蘭坪烏骨綿羊PDGFRL基因編碼區(qū)序列擴(kuò)增及其生物信息學(xué)分析
發(fā)布時間:2021-03-17 12:58
本研究根據(jù)Genbank載入的普通綿羊血小板衍生生長因子受體樣蛋白(PDGFRL)基因序列設(shè)計特異性引物。利用PCR技術(shù)擴(kuò)增烏骨綿羊PDGFRL基因編碼區(qū)片段,經(jīng)測序后對序列進(jìn)行比對分析,并采用生物信息學(xué)軟件對編碼區(qū)序列和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測。結(jié)果表明:蘭坪烏骨綿羊PDGFRL基因編碼區(qū)序列全長1128bp,編碼375個氨基酸;同普通綿羊進(jìn)行核苷酸序列同源性比對發(fā)現(xiàn)同源性為99.73%,發(fā)現(xiàn)3個堿基同義突變;生物信息學(xué)分析表明不同物種PDGFRL基因編碼區(qū)核苷酸序列與氨基酸序列具有較高的保守性;蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測顯示,PDGFRL蛋白空間結(jié)構(gòu)主要由α螺旋、β折疊和無規(guī)則卷曲構(gòu)成。
【文章來源】:中國畜牧雜志. 2020,56(10)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
烏骨綿羊PDGFRL基因外顯子擴(kuò)增電泳圖
烏骨綿羊PDGFRL蛋白的氨基酸組成
PDGFRL基因擴(kuò)增產(chǎn)物3個變異位點基因型堿基序列
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鮻魚幼魚肝臟和肌肉氧化應(yīng)激指標(biāo)對溶解氧含量變動的響應(yīng)[J]. 劉旭佳,黃國強(qiáng),李潔,唐夏. 水產(chǎn)科學(xué). 2014(06)
[2]蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測的多核學(xué)習(xí)方法[J]. 連云涓,熊惠霖. 計算機(jī)應(yīng)用. 2013(S1)
[3]血小板源性生長因子受體樣蛋白對結(jié)腸癌CT-26細(xì)胞增殖和遷移的影響[J]. 劉桂君,賈硯寒,王柯,王一,黎燕,陳國江,石艷春. 國際藥學(xué)研究雜志. 2013(02)
[4]Expression and functional characterization of platelet-derived growth factor receptor-like gene[J]. Feng-Jie Guo,Wei-Jia Zhang,Ya-Lin Li,Yan Liu,Yue-Hui Li,Jian Huang,Jia-Jia Wang,Ping-Li Xie,Guan-Cheng Li,Cancer Research Institute,Xiangya Medical School,Central South University,Changsha 410078,Hunan Province,China. World Journal of Gastroenterology. 2010(12)
[5]TYRP1基因控制動物色素形成的研究進(jìn)展[J]. 崔嘉,孫守榮,苗魯旭,席冬梅,何奕多,毛華明,鄧衛(wèi)東. 中國畜牧獸醫(yī). 2009(09)
[6]烏骨綿羊和非烏骨綿羊血液生理生化指標(biāo)的比較研究[J]. 鄧衛(wèi)東,毛華明,孫守榮,席冬梅,楊舒黎. 中國畜牧雜志. 2006(17)
[7]云南地區(qū)烏骨綿羊黑色素的初步研究[J]. 楊舒黎,舒文,毛華明,鄧衛(wèi)東. 畜牧與獸醫(yī). 2006(03)
[8]云南烏骨綿羊的發(fā)現(xiàn)及其特征性狀的研究[J]. 毛華明,鄧衛(wèi)東,孫守榮,舒文,楊舒黎. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2005(01)
[9]烏骨雞黑色素對延緩果蠅衰老的作用[J]. 徐幸蓮,莊蘇,陳伯祥. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 1999(02)
[10]烏雞黑素的特性及功能研究[J]. 袁纓. 沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 1996(02)
碩士論文
[1]雞POSTN和PDGFRL基因在卵泡中的表達(dá)及其與產(chǎn)蛋性狀關(guān)聯(lián)分析[D]. 景洋.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
本文編號:3087180
【文章來源】:中國畜牧雜志. 2020,56(10)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
烏骨綿羊PDGFRL基因外顯子擴(kuò)增電泳圖
烏骨綿羊PDGFRL蛋白的氨基酸組成
PDGFRL基因擴(kuò)增產(chǎn)物3個變異位點基因型堿基序列
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鮻魚幼魚肝臟和肌肉氧化應(yīng)激指標(biāo)對溶解氧含量變動的響應(yīng)[J]. 劉旭佳,黃國強(qiáng),李潔,唐夏. 水產(chǎn)科學(xué). 2014(06)
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[3]血小板源性生長因子受體樣蛋白對結(jié)腸癌CT-26細(xì)胞增殖和遷移的影響[J]. 劉桂君,賈硯寒,王柯,王一,黎燕,陳國江,石艷春. 國際藥學(xué)研究雜志. 2013(02)
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[5]TYRP1基因控制動物色素形成的研究進(jìn)展[J]. 崔嘉,孫守榮,苗魯旭,席冬梅,何奕多,毛華明,鄧衛(wèi)東. 中國畜牧獸醫(yī). 2009(09)
[6]烏骨綿羊和非烏骨綿羊血液生理生化指標(biāo)的比較研究[J]. 鄧衛(wèi)東,毛華明,孫守榮,席冬梅,楊舒黎. 中國畜牧雜志. 2006(17)
[7]云南地區(qū)烏骨綿羊黑色素的初步研究[J]. 楊舒黎,舒文,毛華明,鄧衛(wèi)東. 畜牧與獸醫(yī). 2006(03)
[8]云南烏骨綿羊的發(fā)現(xiàn)及其特征性狀的研究[J]. 毛華明,鄧衛(wèi)東,孫守榮,舒文,楊舒黎. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2005(01)
[9]烏骨雞黑色素對延緩果蠅衰老的作用[J]. 徐幸蓮,莊蘇,陳伯祥. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 1999(02)
[10]烏雞黑素的特性及功能研究[J]. 袁纓. 沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 1996(02)
碩士論文
[1]雞POSTN和PDGFRL基因在卵泡中的表達(dá)及其與產(chǎn)蛋性狀關(guān)聯(lián)分析[D]. 景洋.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
本文編號:3087180
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