轉(zhuǎn)基因體細(xì)胞克隆綿羊印記基因DNA甲基化研究
發(fā)布時間:2021-03-02 10:07
目前,很多研究表明轉(zhuǎn)基因克隆動物中DNA甲基化表現(xiàn)為多相的。但是,很少有研究證明轉(zhuǎn)基因體細(xì)胞克隆綿羊中的DNA甲基化水平,可能主要是由于缺少轉(zhuǎn)基因體細(xì)胞克隆綿羊的材料,或者綿羊基因組中的印記基因的信息。為了研究轉(zhuǎn)基因體細(xì)胞克隆綿羊重編程的程度,本研究中以印記基因H19, IGF2, IGF2R, DLK1和Gtl2為研究對象,研究其CpG島或者差異甲基化區(qū)域(differentially methylated regions,DMR)在轉(zhuǎn)基因體細(xì)胞克隆綿羊不同組織(心臟、肺臟、肌肉)DNA甲基化程度。首先,制作石蠟切片、HE染色觀察心臟、肺臟、肌肉的形態(tài);然后利用生物信息學(xué)軟件或者在線數(shù)據(jù)庫分析以上5個印記基因,包括基因結(jié)構(gòu)、CpG島預(yù)測、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測、構(gòu)建分子進(jìn)化樹;接著,利用MassArray平臺檢測了5個印記基因在3種不同組織的甲基化水平;最后,根據(jù)獲得的甲基化數(shù)據(jù),進(jìn)行了深度數(shù)據(jù)挖掘分析。通過以上實驗,得到的結(jié)果如下:1.轉(zhuǎn)基因體細(xì)胞克隆綿羊死產(chǎn)綿羊心臟、肺臟、肌肉3種組織經(jīng)病理組織形態(tài)學(xué)觀察沒有明顯異常,總體器官形態(tài)正常。2.五個印記基因中11個CpG島,包括基因上游序列、...
【文章來源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:130 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
印記的生命周期[48]
圖3 Igf2/m9和Igf2r/Airn印記調(diào)控原理Fig.3 Imprinted regulation of Igf2/H 19 and Igf2r/Airn loci1.3.5.2 Igf2r/Airn雖然不是進(jìn)化最古老的,但是在IgGr/Airn簇中ncRNA模式是一個通用機(jī)制,可能也是被描述的最完整的(見圖3b)。另外兩個確定的簇是IC2/Kcnql 簇和 Gnas 簇,可能 PWS/AS 和 DllcI/Dio3 也利用 ncRNA 模式,但是需要更多的研宄工作來確定ncRNA在這些印記基因簇中的作用"“〕。在ncRNA模式中,ICR內(nèi)的啟動子不同程度甲基化調(diào)控著ncRNA的表達(dá):當(dāng)ICR未甲基化,ncRNA表達(dá),順式連鎖基因被抑制,另一面,當(dāng)ICR甲基化,ncRNA被抑制,.順式連鎖基因表達(dá)。在丨gf2r/Airn簇中,ncRNAAim抑制IgfZr無處不在,Slc22a2和Slc22a3在胎盤。雖然這種抑制機(jī)制不清楚,一種假設(shè)認(rèn)為在胎盤中Airn與Slc22a3啟動子、H3K9組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶G9a相互作用導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄表觀遺傳沉默在鼠和人中,Igf2r/Airn簇的調(diào)控機(jī)制有些差異。在鼠中,IgfZr母系
內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文 1J_甲基化。當(dāng)母本中DMR2的DNA甲基化被維持,則不會激活H3K4的甲基化,在父本中也是DMR2,不過這促進(jìn)了 Airn轉(zhuǎn)錄的沉默[^。1.3.5.3 Dlkl-Dio3DLK1-D103簇通過DNA甲基化和核心組蛋白的尾部修飾來調(diào)控親本不同染色體的印記調(diào)控區(qū)域,而大多數(shù)研宄多是針對印記域內(nèi)的DNA甲基化和組蛋白修飾,并且己經(jīng)證明了,印記域ICR的DNA甲基化確實維持正確的基因組印記,而且ICR內(nèi)的microRNA也可能參與印記調(diào)控。(a) (b)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]1例轉(zhuǎn)基因體細(xì)胞克隆牛主要臟器的組織病理學(xué)觀察[J]. 袁蘇婭,姬麗娜,王勇勝,曾曉萍,卿素珠,張涌. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2013(01)
[2]1例轉(zhuǎn)基因克隆牛腦和免疫器官組織形態(tài)觀察報告[J]. 徐金霞,張羽,王勇勝,邊珍,卿素珠,張涌. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2012(06)
[3]克隆豬印跡基因IGF2/H19印跡控制區(qū)的甲基化狀態(tài)[J]. 吳志強(qiáng),謝一妮,張廷宇,戴建軍,吳彩鳳,馬恒東,張德福. 中國畜牧獸醫(yī). 2011(11)
