為了克隆和分析牦牛氣管抗菌肽（yTAP）基因的編碼區(qū)序列（CDS）,并分析其序列特征和檢測(cè)其mRNA的組織表達(dá)規(guī)律,試驗(yàn)采集2.5歲的健康公牦牛（n=6）和母牦牛（n=6）的氣管、肝臟、脾臟、腎臟、肺臟、結(jié)腸和性腺共7種組織樣品,反轉(zhuǎn)錄（RT）-PCR法克隆了氣管組織yTAP基因編碼區(qū)序列,對(duì)其進(jìn)行序列生物信息學(xué)分析,并利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR法檢測(cè)yTAP基因mRNA的組織表達(dá)規(guī)律。結(jié)果表明:克隆得到的yTAP基因編碼區(qū)序列全長(zhǎng)為195 bp,編碼含有64個(gè)氨基酸殘基的TAP前體肽,第27～64位的氨基酸構(gòu)成了yTAP成熟肽序列。yTAP成熟肽含有6個(gè)半胱氨酸和3個(gè)脯氨酸,形成3對(duì)二硫鍵,二級(jí)結(jié)構(gòu)由α螺旋、延伸鏈和無(wú)規(guī)則卷曲三種結(jié)構(gòu)組成;SWISS-MODEL預(yù)測(cè)三級(jí)結(jié)構(gòu)結(jié)果表明,yTAP成熟肽三級(jí)結(jié)構(gòu)主要是延伸鏈和無(wú)規(guī)則卷曲,并且在C-端存在一段螺旋結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)穩(wěn)定性較好,具有兩親性,屬于β防御素家族成員。yTAP基因在牦牛氣管組織中表達(dá)水平最高。說(shuō)明本試驗(yàn)成功克隆獲得了yTAP基因的編碼區(qū)序列,且mRNA主要在氣管組織中表達(dá)。 

【文章來(lái)源】：黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(10)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：8 頁(yè)

【圖文】：

yT AP成熟肽蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果

yTAP基因PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果見(jiàn)圖1,yTAP基因編碼區(qū)序列的ORF finder分析結(jié)果見(jiàn)圖2。圖2 yTAP基因編碼區(qū)序列的ORF finder分析結(jié)果

yTAP基因編碼區(qū)序列的ORF finder分析結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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