長白豬不同個(gè)體ECR1-like拷貝數(shù)變異檢測及基因SNP分析
發(fā)布時(shí)間:2021-03-12 23:45
目的:為探討豬紅細(xì)胞免疫黏附受體(Erythrocyte complement receptor 1-like,ECRl-like)蛋白表型多態(tài)性的分子基礎(chǔ),本實(shí)驗(yàn)對長白豬不同個(gè)體的ECR1-like單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)和拷貝數(shù)變異(Copy number variation,CNV)進(jìn)行研究,以期為研究豬ECR1-like結(jié)構(gòu)多態(tài)性及其影響紅細(xì)胞免疫黏附功能的分子機(jī)理提供理論數(shù)據(jù)。方法:本研究以41頭長白豬為實(shí)驗(yàn)對象,以ECR1-like基因?yàn)榘邢?通過NCBI數(shù)據(jù)庫中的GENE、SNP和BLAST等生物信息學(xué)分析模塊對ECR1-like編碼基因進(jìn)行分析,預(yù)測出ECR1-like基因的外顯子區(qū)域及部分SNP位點(diǎn)。運(yùn)用直接測序法、等位基因特異性PCR技術(shù)(Allele-specific PCR,AS-PCR)對SNP位點(diǎn)進(jìn)行基因分型;利用哈代-溫伯格平衡檢驗(yàn)、連鎖不平衡檢驗(yàn)分析SNP位點(diǎn),并利用Haploview4.3軟件構(gòu)建ECR1-like基因SNP位點(diǎn)的單倍型。用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)、2-△△ct相對定量分析方法...
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?CR1蛋白的SCRl4】??Figure?1.?SCRs?of?CR1?protein??
圖3豬基因組DNA電泳圖??(M:?5000?bp?maker)??
圖4?ECRl-like外顯子PCR擴(kuò)增產(chǎn)物??(M:?600?bp?maker;?1:第?5?外顯子?423?bp?DNA?片段;2:第?12?外顯子?424?bp?DNA?片段;3:第??
本文編號(hào):3079194
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?CR1蛋白的SCRl4】??Figure?1.?SCRs?of?CR1?protein??
圖3豬基因組DNA電泳圖??(M:?5000?bp?maker)??
圖4?ECRl-like外顯子PCR擴(kuò)增產(chǎn)物??(M:?600?bp?maker;?1:第?5?外顯子?423?bp?DNA?片段;2:第?12?外顯子?424?bp?DNA?片段;3:第??
本文編號(hào):3079194
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