青海部分地區(qū)牦牛源細粒棘球蚴mtDNA基因多態(tài)性分析
發(fā)布時間:2021-03-21 23:34
細粒棘球絳蟲有廣泛的宿主適應(yīng)性,在青海地區(qū)存在藏羊、牦牛、駱駝、鹿、馬、豬和人等易感中間宿主。細粒棘球絳蟲在長期的進化演變過程中,由于要與不同的宿主產(chǎn)生最佳的寄生關(guān)系,在不同動物體內(nèi)就有可能產(chǎn)生特異的變異。牦牛作為青藏高原上特有的物種,常年生活在高海拔,低氧、寒冷的環(huán)境中,其作為細粒棘球蚴在青藏高原上的特有宿主,是否會產(chǎn)生細粒棘球蚴特有的地方株或基因型,目前很少有人研究。為了探討青海省祁連縣、剛察縣、興?h、海晏縣、貴南縣、澤庫縣、達日縣和玉樹縣牦牛源細粒棘球蚴株系間基因序列差異,確定其基因型、地理分布及優(yōu)勢蟲株,有效地預(yù)防牦牛包蟲病的發(fā)生。本研究選擇線粒體DNA的COI基因和NDI基因,應(yīng)用特異性引物,PCR擴增,測序,通過分子生物學(xué)軟件,分析了不同地區(qū)牦牛源細粒棘球蚴基因序列的差異,并構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果顯示,所測定的G1型細粒棘球蚴COI基因序列和NDI基因序列長度分別為324bp和428bp,G6型細粒棘球蚴COI基因序列和NDI基因序列長度分別為380bp和462bp。在上述各縣的牦牛體內(nèi)均發(fā)現(xiàn)G1型細粒棘球蚴,僅僅在祁連縣的1頭牦牛體內(nèi)發(fā)現(xiàn)有G6型的感染。青海地區(qū)牦牛源細...
【文章來源】:青海大學(xué)青海省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
目錄
第一章 文獻綜述
1 細粒棘球絳蟲的病原學(xué)特征
2 細粒棘球絳蟲的分類方法
2.1 形態(tài)學(xué)分類
2.2 分子生物學(xué)分類
2.2.1 基因型分析與細粒棘球絳蟲的種類
2.2.2 分子標記與細粒棘球絳蟲的分類
3 細粒棘球蚴病免疫學(xué)研究進展
3.1 細粒棘球蚴的主要抗原
3.2 宿主對細粒棘球蚴免疫的特性
3.2.1 非特異性免疫反應(yīng)
3.2.2 特異性免疫反應(yīng)
3.3 細粒棘球蚴的免疫逃避
4 細粒棘球蚴病疫苗
4.1 天然蛋白疫苗
4.2 重組蛋白疫苗
4.3 核酸疫苗
4.4 多肽疫苗
5 感染動物的臨床癥狀和病理變化
6 青海省動物棘球蚴病流行概況
6.1 家畜棘球蚴病感染狀況
6.2 野生動物棘球蚴病感染狀況
7 研究的意義和目的
第二章 細粒棘球蚴mtDNA COI基因和NDI基因多態(tài)性分析
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 樣本來源
1.1.2 儀器
1.1.3 主要試劑和酶
1.2 方法
1.2.1 樣品總DNA的提取
1.2.2 引物設(shè)計和合成
1.2.3 目的片段PCR擴增
1.3 數(shù)據(jù)的處理
1.3.1 數(shù)據(jù)的前期處理
1.3.2 遺傳距離的計算和系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
1.3.3 統(tǒng)計分析
2 結(jié)果
2.1 COI基因和NDI基因PCR擴增產(chǎn)物
2.2 牦牛源細粒棘球蚴COI基因序列分析
2.2.1 測序結(jié)果與其他棘球?qū)俳{蟲COI基因的同源性比較
2.2.2 牦牛源細粒棘球蚴COI基因系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建
2.3 所測G1型細粒棘球蚴COI基因序列的相似性
