口蹄疫病毒（Foot-and-mouth disease virus,FMDV）是一種單股正鏈小RNA病毒,是造成偶蹄類動物感染口蹄疫的致病因子,具有傳染性強(qiáng)、傳播速度迅速、傳播方式多樣等特點。動物急性感染FMDV后會出現(xiàn)發(fā)燒、皮膚潰爛等癥狀,而急性感染期病毒清除失敗還會形成持續(xù)性感染,對畜牧業(yè)造成巨大的打擊。目前對FMDV急性感染和持續(xù)性感染過程中宿主細(xì)胞功能的研究十分有限,對它們更深入的研究可以幫助我們理解FMDV的感染過程,為今后預(yù)防和治療口蹄疫提供新的方向。本研究利用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),分析了FMDV急性感染和持續(xù)性感染后BHK-21細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄本,發(fā)現(xiàn)FMDV急性感染后細(xì)胞有1162個基因的表達(dá)發(fā)生了顯著性差異,這些差異表達(dá)基因（DEGs）顯著富集在細(xì)胞組分、細(xì)胞代謝、細(xì)胞周期、tRNA氨酰化、MAPK信號通路、TNF信號通路、TGF-β信號通路、核糖體等細(xì)胞功能和細(xì)胞信號通路中。除此之外,FMDV急性感染后還有1195個選擇性剪切（AS）事件發(fā)生了改變,這些AS事件和基因表達(dá)的改變預(yù)示著病毒感染后宿主細(xì)胞的許多細(xì)胞應(yīng)答發(fā)生了改變。隨后,我們分析比較了急性感染和持續(xù)性感染BHK-2... 

【文章來源】：武漢大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

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【學(xué)位級別】：博士

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FMDV的生活周期(Howes,2018)

口蹄疫病毒急性感染和持續(xù)性感染 BHK-21 細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組分析環(huán)境的變化(Widmann et al., 1999)。如圖 1-3 所示，MAPK 信號通路由三種按順序激活的激酶組成，分別是 MAPK 激酶激酶（MAP kinase kinase kinase，MAPKKK）、MAPK 激酶（MAP kinase kinase，MAPKK）和 MAPK，這三種激酶通過磷酸化的方式調(diào)節(jié)底物蛋白質(zhì)的活性，將上游信號傳遞至下游應(yīng)答因子。MAPKKK 在受到外界刺激后會與 Ras/Rho 家族的小 GTP 結(jié)合蛋白相互作用，通過磷酸化的方式被激活。隨后，MAPKKK 會激活下游的 MAPKK 使其發(fā)生磷酸化，活化的 MAPKK通過對蘇氨酸、酪氨酸的雙重磷酸化激活 MAPK，最終將信號傳遞到細(xì)胞內(nèi)(Rayand Sturgill, 1988)。

圖 1-4. 常規(guī) MAPK 和非典型 MAPK 整體結(jié)構(gòu)示意圖(Cargnello and Roux, 2011)1.4.2 MAPK/ERK 信號通路ERK1/2 是第一個被鑒定出來的哺乳動物 MAPK，它的表達(dá)具有組織特異性，主要在腦，骨骼肌，胸腺和心臟組織中表達(dá)(Boulton et al., 1990)。MAPK/ERK 信號通路由受體酪氨酸激酶（RTK）激活，也遵循 MAPK 的三級酶促級聯(lián)反應(yīng)，依次激活 Raf、MEK1/2 和 ERK1/2。細(xì)胞外配體與受體結(jié)合后會使受體發(fā)生二聚化從而激活受體，并使其位于細(xì)胞內(nèi)的酪氨酸殘基發(fā)生磷酸化，這些磷酸化殘基作為蛋白質(zhì)的特異性結(jié)合位點，含有 SH2 或磷酸酪氨酸結(jié)合（PTB）結(jié)構(gòu)域(Cargnelloand Roux, 2011)。許多受體通過活化原癌基因 Ras 激活 ERK1/2 信號通路，Ras 的激活發(fā)生在細(xì)胞質(zhì)膜上，受鳥嘌呤核苷酸交換因子 SOS 的調(diào)控。通過與 Glub2 相互作用，SOS 從細(xì)胞質(zhì)被募集到細(xì)胞質(zhì)膜上，并刺激結(jié)合在 Ras 上的 GDP 變?yōu)镚TP，從而允許 Ras 與效應(yīng)物相互作用。ERK1/2 信號通路的起始激酶 Raf 是 Ras


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