梅花鹿鹿茸產(chǎn)量相關(guān)SNP的開發(fā)與驗(yàn)證
發(fā)布時(shí)間:2021-03-29 10:53
本研究利用質(zhì)譜SNP分型技術(shù)對(duì)梅花鹿產(chǎn)茸性狀的候選變異位點(diǎn)進(jìn)行檢測(cè),并與之進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,以期挖掘到影響梅花鹿鹿茸產(chǎn)量的有效分子標(biāo)記,為梅花鹿早期選種提供科學(xué)依據(jù)。研究結(jié)果如下:1、本研究以四平梅花鹿和東大梅花鹿兩個(gè)群體為研究對(duì)象,對(duì)其產(chǎn)茸性能進(jìn)行分析,結(jié)果表明:四平梅花鹿群體1~9鋸三杈鮮茸平均單產(chǎn)為3.79±1.28 kg,三杈鮮茸最高平均單產(chǎn)為5.11±2.27 kg;1~7鋸三杈鮮茸重與年齡呈正線性相關(guān),線性方程為y=0.72x+0.36(n=105,R2=0.96,P<0.01);最佳生茸年齡范圍為4~9鋸,最佳生茸年齡為7鋸。東大梅花鹿群體1~7鋸三杈鮮茸平均單產(chǎn)為4.84±1.4 kg,三杈鮮茸最高平均單產(chǎn)為6.12±2.19 kg;1~6鋸三杈鮮茸重與年齡呈正線性相關(guān),線性方程為y=0.77x+1.95(n=70,R2=0.99,P<0.01);最佳生茸年齡范圍為2~7鋸,最佳生茸年齡為6鋸。2、運(yùn)用質(zhì)譜SNP分型技術(shù),對(duì)四平和東大兩個(gè)群體共265只梅花鹿的94個(gè)與產(chǎn)茸性狀顯著相關(guān)的候選SNP位點(diǎn)進(jìn)行分型檢測(cè),結(jié)果表...
【文章來源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
MassARRAYSNP檢測(cè)流程
中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章梅花鹿產(chǎn)茸性能分析與估測(cè)12<0.05)。綜上可知,四平梅花鹿群體的最佳生茸年齡范圍為4~9鋸,最佳生茸年齡為7鋸。2.2.3四平梅花鹿產(chǎn)茸量與年齡的關(guān)系根據(jù)不同年齡(鋸別)所對(duì)應(yīng)的產(chǎn)茸量,繪制產(chǎn)茸量與年齡散點(diǎn)圖(圖2-1)。由圖可知:四平梅花鹿從2齡到8齡之間,隨著年齡的增長(zhǎng)產(chǎn)茸量逐漸增高,到達(dá)8齡后,產(chǎn)茸量隨著年齡的增長(zhǎng)而緩慢下降。產(chǎn)茸量與年齡之間存在的回歸方程為y=-0.0043x3-0.0105x2+0.908x+0.5384(n=105,R2=0.99)。四平梅花鹿8齡以內(nèi),年齡與鮮茸重呈強(qiáng)正線性相關(guān),線性回歸方程為y=0.72x+0.36(n=105,R2=0.96,P<0.01)。圖2-1四平梅花鹿產(chǎn)茸量與年齡的關(guān)系Fig.2-1TherelationshipbetweensikadeeryieldandageinSiping2.2.4東大梅花鹿1~7鋸三杈鮮茸重統(tǒng)計(jì)由于東大梅花鹿所搜集到的產(chǎn)茸記錄不全,僅有70個(gè)個(gè)體具有較全的產(chǎn)茸記錄,很多個(gè)體不清楚其出生年份,無法準(zhǔn)確按照鋸別對(duì)其進(jìn)行分組,故本研究對(duì)70只東大梅花鹿鹿茸重量性狀表型參數(shù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。東大梅花鹿1~7鋸標(biāo)準(zhǔn)三杈鮮茸單產(chǎn)及標(biāo)準(zhǔn)差、變異系數(shù)(CV)、增長(zhǎng)率和遞增率見表2-2。表2-2東大梅花鹿1~7鋸三杈鮮茸重統(tǒng)計(jì)結(jié)果Table2-2Threebranchedantlerweightofsaws1~7ofDongdasikadeer項(xiàng)目鋸別1234567N1428536147268x(kg)2.06d4.17c4.77b5.29b5.61a6.16a5.82as(kg)0.551.361.801.661.842.191.02cv(%)26.7032.6137.7331.3832.8035.5627.53增長(zhǎng)率(%)100202232257272299283遞增率(%)102.4314.3910.906.059.80-5.51