2.4 不同地區(qū)牦牛源G1型細粒棘球蚴COI基因同源性和多態(tài)性分析
2.5 所測牦牛源G6型細粒棘球蚴COI基因序列分析
2.6 牦牛源細粒棘球蚴分離株COI基因序列與GenBank/BLAST比對
2.7 牦牛源細粒棘球蚴NDI基因序列分析
2.7.1 測序結(jié)果與其他棘球?qū)俳{蟲NDI基因的同源性比較
2.7.2 牦牛源細粒棘球蚴NDI基因系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建
2.8 所測G1型細粒棘球蚴NDI基因序列的相似性
2.9 不同地區(qū)牦牛源細粒棘球蚴NDI基因同源性和多態(tài)性分析
2.10 所測牦牛源G6型細粒棘球蚴NDI基因序列分析
2.11 牦牛源細粒棘球蚴分離株NDI基因序列與GenBank/BLAST比對
3 討論
第三章 結(jié)論
參考文獻
致謝
作者簡歷
【參考文獻】:
期刊論文
[1]我國棘球絳蟲及棘球蚴病研究進展[J]. 林宇光,盧明科,洪凌仙. 中國人獸共患病學(xué)報. 2012(06)
[2]科學(xué)防控包蟲病[J]. 李明,馬世春,魏巍,楊林,蘇增華,池麗娟. 獸醫(yī)導(dǎo)刊. 2011(06)
[3]我國包蟲病的防治現(xiàn)狀[J]. 賈萬忠. 獸醫(yī)導(dǎo)刊. 2011(06)
[4]祁連縣藏羊棘球蚴病感染情況調(diào)查及綜合防治[J]. 馬壽錄. 青海畜牧獸醫(yī)雜志. 2011(02)
[5]棘球絳蟲分類學(xué)研究進展[J]. 朵紅. 上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2011(01)
[6]帶科絳蟲線粒體基因組全序列研究進展[J]. 賈萬忠,閆鴻斌,郭愛疆,史萬貴,詹芳,付寶權(quán). 中國人獸共患病學(xué)報. 2010(06)
[7]久治縣白玉鄉(xiāng)牦牛棘球蚴感染情況調(diào)查[J]. 胡青攀,昂青卓瑪. 青海農(nóng)牧業(yè). 2009(01)
[8]棘球蚴病防治研究的國際現(xiàn)狀和對我們的啟示[J]. 余森海. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2008(04)
[9]犬和藏羊棘球蚴病的感染調(diào)查及流行概況[J]. 郭志宏. 青海畜牧獸醫(yī)雜志. 2008(04)
[10]青南地區(qū)高原動物兩型包蟲病感染調(diào)查[J]. 程海萍,劉小蓉. 高原醫(yī)學(xué)雜志. 2008(02)
本文編號:3093698
【文章來源】:青海大學(xué)青海省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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Abstract
目錄
第一章 文獻綜述
1 細粒棘球絳蟲的病原學(xué)特征
2 細粒棘球絳蟲的分類方法
2.1 形態(tài)學(xué)分類
2.2 分子生物學(xué)分類
2.2.1 基因型分析與細粒棘球絳蟲的種類
2.2.2 分子標記與細粒棘球絳蟲的分類
3 細粒棘球蚴病免疫學(xué)研究進展
3.1 細粒棘球蚴的主要抗原
3.2 宿主對細粒棘球蚴免疫的特性
3.2.1 非特異性免疫反應(yīng)
3.2.2 特異性免疫反應(yīng)
3.3 細粒棘球蚴的免疫逃避
4 細粒棘球蚴病疫苗
4.1 天然蛋白疫苗
4.2 重組蛋白疫苗
4.3 核酸疫苗
4.4 多肽疫苗
5 感染動物的臨床癥狀和病理變化
6 青海省動物棘球蚴病流行概況
6.1 家畜棘球蚴病感染狀況
6.2 野生動物棘球蚴病感染狀況
7 研究的意義和目的
第二章 細粒棘球蚴mtDNA COI基因和NDI基因多態(tài)性分析
