基于RNA-Seq技術(shù)對高黎貢山豬與杜洛克豬背最長肌差異表達基因的篩選
發(fā)布時間:2021-03-03 17:14
為了篩選出高黎貢山豬與杜洛克豬背最長肌的差異表達基因,為高黎貢山豬的分子選育提供科學(xué)依據(jù),試驗選用胎次相近、70日齡的高黎貢山豬和杜洛克豬各10頭(5♂,5♀),在相同的飼養(yǎng)管理條件下飼養(yǎng)至260日齡,屠宰12頭,其中高黎貢山豬6頭(3♂,3♀)、杜洛克豬6頭(3♂,3♀),利用RNA-Seq技術(shù)對兩個品種豬背最長肌肌肉組織進行測序,先使用edgeR軟件對高黎貢山豬與杜洛克豬背最長肌轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行差異分析,再將差異表達基因進行GO富集分析和KEGG富集分析。結(jié)果表明:高黎貢山豬與杜洛克豬差異表達的基因、顯著富集的通路大部分與脂肪的沉積、代謝和脂肪細胞分化相關(guān)。說明高黎貢山豬與杜洛克豬背最長肌的肌內(nèi)脂肪含量受基因轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控。
【文章來源】:黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(15)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
杜洛克豬較高黎貢山豬背最長肌差異基因火山圖
差異基因GO數(shù)據(jù)庫功能注釋
差異表達基因KEGG數(shù)據(jù)庫功能注釋
【參考文獻】:
期刊論文
[1]轉(zhuǎn)錄組的測序方法及應(yīng)用研究概述[J]. 姚娜,劉秀明,董園園,王南,孟璐璐,李海燕. 北方園藝. 2017(12)
[2]高黎貢山豬品牌規(guī)劃建設(shè)與推廣[J]. 趙桂英,樊月圓,富國文,吳旭東,楊圳超,鄧江. 豬業(yè)科學(xué). 2016(11)
[3]影響豬肉性狀相關(guān)基因的研究進展[J]. 時永強,祝宇,王奇惠,曲偉杰. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(08)
[4]槐豬和杜洛克豬背最長肌差異表達基因的篩選與注釋[J]. 楊建敏,胡宇平,林威敏,張金耀,黃守婷,葉鼎承,肖天放. 福建農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2016(02)
[5]PLIN基因多態(tài)性與開放式生活方式干預(yù)相互作用對成人減肥效果的影響[J]. 呂祎然,劉陽,靳沙沙,黃賢仁,王?,王燕芳,林寶華,常翠青. 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院學(xué)報. 2015(06)
[6]雌激素對奶山羊乳腺上皮細胞脂肪酸合成酶(FASN)基因表達和脂肪酸含量的影響[J]. 曹艷紅,朱江江,史懷平,羅軍. 畜牧與獸醫(yī). 2015(07)
[7]蘭州大尾羊PPARG全長cDNA克隆及生物信息學(xué)分析[J]. 金方園,徐紅偉,達小強,柏家林,馮玉蘭,臧榮鑫,楊具田. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(12)
[8]非模式生物轉(zhuǎn)錄組研究[J]. 劉紅亮,鄭麗明,劉青青,權(quán)富生,張涌. 遺傳. 2013(08)
[9]轉(zhuǎn)錄組與RNA-Seq技術(shù)[J]. 張春蘭,秦孜娟,王桂芝,紀(jì)志賓,王建民. 生物技術(shù)通報. 2012(12)
[10]脂肪酸合酶與脂肪酸代謝及細胞因子的關(guān)系[J]. 盧環(huán)宇,韋夢影,張更,傅海燕. 細胞與分子免疫學(xué)雜志. 2012(11)
博士論文
[1]牛FABP4基因代謝功能研究及品種間脂肪細胞發(fā)育特性分析[D]. 魏勝娟.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
碩士論文
[1]不同飼養(yǎng)方式下二郎山山地雞脂肪酸含量及ELOVL2、ELOVL5基因的組織表達研究[D]. 楊琴.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號:3061625
【文章來源】:黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(15)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
杜洛克豬較高黎貢山豬背最長肌差異基因火山圖
差異基因GO數(shù)據(jù)庫功能注釋
差異表達基因KEGG數(shù)據(jù)庫功能注釋
【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
[1]牛FABP4基因代謝功能研究及品種間脂肪細胞發(fā)育特性分析[D]. 魏勝娟.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
碩士論文
[1]不同飼養(yǎng)方式下二郎山山地雞脂肪酸含量及ELOVL2、ELOVL5基因的組織表達研究[D]. 楊琴.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號:3061625
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