公豬繁殖性狀是養(yǎng)豬生產(chǎn)中的重要經(jīng)濟性狀，但該性狀遺傳力低，通過常規(guī)育種難以獲得好的改良效果，開展對公豬繁殖性狀分子遺傳機理的研究，不僅可為種公豬的選育和改良提供新型分子育種技術，還將為人類的男性繁殖疾病的研究提供有價值的參考。本實驗以205頭白色杜洛克×二花臉資源家系F2公豬群體為研究對象，選擇附睪重、血漿睪酮濃度、精液品質(zhì)等繁殖性狀為研究內(nèi)容。在前期7號染色體上初步定位的影響附睪重的QTL置信區(qū)間增加14個SNPs位點，應用實時定量Taqman PCR技術或直接測序?qū)?05頭F2公豬及其父本和母本進行基因型判定后精細定位該QTL，其置信區(qū)間由原來的24.5cM（48.5～73cM）縮小至15cM（57～72cM），F(xiàn)值由原來的23.76上升至45.24；另一個影響血漿睪酮濃度的QTL置信區(qū)間由原來的70.5cM（4.5～75cM）縮小至33cM（40～73cM），F(xiàn)值由原來的10.68上升至14.87。通過基因型填補（Genotype Imputation）獲得該205頭F2公豬個體的60K SNP基因型， GWAS分析后在7號染色體發(fā)現(xiàn)28個與附睪重、精子密度、總精子數(shù)等公豬繁殖性... 

【文章來源】：江西農(nóng)業(yè)大學江西省

【文章頁數(shù)】：45 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
    1 公豬繁殖性狀在養(yǎng)豬生產(chǎn)中的重要經(jīng)濟意義
    2 公豬繁殖性狀的 QTL 定位結(jié)果
        2.1 7 號染色體上公豬繁殖性狀的 QTL 定位結(jié)果
        2.2 其它染色體上公豬繁殖性狀的 QTL 定位結(jié)果
    3 公豬繁殖性狀候選基因的研究狀況
        3.1 7 號染色體公豬繁殖性狀候選基因研究進展
        3.2 其它染色體公豬繁殖性狀候選基因研究進展
    4 基因型填補（Genotype Imputation）
        4.1 基因型填補的原理
        4.2 常用的算法和軟件
    5 基因型填補 GWAS 在哺乳動物中的研究狀況
    6 MEA1、TEP1 基因在哺乳動物中的研究進展
    7 本研究的目的和意義
第二章 研究正文
    1 引言
    2 實驗材料與方法
        2.1 實驗動物及 DNA 樣品制備
        2.2 主要試劑和實驗設備
            2.2.1 主要試劑
            2.2.2 實驗設備
        2.3 公豬繁殖性狀 QTL 精細定位
            2.3.1 新增 SNP 標記的選擇
            2.3.2 SNPs 位點的基因型判定
            2.3.3 精細定位統(tǒng)計方法
        2.4 公豬繁殖性狀基因型填補 GWAS 統(tǒng)計分析
        2.5 位置候選基因的鑒別研究
            2.5.1 位置候選基因的篩選
            2.5.2 MEA1 基因多態(tài)位點與公豬繁殖性狀的關聯(lián)性分析
            2.5.3 TEP1 基因多態(tài)位點與公豬繁殖性狀的關聯(lián)性分析
            2.5.4 MEA1、TEP1 基因在附睪及不同組織中的表達
    3 實驗結(jié)果
        3.1 7 號染色體影響公豬繁殖性狀的 QTL 精細定位
        3.2 7 號染色體影響公豬繁殖性狀的基因型填補 GWAS 分析結(jié)果
        3.3 7 號染色體影響公豬繁殖性狀的基因型填補 GWAS 驗證結(jié)果
        3.4 位置候選基因多態(tài)位點與公豬繁殖性狀的關聯(lián)性分析和 F-drop 分析結(jié)果
        3.5 位置候選基因的表達分析結(jié)果
            3.5.1 MEA1 基因型與該基因在附睪組織表達量的關聯(lián)性
            3.5.2 TEP1 基因型與該基因在附睪組織表達量的關聯(lián)性
            3.5.3 MEA1、TEP1 基因 QTT 分析結(jié)果
            3.5.4 MEA1、TEP1 基因在不同組織中的表達情況
    4 分析與討論
        4.1 7 號染色體公豬繁殖性狀 QTL 精細定位
        4.2 公豬繁殖性狀基因型填補 GWAS 分析
        4.3 影響公豬繁殖性狀的兩個位置功能候選基因的鑒別研究
    5 小結(jié)
參考文獻
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
[1]全基因組關聯(lián)性研究的基因型填補[J]. 趙楊,戴俊程,柏建嶺,彭志行,于浩,沈洪兵,陳峰.  中國衛(wèi)生統(tǒng)計. 2011(06)
[2]全基因組關聯(lián)研究的深度分析策略[J]. 權晟,張學軍.  遺傳. 2011(02)
[3]基因型填補的原理與方法及其在遺傳流行病學研究中的應用[J]. 莫興波,顧東風.  中華流行病學雜志. 2010 (06)
[4]豬繁殖力主基因和QTL的研究進展[J]. 李鳳娥,熊遠著,鄧昌彥.  國外畜牧學(豬與禽). 2003(04)
[5]精子發(fā)生中的端粒與端粒酶[J]. 王詠梅,王傳發(fā).  中華男科學. 2001(05)
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[8]豬繁殖性狀的遺傳改良方法[J]. 胡錦平.  浙江畜牧獸醫(yī). 1989(03)

博士論文
[1]豬5號染色體耳面積QTL精細定位及其因果基因的初步鑒別[D]. 李平華.江西農(nóng)業(yè)大學 2012

碩士論文
[1]豬六個功能基因變異的分析及其對繁殖性狀的影響[D]. 高建.華中農(nóng)業(yè)大學 2007



本文編號：3082304