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基于RNA-Seq技術(shù)對高黎貢山豬與杜洛克豬背最長肌差異表達基因的篩選

發(fā)布時間:2021-03-03 17:14
  為了篩選出高黎貢山豬與杜洛克豬背最長肌的差異表達基因,為高黎貢山豬的分子選育提供科學(xué)依據(jù),試驗選用胎次相近、70日齡的高黎貢山豬和杜洛克豬各10頭(5♂,5♀),在相同的飼養(yǎng)管理條件下飼養(yǎng)至260日齡,屠宰12頭,其中高黎貢山豬6頭(3♂,3♀)、杜洛克豬6頭(3♂,3♀),利用RNA-Seq技術(shù)對兩個品種豬背最長肌肌肉組織進行測序,先使用edgeR軟件對高黎貢山豬與杜洛克豬背最長肌轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行差異分析,再將差異表達基因進行GO富集分析和KEGG富集分析。結(jié)果表明:高黎貢山豬與杜洛克豬差異表達的基因、顯著富集的通路大部分與脂肪的沉積、代謝和脂肪細胞分化相關(guān)。說明高黎貢山豬與杜洛克豬背最長肌的肌內(nèi)脂肪含量受基因轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控。 

【文章來源】:黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(15)北大核心

【文章頁數(shù)】:6 頁

【部分圖文】:

基于RNA-Seq技術(shù)對高黎貢山豬與杜洛克豬背最長肌差異表達基因的篩選


杜洛克豬較高黎貢山豬背最長肌差異基因火山圖

功能圖,基因,數(shù)據(jù)庫,功能


差異基因GO數(shù)據(jù)庫功能注釋

功能圖,數(shù)據(jù)庫,基因,功能


差異表達基因KEGG數(shù)據(jù)庫功能注釋

【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]不同飼養(yǎng)方式下二郎山山地雞脂肪酸含量及ELOVL2、ELOVL5基因的組織表達研究[D]. 楊琴.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011



本文編號:3061625

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