第二章梅花鹿產(chǎn)茸性能分析與估測(cè)132.2.5東大梅花鹿最佳生茸年齡及年齡范圍經(jīng)對(duì)1~7鋸公鹿鮮茸重的方差分析和對(duì)各鋸別間產(chǎn)茸量的多重比較,結(jié)果表明,鋸別對(duì)產(chǎn)茸量的影響非常明顯,1、2鋸顯著低于其它鋸別(P<0.05)且1、2鋸之間差異也顯著(P<0.05);5、6、7鋸之間無顯著差異(P>0.05),均顯著高于其它組(P<0.05);3、4鋸之間無顯著差異(P>0.05)。綜上,東大梅花鹿群體最佳生茸年齡范圍為2~7鋸,最佳生茸年齡為6鋸。2.2.6東大梅花鹿產(chǎn)茸量與年齡的關(guān)系根據(jù)不同年齡(鋸別)所對(duì)應(yīng)的產(chǎn)茸量,繪制產(chǎn)茸量與年齡散點(diǎn)圖(圖2-2)。由圖可知:東大梅花鹿從2齡到7齡之間鹿茸產(chǎn)量逐漸上升,8齡的產(chǎn)茸量略有下降,表明東大梅花鹿在7齡以內(nèi)產(chǎn)茸量隨年齡的增長(zhǎng)而升高。產(chǎn)茸量與年齡之間存在的回歸方程為y=0.0258x3-0.463x2+2.8627x-0.2329(n=70,R2=0.97)。東大梅花鹿7齡以內(nèi),年齡與鮮茸重呈強(qiáng)正線性相關(guān),線性回歸方程為y=0.77x+1.95(n=70,R2=0.99,P<0.01)。圖2-2東大梅花鹿產(chǎn)茸量與年齡的關(guān)系Fig.2-2TherelationshipbetweensikadeeryieldandageinDongda2.2.7梅花鹿產(chǎn)茸性能估測(cè)產(chǎn)茸性能是選擇種公鹿的核心標(biāo)準(zhǔn),根據(jù)產(chǎn)茸記錄,篩選出產(chǎn)茸性能高的個(gè)體是梅花鹿育種工作的核心。由于鹿場(chǎng)中梅花鹿年齡不同,其鋸茸的次數(shù)也不同,同時(shí)受到鹿場(chǎng)規(guī)模、管理水平及飼養(yǎng)員變更的影響,梅花鹿產(chǎn)茸記錄往往會(huì)出現(xiàn)缺失,數(shù)據(jù)不整齊。為更好地對(duì)公鹿產(chǎn)茸能力進(jìn)行評(píng)估,李和平等建立了估測(cè)、比較具有不同次產(chǎn)茸記錄公鹿產(chǎn)茸能力的數(shù)學(xué)模型。該方法假設(shè)對(duì)于第i頭公鹿有Ki次產(chǎn)茸記錄,則這頭公鹿最有可能的產(chǎn)茸能力(Pi)為:Pi=P(1-t)/[1+(Ki-1)t]+Xi×Ki×t/[1+(Ki-1)t](2-1)其中:P指鹿群鋸平均產(chǎn)茸量;t指同一公鹿不同鋸別產(chǎn)茸記錄之間的相關(guān)性(重復(fù)力
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]營(yíng)養(yǎng)因素對(duì)鹿茸生長(zhǎng)發(fā)育的調(diào)節(jié)作用[J]. 孫偉麗,趙海平,王艷梅,李光玉. 特產(chǎn)研究. 2019(04)
[2]東豐縣梅花鹿產(chǎn)業(yè)發(fā)展及突破發(fā)展瓶頸的對(duì)策研究[J]. 常晶,王全. 吉林金融研究. 2018(01)
[3]利用全基因組重測(cè)序分析鹿茸重量相關(guān)基因[J]. 胡鵬飛,徐佳萍,艾成,邵秀娟,王洪亮,董依萌,崔學(xué)哲,楊福合,邢秀梅. 遺傳. 2017(11)
[4]雙陽梅花鹿IGF1基因多態(tài)性與產(chǎn)茸性狀相關(guān)分析[J]. 田萬年,張亞麗. 畜牧與獸醫(yī). 2017(09)
[5]南方梅花鹿年齡及鹿茸形態(tài)對(duì)產(chǎn)茸量的影響[J]. 楊菲菲,熊家軍. 湖北畜牧獸醫(yī). 2017(06)
[6]華南梅花鹿研究現(xiàn)狀及展望[J]. 章叔巖,郭瑞,劉偉,翁?hào)|明,程樟峰. 浙江林業(yè)科技. 2016(02)
[7]DNA測(cè)序技術(shù)方法研究及其進(jìn)展[J]. 謝浩,趙明,胡志迪,王大巾,孟旭莉,丁先鋒. 生命的化學(xué). 2015(06)
[8]日糧蛋白質(zhì)水平對(duì)貴州省梅花鹿鹿茸生長(zhǎng)的影響[J]. 李平,燕志宏,田松軍,魏小紅,顧麗菊,任麗群. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(10)
