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我國(guó)牛病毒性腹瀉病毒E2基因的多態(tài)性分析

發(fā)布時(shí)間:2021-03-12 03:57
  牛病毒性腹瀉病毒(BVDV)是世界上廣泛流行的病毒之一,可以導(dǎo)致世界范圍內(nèi)許多哺乳動(dòng)物的感染。該病毒自1980年在我國(guó)首次發(fā)現(xiàn)以來(lái),已經(jīng)遍布各個(gè)省市和地區(qū),對(duì)我國(guó)畜牧業(yè)造成了較大的影響。該病毒的囊膜蛋白E2是其病毒粒子的主要組成部分,在病毒對(duì)宿主細(xì)胞的吸附、導(dǎo)致針對(duì)病毒感染的免疫應(yīng)答中均起著較為重要的作用。為了獲取更多國(guó)內(nèi)BVDV的流行信息,在本實(shí)驗(yàn)中我們對(duì)田間樣品、細(xì)胞培養(yǎng)物以及商品血清等多份樣品進(jìn)行了RT-PCR檢測(cè),并對(duì)獲得的多個(gè)E2基因(全長(zhǎng)1221bp)進(jìn)行了生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,我們此次的BVDV分離株可分為9個(gè)基因亞型,包括BVDV-1a,-1b,-1c,-1d,-10,-1m,-1p,-1q和BVDV-2a,顯示了我國(guó)BVDV流行的多態(tài)性和異質(zhì)性。同時(shí),我們還使用多種方法證明了E2全長(zhǎng)基因是BVDV系統(tǒng)發(fā)生學(xué)分析的良好目的基因。對(duì)本實(shí)驗(yàn)中獲得的序列進(jìn)行的溯源性分析揭示了中國(guó)BVDV流行株的共同祖先以及各個(gè)病毒亞型的產(chǎn)生分化時(shí)間,對(duì)我國(guó)BVDV的進(jìn)化分析提供了新的思路和研究方向。對(duì)于氨基酸同義/翻譯突變的分析結(jié)果得出,在E2內(nèi)部存在著正向、反向的雙選擇,但基于全長(zhǎng)基因... 

【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁(yè)數(shù)】:84 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

我國(guó)牛病毒性腹瀉病毒E2基因的多態(tài)性分析


牛病毒性腹瀉病毒的基因組結(jié)構(gòu)

分樣,對(duì)部,預(yù)期結(jié)果,質(zhì)粒


圖2.2 BVDV 5’UTR-E2基因的擴(kuò)增Figure 2.2 Amplification of BVDV E2 5'UTR-E2 genesDL15,000 Marker: ISOOObp, lOOOObp 7500bp. 5000bp,2500bp, 1000bp,250bp示為使用5’UTR上游引物和E2R下游引物對(duì)部分樣品進(jìn)行的擴(kuò)增結(jié)果。由圖中可bp的位置上出現(xiàn)較為明顯的條帶(1,6, 7),符合實(shí)驗(yàn)預(yù)期結(jié)果。質(zhì)粒的電泳鑒定

重組質(zhì)粒,分樣,圓圖,對(duì)部


圓圖2.2 BVDV 5’UTR-E2基因的擴(kuò)增Figure 2.2 Amplification of BVDV E2 5'UTR-E2 genesDL15,000 Marker: ISOOObp, lOOOObp 7500bp. 5000bp,2500bp, 1000bp,250bp示為使用5’UTR上游引物和E2R下游引物對(duì)部分樣品進(jìn)行的擴(kuò)增結(jié)果。由圖中可p的位置上出現(xiàn)較為明顯的條帶(1,6, 7),符合實(shí)驗(yàn)預(yù)期結(jié)果。質(zhì)粒的電泳鑒定

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號(hào):3077639

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