作為肉雞骨骼肌的主要組成部分,胸肌組織發(fā)育對肉雞生產(chǎn)效率有著重要的影響。肌內(nèi)脂肪（Intramuscular fat,IMF）是影響肉品質(zhì)的關鍵指標之一,雞的IMF無法從肌肉組織中直接分離出來,傳統(tǒng)轉(zhuǎn)錄組得到IMF基因的表達易受肌肉細胞的干擾。因此,本研究利用單細胞RNA測序技術,檢測兩個不同發(fā)育階段的胸肌組織,分析其異質(zhì)性和細胞組成,篩選和鑒定IMF特異性表達基因,開發(fā)相關分子標記,為雞肉品質(zhì)分子機制的研究奠定基礎。試驗一雞不同發(fā)育階段胸肌細胞亞群及IMF特異基因鑒別。以生長早期5日齡（D5）和生長快速期100日齡（D100）的京星黃雞IMF上選系為素材,分別提取胸肌組織原代肌細胞和IMF細胞,進行10×Genomics單細胞RNA測序。測序結(jié)果基于基因表達相似性進行分群,鑒定到D5胸肌組織共有10個細胞亞群,D100共有7個細胞亞群。D5胸肌組織中,亞群0、1、3、5、6為成肌細胞群;2和8兩個亞群為脂肪細胞亞群,亞群4為紅細胞群。而在D100組織中,僅鑒定到一個肌細胞群（cluster3）和一個脂肪細胞群（cluster4）。除此外D100中亞群0為紅細胞群,亞群2為內(nèi)皮細胞群,... 

【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學院北京市

【文章頁數(shù)】：81 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

豬骨骼肌肌纖維發(fā)育Fig.1-2Fiberdevelopmentinporcineskeletalmuscle

?∠宋?歡???纖維細胞系發(fā)育為肌肉中的基質(zhì)血管部分，包括脂肪細胞，成纖維細胞和未分化的脂肪-纖維祖細胞（TAGAetal.,2012）。肌內(nèi)脂肪細胞的發(fā)育也同樣經(jīng)歷細胞發(fā)育的增生期和肥大期兩個階段，在胚胎發(fā)育期間，肌內(nèi)脂肪組織的發(fā)育主要通過細胞數(shù)量的增加，到了胚胎后期和出生后生長發(fā)育階段，主要通過肌內(nèi)脂肪細胞體積的增大來實現(xiàn)。對于家禽來說，肌內(nèi)脂肪組織的發(fā)育在胚胎期到出生后4~5周齡期間處于細胞增生期，在5~6周齡期間既有細胞數(shù)量的增加又有細胞體積的增大，當?shù)搅?周齡時肌內(nèi)脂肪細胞則完全進入細胞肥大期（圖1-3）（LEENSTRA,1986;MOUROTandHERMIER,2001）。從胚胎期到生長早期雞肉中肌內(nèi)脂肪的沉積從胚胎期17胚齡開始急劇增多，到出生后1日齡達到峰值，1日齡到14日齡肌內(nèi)脂肪沉積又急劇下降（王紅楊,2015）。圖1-3雞脂肪細胞發(fā)育階段Fig.1-3Developmentstagesofadipocytesinchicken

序方法被開發(fā)出來，他們的共同點都是將帶有條形碼的微珠和單細胞在微流體裝置中包裹在液滴中，然后在單個細胞內(nèi)進行反轉(zhuǎn)錄，條形碼連接在cDNA上。不同的是Drop-seq測序每次運行處理的細胞要數(shù)倍于inDROP測序，但inDROP的捕獲效率要比Drop-seq的捕獲效率高（MACOSKOetal.,2015）。到了2017年，10×Genomics單細胞測序技術面世，將帶有條形碼和引物的凝膠珠與單個細胞包裹在油滴中，油滴內(nèi)10×Barcode與cDNA產(chǎn)物連接在一起后，打碎油滴以cDNA為模板進行擴增，然后進行文庫構(gòu)建和測序，即可一次性獲得大量單細胞的基因表達情況（圖1-4）。圖1-4單細胞測序技術的發(fā)展歷程Fig.1-4Developmentofsinglecellsequencingtechnologies1.4.2單細胞測序技術的應用單細胞測序技術在生殖，免疫，干細胞分化，腫瘤發(fā)生發(fā)展等領域發(fā)揮重要作用。Zheng等將六名肝細胞癌患者的外周血、腫瘤和鄰近的正常組織中分離出的5,063個T細胞進行深度的單細胞RNA測序。根據(jù)這些單細胞的轉(zhuǎn)錄概況，再加上組裝的T細胞受體（Tcellreceptor，TCR）序列，將其分為11個T細胞亞群，并描繪它們的發(fā)育軌跡（ZHENGetal.,2017a）。Azizi等利用單細胞RNA測序技術對來自8名未接受過治療的乳腺癌患者的腫瘤和相匹配的正常乳腺組織、

【參考文獻】：
期刊論文
[1]不同飼喂方式豬肌內(nèi)脂肪組成及含量分析[J]. 黃甜,嚴成,黃業(yè)傳,鐘雨婷.  湖北農(nóng)業(yè)科學. 2014(22)
[2]雞肉蛋白質(zhì)組成與熱性質(zhì)研究[J]. 趙永紅,白騰輝,馬漢軍.  食品工業(yè). 2014(11)
[3]不同部位榮昌豬肉中脂肪含量和脂肪酸組成對比[J]. 黃業(yè)傳,李洪軍,吳照民,李鳳.  食品科學. 2011(22)
[4]閩中麻雞肌纖維生長發(fā)育規(guī)律的研究[J]. 王立克,李如蘭,程云.  安徽科技學院學報. 2007(01)
[5]大理石花紋、生理成熟度對牛肉品質(zhì)的影響[J]. 湯曉艷,周光宏,徐幸蓮.  食品科學. 2006(12)

碩士論文
[1]胚胎期至生長早期雞肌肉發(fā)育及肌內(nèi)脂肪沉積蛋白質(zhì)組研究[D]. 王紅楊.中國農(nóng)業(yè)科學院 2015
[2]雞肉蛋白發(fā)酵產(chǎn)物的營養(yǎng)與功能評價[D]. 張燕.貴州大學 2009
[3]雞肉湯香味成分鑒定及日齡、性別和酮體部位對雞肉風味的影響[D]. 袁華根.南京農(nóng)業(yè)大學 2007



本文編號：3101711