)增Fig 3.1 The PCR product of ORF of MESK from Haemaphysalis longicornisM:DL2000標(biāo)準(zhǔn)分子質(zhì)量;1~2:MESK基因的PCR產(chǎn)物;M: DL2000 DNA Marker; 1~2: The PCR amplified MESK gene;蜱 MESK 基因的生物信息分析ESK 基因全長(zhǎng)為 1426bp,包括一個(gè)長(zhǎng)為 1185bp 的完整閱讀框9 位開始,終止密碼子到 1283 位結(jié)束。序列編碼 394 個(gè)氨基酸性氨基酸,132 個(gè)疏水性氨基酸,110 個(gè)極性氨基酸,等電點(diǎn)(PI點(diǎn)分析如表 3.1。 Scansite motif scan 功能位點(diǎn)分析如表 3.2。對(duì)號(hào)肽預(yù)測(cè),表明該蛋白無跨膜區(qū),是一種膜外蛋白,如圖 3.2。對(duì)行同源建模,紅色部分代表 螺旋,黃色部分為 β 折疊,此 3D結(jié)構(gòu)構(gòu)建,兩者一致性為 37.755%,如圖 3.3。長(zhǎng)角血蜱 MESKmain Database 數(shù)據(jù)庫(kù)(http:// www.ncbi.nlm.nih.gov/ Structure/cd結(jié)果顯示,長(zhǎng)角血蜱 MESK 排除了具有 NDR 結(jié)構(gòu)域蛋白的超家mains。根據(jù)最高匹配得分分析,長(zhǎng)角血蜱 MESK 更有可能和 he,如圖 3.4。長(zhǎng)角血蜱 MESK 氨基酸序列與 GenBank 中其他物種序列比對(duì),利用 MEGA4.0 軟件采用 NJ 法構(gòu)建進(jìn)化樹(如圖 3
TMHMMServer,V.2.0結(jié)果
本文編號(hào):3109432
【文章來源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:61 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
MAPK之間相互作用關(guān)系
圖 3.1 長(zhǎng)角血蜱 MESK 基因開放閱讀框的擴(kuò)增Fig 3.1 The PCR product of ORF of MESK from Haemaphysalis longicornisM:DL2000標(biāo)準(zhǔn)分子質(zhì)量;1~2:MESK基因的PCR產(chǎn)物;M: DL2000 DNA Marker; 1~2: The PCR amplified MESK gene;蜱 MESK 基因的生物信息分析ESK 基因全長(zhǎng)為 1426bp,包括一個(gè)長(zhǎng)為 1185bp 的完整閱讀框9 位開始,終止密碼子到 1283 位結(jié)束。序列編碼 394 個(gè)氨基酸性氨基酸,132 個(gè)疏水性氨基酸,110 個(gè)極性氨基酸,等電點(diǎn)(PI點(diǎn)分析如表 3.1。 Scansite motif scan 功能位點(diǎn)分析如表 3.2。對(duì)號(hào)肽預(yù)測(cè),表明該蛋白無跨膜區(qū),是一種膜外蛋白,如圖 3.2。對(duì)行同源建模,紅色部分代表 螺旋,黃色部分為 β 折疊,此 3D結(jié)構(gòu)構(gòu)建,兩者一致性為 37.755%,如圖 3.3。長(zhǎng)角血蜱 MESKmain Database 數(shù)據(jù)庫(kù)(http:// www.ncbi.nlm.nih.gov/ Structure/cd結(jié)果顯示,長(zhǎng)角血蜱 MESK 排除了具有 NDR 結(jié)構(gòu)域蛋白的超家mains。根據(jù)最高匹配得分分析,長(zhǎng)角血蜱 MESK 更有可能和 he,如圖 3.4。長(zhǎng)角血蜱 MESK 氨基酸序列與 GenBank 中其他物種序列比對(duì),利用 MEGA4.0 軟件采用 NJ 法構(gòu)建進(jìn)化樹(如圖 3
TMHMMServer,V.2.0結(jié)果
本文編號(hào):3109432
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