[4]雞DLK1基因的生物信息學(xué)分析[J]. 閆曉紅,王寧. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2011(06)
[5]轉(zhuǎn)基因動物新技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 羅慶苗,苗向陽,張瑞杰. 遺傳. 2011(05)
[6]Non-coding RNAs and the acquisition of genomic imprinting in mammals[J]. ZHANG YiJun & QU LiangHu Key Laboratory of Gene Engineering of the Ministry of Education,State Key Laboratory for Biocontrol,Sun Yan-Sen University,Guangzhou 510275,China. Science in China(Series C:Life Sciences). 2009(03)
[7]一例體細(xì)胞克隆黃牛肺臟的組織結(jié)構(gòu)觀察[J]. 王曉麗,韋精衛(wèi),房慧伶,孟凡麗,辛立江,向長劍,石德順. 中國畜牧獸醫(yī). 2009(02)
[8]內(nèi)蒙古首例體細(xì)胞克隆牛2日齡死亡后的病理學(xué)觀察[J]. 顧玉芳,李善姬,吳素清. 長江大學(xué)學(xué)報(自科版)農(nóng)學(xué)卷. 2007(04)
[9]成年核移植山羊生長相關(guān)基因的表達(dá)分析(英文)[J]. 邢寶松,徐銀學(xué),成勇,劉紅林,杜淼. 遺傳學(xué)報. 2007(08)
[10]山羊卵核移植的研究[J]. 張涌,王建辰,錢菊汾,郝志明. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 1991(05)
博士論文
[1]乳腺特異表達(dá)嗜熱菌糖苷酶轉(zhuǎn)基因牛的研究[D]. 李璐.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]轉(zhuǎn)fat-1基因體細(xì)胞克隆綿羊的研究[D]. 張東.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]克隆豬印跡基因表達(dá)及其甲基化狀態(tài)研究[D]. 魏延昌.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[4]克隆綿羊印記相關(guān)基因的DNA甲基化研究[D]. 趙麗霞.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
碩士論文
[1]克隆豬部分組織病理學(xué)及生理生化指標(biāo)分析[D]. 陳會蘭.上海海洋大學(xué) 2012
[2]牛Gtl2基因的克隆及Dlk1-Gtl2印記區(qū)域在體細(xì)胞核移植牛中的DNA甲基化狀態(tài)分析[D]. 蘇紅.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]豬DLK1-DIO3印記域4個候選印記基因的分離及其單等位基因表達(dá)分析[D]. 楊宗林.西南大學(xué) 2009
本文編號:3059080
【文章來源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:130 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
印記的生命周期[48]
圖3 Igf2/m9和Igf2r/Airn印記調(diào)控原理Fig.3 Imprinted regulation of Igf2/H 19 and Igf2r/Airn loci1.3.5.2 Igf2r/Airn雖然不是進(jìn)化最古老的,但是在IgGr/Airn簇中ncRNA模式是一個通用機(jī)制,可能也是被描述的最完整的(見圖3b)。另外兩個確定的簇是IC2/Kcnql 簇和 Gnas 簇,可能 PWS/AS 和 DllcI/Dio3 也利用 ncRNA 模式,但是需要更多的研宄工作來確定ncRNA在這些印記基因簇中的作用"“〕。在ncRNA模式中,ICR內(nèi)的啟動子不同程度甲基化調(diào)控著ncRNA的表達(dá):當(dāng)ICR未甲基化,ncRNA表達(dá),順式連鎖基因被抑制,另一面,當(dāng)ICR甲基化,ncRNA被抑制,.順式連鎖基因表達(dá)。在丨gf2r/Airn簇中,ncRNAAim抑制IgfZr無處不在,Slc22a2和Slc22a3在胎盤。雖然這種抑制機(jī)制不清楚,一種假設(shè)認(rèn)為在胎盤中Airn與Slc22a3啟動子、H3K9組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶G9a相互作用導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄表觀遺傳沉默在鼠和人中,Igf2r/Airn簇的調(diào)控機(jī)制有些差異。在鼠中,IgfZr母系