[9]中國(guó)家養(yǎng)梅花鹿種質(zhì)資源特性及其保存與利用的途徑分析[J]. 胡鵬飛,劉華淼,邢秀梅. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2015(10)
[10]梅花鹿引來致富路[J]. 盧新松,陸家木. 農(nóng)村工作通訊. 2014(20)
博士論文
[1]利用二代測(cè)序挖掘雞拷貝數(shù)變異及影響飼料效率的候選基因[D]. 易國(guó)強(qiáng).中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]梅花鹿激素及其受體基因變異對(duì)產(chǎn)茸量的調(diào)控效應(yīng)研究[D]. 熊家軍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[3]梅花鹿(Cervus nippon)DRB基因的遺傳特性、多態(tài)性及與產(chǎn)茸性狀的相關(guān)性[D]. 李波.東北林業(yè)大學(xué) 2008
[4]梅花鹿、馬鹿?fàn)I養(yǎng)、血清IGF-1濃度及鹿茸生長(zhǎng)規(guī)律研究[D]. 李光玉.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2005
碩士論文
[1]應(yīng)用mtDNA和Y染色體基因片段解析梅花鹿種公鹿的母系及父系類型[D]. 周永娜.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
[2]華南地區(qū)荷斯坦奶牛DHI報(bào)告分析及與產(chǎn)奶性狀相關(guān)功能基因的挖掘[D]. 王凱.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]梅花鹿MTNR1A基因多態(tài)性及其與產(chǎn)茸量的相關(guān)性研究[D]. 熊麗容.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]梅花鹿轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子β1基因多態(tài)與產(chǎn)茸性狀的相關(guān)性研究[D]. 陳斌.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2011
[5]梅花鹿雄激素受體(AR)基因多態(tài)性及其與產(chǎn)茸性能關(guān)系的研究[D]. 諶磊.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[6]黑龍江省部分地區(qū)梅花鹿微衛(wèi)星遺傳多樣性的研究[D]. 孫海濤.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2009
[7]染色體N帶研究和用分子標(biāo)記技術(shù)探討東北梅花鹿遺傳多態(tài)性[D]. 韓莉.重慶師范大學(xué) 2009
[8]梅花鹿鹿茸的組織學(xué)及間充質(zhì)層細(xì)胞體外誘導(dǎo)分化研究[D]. 李光鳳.吉林大學(xué) 2008
本文編號(hào):3107428
【文章來源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
MassARRAYSNP檢測(cè)流程
中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章梅花鹿產(chǎn)茸性能分析與估測(cè)12<0.05)。綜上可知,四平梅花鹿群體的最佳生茸年齡范圍為4~9鋸,最佳生茸年齡為7鋸。2.2.3四平梅花鹿產(chǎn)茸量與年齡的關(guān)系根據(jù)不同年齡(鋸別)所對(duì)應(yīng)的產(chǎn)茸量,繪制產(chǎn)茸量與年齡散點(diǎn)圖(圖2-1)。由圖可知:四平梅花鹿從2齡到8齡之間,隨著年齡的增長(zhǎng)產(chǎn)茸量逐漸增高,到達(dá)8齡后,產(chǎn)茸量隨著年齡的增長(zhǎng)而緩慢下降。產(chǎn)茸量與年齡之間存在的回歸方程為y=-0.0043x3-0.0105x2+0.908x+0.5384(n=105,R2=0.99)。四平梅花鹿8齡以內(nèi),年齡與鮮茸重呈強(qiáng)正線性相關(guān),線性回歸方程為y=0.72x+0.36(n=105,R2=0.96,P<0.01)。