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 樣本來源
1.1.2 儀器
1.1.3 主要試劑和酶
1.2 方法
1.2.1 樣品總DNA的提取
1.2.2 引物設(shè)計和合成
1.2.3 目的片段PCR擴增
1.3 數(shù)據(jù)的處理
1.3.1 數(shù)據(jù)的前期處理
1.3.2 遺傳距離的計算和系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
1.3.3 統(tǒng)計分析
2 結(jié)果
2.1 COI基因和NDI基因PCR擴增產(chǎn)物
2.2 牦牛源細粒棘球蚴COI基因序列分析
2.2.1 測序結(jié)果與其他棘球?qū)俳{蟲COI基因的同源性比較
2.2.2 牦牛源細粒棘球蚴COI基因系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建
2.3 所測G1型細粒棘球蚴COI基因序列的相似性
2.4 不同地區(qū)牦牛源G1型細粒棘球蚴COI基因同源性和多態(tài)性分析
2.5 所測牦牛源G6型細粒棘球蚴COI基因序列分析
2.6 牦牛源細粒棘球蚴分離株COI基因序列與GenBank/BLAST比對
2.7 牦牛源細粒棘球蚴NDI基因序列分析
2.7.1 測序結(jié)果與其他棘球?qū)俳{蟲NDI基因的同源性比較
2.7.2 牦牛源細粒棘球蚴NDI基因系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建
2.8 所測G1型細粒棘球蚴NDI基因序列的相似性
2.9 不同地區(qū)牦牛源細粒棘球蚴NDI基因同源性和多態(tài)性分析
2.10 所測牦牛源G6型細粒棘球蚴NDI基因序列分析
2.11 牦牛源細粒棘球蚴分離株NDI基因序列與GenBank/BLAST比對
3 討論
第三章 結(jié)論
參考文獻
致謝
作者簡歷
【參考文獻】:
期刊論文
[1]我國棘球絳蟲及棘球蚴病研究進展[J]. 林宇光,盧明科,洪凌仙. 中國人獸共患病學(xué)報. 2012(06)
[2]科學(xué)防控包蟲病[J]. 李明,馬世春,魏巍,楊林,蘇增華,池麗娟. 獸醫(yī)導(dǎo)刊. 2011(06)
[3]我國包蟲病的防治現(xiàn)狀[J]. 賈萬忠. 獸醫(yī)導(dǎo)刊. 2011(06)
[4]祁連縣藏羊棘球蚴病感染情況調(diào)查及綜合防治[J]. 馬壽錄. 青海畜牧獸醫(yī)雜志. 2011(02)
[5]棘球絳蟲分類學(xué)研究進展[J]. 朵紅. 上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2011(01)
[6]帶科絳蟲線粒體基因組全序列研究進展[J]. 賈萬忠,閆鴻斌,郭愛疆,史萬貴,詹芳,付寶權(quán). 中國人獸共患病學(xué)報. 2010(06)
[7]久治縣白玉鄉(xiāng)牦牛棘球蚴感染情況調(diào)查[J]. 胡青攀,昂青卓瑪. 青海農(nóng)牧業(yè). 2009(01)
[8]棘球蚴病防治研究的國際現(xiàn)狀和對我們的啟示[J]. 余森海. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2008(04)
[9]犬和藏羊棘球蚴病的感染調(diào)查及流行概況[J]. 郭志宏. 青海畜牧獸醫(yī)雜志. 2008(04)
[10]青南地區(qū)高原動物兩型包蟲病感染調(diào)查[J]. 程海萍,劉小蓉. 高原醫(yī)學(xué)雜志. 2008(02)
本文編號:3093698
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