內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文 1J_甲基化。當(dāng)母本中DMR2的DNA甲基化被維持,則不會激活H3K4的甲基化,在父本中也是DMR2,不過這促進(jìn)了 Airn轉(zhuǎn)錄的沉默[^。1.3.5.3 Dlkl-Dio3DLK1-D103簇通過DNA甲基化和核心組蛋白的尾部修飾來調(diào)控親本不同染色體的印記調(diào)控區(qū)域,而大多數(shù)研宄多是針對印記域內(nèi)的DNA甲基化和組蛋白修飾,并且己經(jīng)證明了,印記域ICR的DNA甲基化確實維持正確的基因組印記,而且ICR內(nèi)的microRNA也可能參與印記調(diào)控。(a) (b)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]1例轉(zhuǎn)基因體細(xì)胞克隆牛主要臟器的組織病理學(xué)觀察[J]. 袁蘇婭,姬麗娜,王勇勝,曾曉萍,卿素珠,張涌. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2013(01)
[2]1例轉(zhuǎn)基因克隆牛腦和免疫器官組織形態(tài)觀察報告[J]. 徐金霞,張羽,王勇勝,邊珍,卿素珠,張涌. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2012(06)
[3]克隆豬印跡基因IGF2/H19印跡控制區(qū)的甲基化狀態(tài)[J]. 吳志強(qiáng),謝一妮,張廷宇,戴建軍,吳彩鳳,馬恒東,張德福. 中國畜牧獸醫(yī). 2011(11)
[4]雞DLK1基因的生物信息學(xué)分析[J]. 閆曉紅,王寧. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2011(06)
[5]轉(zhuǎn)基因動物新技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 羅慶苗,苗向陽,張瑞杰. 遺傳. 2011(05)
[6]Non-coding RNAs and the acquisition of genomic imprinting in mammals[J]. ZHANG YiJun & QU LiangHu Key Laboratory of Gene Engineering of the Ministry of Education,State Key Laboratory for Biocontrol,Sun Yan-Sen University,Guangzhou 510275,China. Science in China(Series C:Life Sciences). 2009(03)
[7]一例體細(xì)胞克隆黃牛肺臟的組織結(jié)構(gòu)觀察[J]. 王曉麗,韋精衛(wèi),房慧伶,孟凡麗,辛立江,向長劍,石德順. 中國畜牧獸醫(yī). 2009(02)
[8]內(nèi)蒙古首例體細(xì)胞克隆牛2日齡死亡后的病理學(xué)觀察[J]. 顧玉芳,李善姬,吳素清. 長江大學(xué)學(xué)報(自科版)農(nóng)學(xué)卷. 2007(04)
[9]成年核移植山羊生長相關(guān)基因的表達(dá)分析(英文)[J]. 邢寶松,徐銀學(xué),成勇,劉紅林,杜淼. 遺傳學(xué)報. 2007(08)
[10]山羊卵核移植的研究[J]. 張涌,王建辰,錢菊汾,郝志明. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 1991(05)
博士論文
[1]乳腺特異表達(dá)嗜熱菌糖苷酶轉(zhuǎn)基因牛的研究[D]. 李璐.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]轉(zhuǎn)fat-1基因體細(xì)胞克隆綿羊的研究[D]. 張東.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]克隆豬印跡基因表達(dá)及其甲基化狀態(tài)研究[D]. 魏延昌.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[4]克隆綿羊印記相關(guān)基因的DNA甲基化研究[D]. 趙麗霞.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
碩士論文
[1]克隆豬部分組織病理學(xué)及生理生化指標(biāo)分析[D]. 陳會蘭.上海海洋大學(xué) 2012
[2]牛Gtl2基因的克隆及Dlk1-Gtl2印記區(qū)域在體細(xì)胞核移植牛中的DNA甲基化狀態(tài)分析[D]. 蘇紅.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]豬DLK1-DIO3印記域4個候選印記基因的分離及其單等位基因表達(dá)分析[D]. 楊宗林.西南大學(xué) 2009
本文編號:3059080
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3059080.html
最近更新
教材專著