圖2-1四平梅花鹿產(chǎn)茸量與年齡的關(guān)系Fig.2-1TherelationshipbetweensikadeeryieldandageinSiping2.2.4東大梅花鹿1~7鋸三杈鮮茸重統(tǒng)計(jì)由于東大梅花鹿所搜集到的產(chǎn)茸記錄不全,僅有70個(gè)個(gè)體具有較全的產(chǎn)茸記錄,很多個(gè)體不清楚其出生年份,無法準(zhǔn)確按照鋸別對(duì)其進(jìn)行分組,故本研究對(duì)70只東大梅花鹿鹿茸重量性狀表型參數(shù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。東大梅花鹿1~7鋸標(biāo)準(zhǔn)三杈鮮茸單產(chǎn)及標(biāo)準(zhǔn)差、變異系數(shù)(CV)、增長(zhǎng)率和遞增率見表2-2。表2-2東大梅花鹿1~7鋸三杈鮮茸重統(tǒng)計(jì)結(jié)果Table2-2Threebranchedantlerweightofsaws1~7ofDongdasikadeer項(xiàng)目鋸別1234567N1428536147268x(kg)2.06d4.17c4.77b5.29b5.61a6.16a5.82as(kg)0.551.361.801.661.842.191.02cv(%)26.7032.6137.7331.3832.8035.5627.53增長(zhǎng)率(%)100202232257272299283遞增率(%)102.4314.3910.906.059.80-5.51
第二章梅花鹿產(chǎn)茸性能分析與估測(cè)132.2.5東大梅花鹿最佳生茸年齡及年齡范圍經(jīng)對(duì)1~7鋸公鹿鮮茸重的方差分析和對(duì)各鋸別間產(chǎn)茸量的多重比較,結(jié)果表明,鋸別對(duì)產(chǎn)茸量的影響非常明顯,1、2鋸顯著低于其它鋸別(P<0.05)且1、2鋸之間差異也顯著(P<0.05);5、6、7鋸之間無顯著差異(P>0.05),均顯著高于其它組(P<0.05);3、4鋸之間無顯著差異(P>0.05)。綜上,東大梅花鹿群體最佳生茸年齡范圍為2~7鋸,最佳生茸年齡為6鋸。2.2.6東大梅花鹿產(chǎn)茸量與年齡的關(guān)系根據(jù)不同年齡(鋸別)所對(duì)應(yīng)的產(chǎn)茸量,繪制產(chǎn)茸量與年齡散點(diǎn)圖(圖2-2)。由圖可知:東大梅花鹿從2齡到7齡之間鹿茸產(chǎn)量逐漸上升,8齡的產(chǎn)茸量略有下降,表明東大梅花鹿在7齡以內(nèi)產(chǎn)茸量隨年齡的增長(zhǎng)而升高。產(chǎn)茸量與年齡之間存在的回歸方程為y=0.0258x3-0.463x2+2.8627x-0.2329(n=70,R2=0.97)。東大梅花鹿7齡以內(nèi),年齡與鮮茸重呈強(qiáng)正線性相關(guān),線性回歸方程為y=0.77x+1.95(n=70,R2=0.99,P<0.01)。圖2-2東大梅花鹿產(chǎn)茸量與年齡的關(guān)系Fig.2-2TherelationshipbetweensikadeeryieldandageinDongda2.2.7梅花鹿產(chǎn)茸性能估測(cè)產(chǎn)茸性能是選擇種公鹿的核心標(biāo)準(zhǔn),根據(jù)產(chǎn)茸記錄,篩選出產(chǎn)茸性能高的個(gè)體是梅花鹿育種工作的核心。由于鹿場(chǎng)中梅花鹿年齡不同,其鋸茸的次數(shù)也不同,同時(shí)受到鹿場(chǎng)規(guī)模、管理水平及飼養(yǎng)員變更的影響,梅花鹿產(chǎn)茸記錄往往會(huì)出現(xiàn)缺失,數(shù)據(jù)不整齊。為更好地對(duì)公鹿產(chǎn)茸能力進(jìn)行評(píng)估,李和平等建立了估測(cè)、比較具有不同次產(chǎn)茸記錄公鹿產(chǎn)茸能力的數(shù)學(xué)模型。該方法假設(shè)對(duì)于第i頭公鹿有Ki次產(chǎn)茸記錄,則這頭公鹿最有可能的產(chǎn)茸能力(Pi)為:Pi=P(1-t)/[1+(Ki-1)t]+Xi×Ki×t/[1+(Ki-1)t](2-1)其中:P指鹿群鋸平均產(chǎn)茸量;t指同一公鹿不同鋸別產(chǎn)茸記錄之間的相關(guān)性(重復(fù)力
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]營(yíng)養(yǎng)因素對(duì)鹿茸生長(zhǎng)發(fā)育的調(diào)節(jié)作用[J]. 孫偉麗,趙海平,王艷梅,李光玉. 特產(chǎn)研究. 2019(04)
