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蘭坪烏骨綿羊PDGFRL基因編碼區(qū)序列擴(kuò)增及其生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2021-03-17 12:58
  本研究根據(jù)Genbank載入的普通綿羊血小板衍生生長因子受體樣蛋白(PDGFRL)基因序列設(shè)計特異性引物。利用PCR技術(shù)擴(kuò)增烏骨綿羊PDGFRL基因編碼區(qū)片段,經(jīng)測序后對序列進(jìn)行比對分析,并采用生物信息學(xué)軟件對編碼區(qū)序列和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測。結(jié)果表明:蘭坪烏骨綿羊PDGFRL基因編碼區(qū)序列全長1128bp,編碼375個氨基酸;同普通綿羊進(jìn)行核苷酸序列同源性比對發(fā)現(xiàn)同源性為99.73%,發(fā)現(xiàn)3個堿基同義突變;生物信息學(xué)分析表明不同物種PDGFRL基因編碼區(qū)核苷酸序列與氨基酸序列具有較高的保守性;蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測顯示,PDGFRL蛋白空間結(jié)構(gòu)主要由α螺旋、β折疊和無規(guī)則卷曲構(gòu)成。 

【文章來源】:中國畜牧雜志. 2020,56(10)北大核心

【文章頁數(shù)】:6 頁

【部分圖文】:

蘭坪烏骨綿羊PDGFRL基因編碼區(qū)序列擴(kuò)增及其生物信息學(xué)分析


烏骨綿羊PDGFRL基因外顯子擴(kuò)增電泳圖

蘭坪烏骨綿羊PDGFRL基因編碼區(qū)序列擴(kuò)增及其生物信息學(xué)分析


烏骨綿羊PDGFRL蛋白的氨基酸組成

蘭坪烏骨綿羊PDGFRL基因編碼區(qū)序列擴(kuò)增及其生物信息學(xué)分析


PDGFRL基因擴(kuò)增產(chǎn)物3個變異位點基因型堿基序列

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[2]蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測的多核學(xué)習(xí)方法[J]. 連云涓,熊惠霖.  計算機(jī)應(yīng)用. 2013(S1)
[3]血小板源性生長因子受體樣蛋白對結(jié)腸癌CT-26細(xì)胞增殖和遷移的影響[J]. 劉桂君,賈硯寒,王柯,王一,黎燕,陳國江,石艷春.  國際藥學(xué)研究雜志. 2013(02)
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[8]云南烏骨綿羊的發(fā)現(xiàn)及其特征性狀的研究[J]. 毛華明,鄧衛(wèi)東,孫守榮,舒文,楊舒黎.  云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2005(01)
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[10]烏雞黑素的特性及功能研究[J]. 袁纓.  沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 1996(02)

碩士論文
[1]雞POSTN和PDGFRL基因在卵泡中的表達(dá)及其與產(chǎn)蛋性狀關(guān)聯(lián)分析[D]. 景洋.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016



本文編號:3087180

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