[2]東豐縣梅花鹿產(chǎn)業(yè)發(fā)展及突破發(fā)展瓶頸的對(duì)策研究[J]. 常晶,王全. 吉林金融研究. 2018(01)
[3]利用全基因組重測(cè)序分析鹿茸重量相關(guān)基因[J]. 胡鵬飛,徐佳萍,艾成,邵秀娟,王洪亮,董依萌,崔學(xué)哲,楊福合,邢秀梅. 遺傳. 2017(11)
[4]雙陽梅花鹿IGF1基因多態(tài)性與產(chǎn)茸性狀相關(guān)分析[J]. 田萬年,張亞麗. 畜牧與獸醫(yī). 2017(09)
[5]南方梅花鹿年齡及鹿茸形態(tài)對(duì)產(chǎn)茸量的影響[J]. 楊菲菲,熊家軍. 湖北畜牧獸醫(yī). 2017(06)
[6]華南梅花鹿研究現(xiàn)狀及展望[J]. 章叔巖,郭瑞,劉偉,翁?hào)|明,程樟峰. 浙江林業(yè)科技. 2016(02)
[7]DNA測(cè)序技術(shù)方法研究及其進(jìn)展[J]. 謝浩,趙明,胡志迪,王大巾,孟旭莉,丁先鋒. 生命的化學(xué). 2015(06)
[8]日糧蛋白質(zhì)水平對(duì)貴州省梅花鹿鹿茸生長(zhǎng)的影響[J]. 李平,燕志宏,田松軍,魏小紅,顧麗菊,任麗群. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(10)
[9]中國(guó)家養(yǎng)梅花鹿種質(zhì)資源特性及其保存與利用的途徑分析[J]. 胡鵬飛,劉華淼,邢秀梅. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2015(10)
[10]梅花鹿引來致富路[J]. 盧新松,陸家木. 農(nóng)村工作通訊. 2014(20)
博士論文
[1]利用二代測(cè)序挖掘雞拷貝數(shù)變異及影響飼料效率的候選基因[D]. 易國(guó)強(qiáng).中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]梅花鹿激素及其受體基因變異對(duì)產(chǎn)茸量的調(diào)控效應(yīng)研究[D]. 熊家軍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[3]梅花鹿(Cervus nippon)DRB基因的遺傳特性、多態(tài)性及與產(chǎn)茸性狀的相關(guān)性[D]. 李波.東北林業(yè)大學(xué) 2008
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碩士論文
[1]應(yīng)用mtDNA和Y染色體基因片段解析梅花鹿種公鹿的母系及父系類型[D]. 周永娜.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
[2]華南地區(qū)荷斯坦奶牛DHI報(bào)告分析及與產(chǎn)奶性狀相關(guān)功能基因的挖掘[D]. 王凱.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]梅花鹿MTNR1A基因多態(tài)性及其與產(chǎn)茸量的相關(guān)性研究[D]. 熊麗容.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]梅花鹿轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子β1基因多態(tài)與產(chǎn)茸性狀的相關(guān)性研究[D]. 陳斌.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2011
[5]梅花鹿雄激素受體(AR)基因多態(tài)性及其與產(chǎn)茸性能關(guān)系的研究[D]. 諶磊.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[6]黑龍江省部分地區(qū)梅花鹿微衛(wèi)星遺傳多樣性的研究[D]. 孫海濤.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2009
[7]染色體N帶研究和用分子標(biāo)記技術(shù)探討東北梅花鹿遺傳多態(tài)性[D]. 韓莉.重慶師范大學(xué) 2009
[8]梅花鹿鹿茸的組織學(xué)及間充質(zhì)層細(xì)胞體外誘導(dǎo)分化研究[D]. 李光鳳.吉林大學(xué) 2008
本文編號(hào):3107428
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